More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10518 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  55.45 
 
 
959 aa  1077    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  59.11 
 
 
964 aa  1134    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  55.18 
 
 
957 aa  1024    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  57.42 
 
 
955 aa  1064    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  55.52 
 
 
958 aa  1070    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  58.1 
 
 
968 aa  1102    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  45.87 
 
 
945 aa  871    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  100 
 
 
968 aa  1969    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  60.26 
 
 
967 aa  1155    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  45.87 
 
 
945 aa  871    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  57.42 
 
 
955 aa  1064    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  58.1 
 
 
968 aa  1102    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  53.94 
 
 
963 aa  1015    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  58.3 
 
 
968 aa  1097    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  55.75 
 
 
968 aa  1088    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  59.4 
 
 
941 aa  1142    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  57.99 
 
 
968 aa  1103    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  56.63 
 
 
944 aa  1066    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  57.3 
 
 
962 aa  1076    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  59.13 
 
 
948 aa  1142    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  57.42 
 
 
955 aa  1064    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  56.23 
 
 
1001 aa  1083    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  58.1 
 
 
968 aa  1102    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  69.44 
 
 
397 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  30.89 
 
 
945 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  29.72 
 
 
1003 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  29.71 
 
 
1022 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  29.91 
 
 
1002 aa  393  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  29.71 
 
 
1022 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  29.39 
 
 
1040 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  29.51 
 
 
1000 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  28.54 
 
 
998 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  28.54 
 
 
998 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  28.44 
 
 
998 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  27.86 
 
 
1146 aa  350  6e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  28.08 
 
 
1001 aa  350  6e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  27.08 
 
 
1013 aa  336  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  27.73 
 
 
1077 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  27.71 
 
 
1062 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  27.71 
 
 
1062 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  22.52 
 
 
974 aa  233  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  31.4 
 
 
1011 aa  231  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  31.9 
 
 
1028 aa  229  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  31.93 
 
 
681 aa  227  9e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  31.42 
 
 
1013 aa  221  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  21.81 
 
 
981 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  28.69 
 
 
1089 aa  201  7.999999999999999e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  40.67 
 
 
470 aa  178  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12956  transmembrane transport protein mmpL7  23.13 
 
 
920 aa  165  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  28.19 
 
 
974 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  22.17 
 
 
1109 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  22.39 
 
 
1109 aa  130  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  26.4 
 
 
1041 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  26.09 
 
 
1038 aa  122  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  28.57 
 
 
713 aa  121  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  28.52 
 
 
1054 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  25.78 
 
 
1038 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  26.87 
 
 
888 aa  119  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  36.13 
 
 
745 aa  119  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  27.55 
 
 
1038 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  25.16 
 
 
1041 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  24.19 
 
 
1068 aa  117  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  33.33 
 
 
750 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  25.79 
 
 
1038 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  27.17 
 
 
1038 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  37.32 
 
 
700 aa  111  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  33.33 
 
 
747 aa  112  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  36.84 
 
 
576 aa  111  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  34.19 
 
 
712 aa  111  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  32.11 
 
 
702 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  32.3 
 
 
780 aa  108  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  33.68 
 
 
764 aa  108  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  37.04 
 
 
753 aa  108  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  32.3 
 
 
709 aa  108  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  28.47 
 
 
730 aa  108  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  37.98 
 
 
701 aa  107  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  34.7 
 
 
713 aa  106  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  34.29 
 
 
699 aa  106  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  25.77 
 
 
1040 aa  107  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  26.92 
 
 
1002 aa  107  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  34.12 
 
 
702 aa  105  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  30.9 
 
 
699 aa  105  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  32.57 
 
 
778 aa  105  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  30.27 
 
 
339 aa  104  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  23.94 
 
 
743 aa  104  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  23.54 
 
 
743 aa  104  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1580  hypothetical protein  33.12 
 
 
869 aa  103  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000620673 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  23.94 
 
 
743 aa  103  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  21.24 
 
 
1049 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  37.57 
 
 
673 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  31.44 
 
 
714 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.22 
 
 
697 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  23.71 
 
 
743 aa  102  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  23.71 
 
 
743 aa  102  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  34.51 
 
 
934 aa  101  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  27.27 
 
 
737 aa  101  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  33.49 
 
 
699 aa  101  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  21.97 
 
 
743 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  34.22 
 
 
733 aa  100  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  30 
 
 
860 aa  101  9e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>