More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2275 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  54.78 
 
 		 748 aa  832    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  54.18 
 
 		 755 aa  787    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  100 
 
 		 812 aa  1641    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  44.53 
 
 		 778 aa  659    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  34.76 
 
 		 752 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  34.87 
 
 		 756 aa  464  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  33.73 
 
 		 758 aa  433  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  34.22 
 
 		 777 aa  427  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  32.72 
 
 		 752 aa  427  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  33.07 
 
 		 747 aa  424  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  33.12 
 
 		 777 aa  422  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  33.89 
 
 		 746 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  30.64 
 
 		 864 aa  333  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  28.98 
 
 		 687 aa  263  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  25.46 
 
 		 821 aa  254  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  27.08 
 
 		 889 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  25.99 
 
 		 865 aa  243  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  24.81 
 
 		 764 aa  171  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  28.16 
 
 		 921 aa  149  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  27.64 
 
 		 385 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  26.13 
 
 		 385 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  25.6 
 
 		 385 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  25.67 
 
 		 388 aa  137  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  28 
 
 		 380 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  25.41 
 
 		 1204 aa  129  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  26.02 
 
 		 895 aa  128  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.12 
 
 		 1051 aa  117  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  22.87 
 
 		 1359 aa  115  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  23.83 
 
 		 805 aa  114  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  25.4 
 
 		 1011 aa  112  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  27.08 
 
 		 387 aa  112  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  22.72 
 
 		 923 aa  110  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  24.03 
 
 		 874 aa  105  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  23.42 
 
 		 811 aa  105  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  25.43 
 
 		 862 aa  105  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  23.11 
 
 		 855 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  25.17 
 
 		 879 aa  99.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  24.34 
 
 		 1131 aa  100  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  20.96 
 
 		 767 aa  97.1  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  20.03 
 
 		 815 aa  96.3  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.76 
 
 		 778 aa  94.7  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.94 
 
 		 872 aa  93.6  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.15 
 
 		 755 aa  91.3  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.93 
 
 		 807 aa  90.9  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  24.07 
 
 		 789 aa  89.7  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  25.56 
 
 		 862 aa  89  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  20.27 
 
 		 835 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  22.67 
 
 		 800 aa  82.4  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  20.92 
 
 		 788 aa  82.4  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  29.21 
 
 		 1013 aa  82.8  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.52 
 
 		 803 aa  82  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.2 
 
 		 800 aa  81.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  23.24 
 
 		 861 aa  81.6  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  24.3 
 
 		 905 aa  80.1  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  20.63 
 
 		 821 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  24.14 
 
 		 1022 aa  77.4  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  24.14 
 
 		 1022 aa  77.4  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  19.23 
 
 		 788 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  20.13 
 
 		 779 aa  77  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  26.99 
 
 		 1011 aa  77.4  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.64 
 
 		 808 aa  77.4  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.46 
 
 		 807 aa  77.4  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  30.57 
 
 		 849 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  21.66 
 
 		 816 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  20.84 
 
 		 681 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  20.44 
 
 		 784 aa  76.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  25 
 
 		 1028 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  25 
 
 		 1040 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  25 
 
 		 974 aa  75.1  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  21.46 
 
 		 796 aa  73.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  22.33 
 
 		 898 aa  72.8  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  24.37 
 
 		 832 aa  73.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  25.54 
 
 		 972 aa  71.2  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  25.72 
 
 		 709 aa  70.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  21.29 
 
 		 792 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  30.53 
 
 		 713 aa  70.1  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  19.81 
 
 		 756 aa  69.7  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  28.68 
 
 		 1003 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  23.71 
 
 		 804 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  26.67 
 
 		 1013 aa  68.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  18.84 
 
 		 694 aa  68.9  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  19.67 
 
 		 684 aa  68.6  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  24.32 
 
 		 974 aa  68.2  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  32.28 
 
 		 845 aa  68.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  27.22 
 
 		 831 aa  67.8  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  19.54 
 
 		 825 aa  67.4  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  22.41 
 
 		 981 aa  67.4  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  18.47 
 
 		 804 aa  67.4  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  28.47 
 
 		 1109 aa  66.6  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  20.12 
 
 		 820 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  25.1 
 
 		 799 aa  66.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1083 aa  65.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  18.79 
 
 		 786 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  21.25 
 
 		 769 aa  65.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  19.82 
 
 		 815 aa  65.5  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  25.23 
 
 		 747 aa  65.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  25.27 
 
 		 812 aa  65.1  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  21.25 
 
 		 1062 aa  65.1  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  26.75 
 
 		 910 aa  65.1  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  21.25 
 
 		 1062 aa  65.1  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>