More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0572 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  94.81 
 
 		 385 aa  747    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  778    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  97.92 
 
 		 385 aa  751    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  70.13 
 
 		 388 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  65.18 
 
 		 387 aa  502  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  53.6 
 
 		 380 aa  434  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  28.53 
 
 		 748 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  30.2 
 
 		 778 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  28.03 
 
 		 755 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  26.22 
 
 		 758 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  28.26 
 
 		 752 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  26.56 
 
 		 812 aa  135  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  28.11 
 
 		 752 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  25.2 
 
 		 777 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  26.06 
 
 		 764 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  25.75 
 
 		 747 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  26.89 
 
 		 746 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  28.49 
 
 		 756 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  24.75 
 
 		 1359 aa  123  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  25.54 
 
 		 777 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  27.67 
 
 		 855 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  26.39 
 
 		 862 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  24.17 
 
 		 861 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  23.36 
 
 		 1204 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  27.63 
 
 		 874 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  29.49 
 
 		 832 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  21.07 
 
 		 905 aa  103  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  21.74 
 
 		 864 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  23.17 
 
 		 845 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  25.36 
 
 		 821 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  23.98 
 
 		 895 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  25.06 
 
 		 791 aa  94.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  35.38 
 
 		 1109 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  22.08 
 
 		 773 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  30.27 
 
 		 1131 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  27.16 
 
 		 821 aa  91.3  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.75 
 
 		 837 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  31.18 
 
 		 923 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.68 
 
 		 808 aa  90.5  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  21.16 
 
 		 898 aa  90.1  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  30.77 
 
 		 1011 aa  90.1  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  33.15 
 
 		 872 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  33.8 
 
 		 899 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  28.29 
 
 		 859 aa  87.8  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  24.27 
 
 		 796 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  29.31 
 
 		 920 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  34.8 
 
 		 849 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  24.14 
 
 		 784 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  22.68 
 
 		 796 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  24.76 
 
 		 862 aa  83.2  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  21.21 
 
 		 687 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  22.87 
 
 		 835 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  24.26 
 
 		 695 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  27.8 
 
 		 967 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  27.76 
 
 		 820 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  31.03 
 
 		 1128 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  27.08 
 
 		 709 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  30.59 
 
 		 1013 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.39 
 
 		 803 aa  82.4  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  26.18 
 
 		 889 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.59 
 
 		 883 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  28.57 
 
 		 972 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  22.01 
 
 		 799 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  23.17 
 
 		 797 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  25.37 
 
 		 763 aa  81.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30 
 
 		 883 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  22.39 
 
 		 799 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  27.73 
 
 		 787 aa  80.9  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.34 
 
 		 778 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  22.01 
 
 		 799 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  28.99 
 
 		 784 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  32.32 
 
 		 842 aa  80.5  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  22.61 
 
 		 815 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  24.19 
 
 		 799 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  24.27 
 
 		 794 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  29.19 
 
 		 872 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  23.21 
 
 		 685 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  24.51 
 
 		 1022 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  22.67 
 
 		 787 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  30.61 
 
 		 839 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  24.51 
 
 		 1022 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  23.51 
 
 		 790 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  27.04 
 
 		 805 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  22.54 
 
 		 831 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  23.51 
 
 		 793 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.13 
 
 		 1051 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  22.36 
 
 		 816 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  34.69 
 
 		 795 aa  78.2  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  26.2 
 
 		 1062 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  26.2 
 
 		 1062 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  23.31 
 
 		 799 aa  77.4  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1909  hypothetical protein  28.69 
 
 		 692 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00515667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  22.38 
 
 		 1146 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  23.79 
 
 		 865 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  31.08 
 
 		 681 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  32.17 
 
 		 1028 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  30.41 
 
 		 1040 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  24.89 
 
 		 893 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  20.84 
 
 		 881 aa  76.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  27.45 
 
 		 674 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>