More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2575 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  55.62 
 
 
899 aa  875    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  54.34 
 
 
1128 aa  893    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  100 
 
 
886 aa  1766    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  55.05 
 
 
883 aa  867    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  52.15 
 
 
920 aa  864    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  55.16 
 
 
883 aa  865    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  62.16 
 
 
892 aa  1057    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  31.31 
 
 
890 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  31.12 
 
 
884 aa  345  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.89 
 
 
1045 aa  342  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  29.88 
 
 
893 aa  334  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  30.66 
 
 
910 aa  329  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  30.73 
 
 
901 aa  328  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  29.81 
 
 
972 aa  327  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.15 
 
 
887 aa  304  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  29 
 
 
901 aa  302  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  28.89 
 
 
889 aa  296  8e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.91 
 
 
871 aa  296  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  29.37 
 
 
871 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.49 
 
 
882 aa  293  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  28.98 
 
 
887 aa  292  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  28.25 
 
 
862 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.85 
 
 
868 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3246  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.71 
 
 
882 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.11 
 
 
882 aa  278  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  28.29 
 
 
872 aa  277  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.34 
 
 
882 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.65 
 
 
882 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.05 
 
 
864 aa  269  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  27.95 
 
 
862 aa  268  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1777  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.53 
 
 
900 aa  265  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2118  hypothetical protein  29.36 
 
 
879 aa  265  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  29.11 
 
 
908 aa  261  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  30.34 
 
 
767 aa  260  8e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.67 
 
 
870 aa  259  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.55 
 
 
895 aa  257  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  27.97 
 
 
868 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.92 
 
 
877 aa  243  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  28.97 
 
 
868 aa  241  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  28.72 
 
 
877 aa  240  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  28.04 
 
 
877 aa  237  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  28.16 
 
 
1083 aa  237  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  28.16 
 
 
969 aa  237  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.85 
 
 
669 aa  237  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  28.16 
 
 
1079 aa  237  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  28.04 
 
 
877 aa  237  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  28.04 
 
 
877 aa  237  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  27.93 
 
 
877 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  28.65 
 
 
877 aa  235  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  28.35 
 
 
877 aa  231  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5501  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.35 
 
 
877 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921684  normal  0.0209878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  27.68 
 
 
877 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  27.68 
 
 
877 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.79 
 
 
877 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1044  RND efflux transporter  28.73 
 
 
858 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  25.97 
 
 
906 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20740  hypothetical protein  28.25 
 
 
864 aa  214  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  27.71 
 
 
877 aa  214  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  27.35 
 
 
849 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  25.38 
 
 
845 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.46 
 
 
798 aa  113  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  22.74 
 
 
840 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  22.74 
 
 
846 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.06 
 
 
831 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4286  RND efflux transporter  22.63 
 
 
845 aa  98.2  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1695  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.79 
 
 
782 aa  94  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  20.86 
 
 
1226 aa  93.2  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  22.84 
 
 
861 aa  82  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  26.95 
 
 
839 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  21.36 
 
 
881 aa  79.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  31.31 
 
 
847 aa  77  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  23.37 
 
 
862 aa  76.6  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2150  exporter-like  22.6 
 
 
828 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2764  exporter-like protein  22.6 
 
 
829 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0195609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  22.11 
 
 
877 aa  74.3  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  23.3 
 
 
864 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  22.39 
 
 
800 aa  73.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4143  RND efflux transporter  22.64 
 
 
840 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  27.46 
 
 
843 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.23 
 
 
789 aa  72.8  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  22.68 
 
 
747 aa  72.8  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  28.99 
 
 
1359 aa  72.8  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.41 
 
 
1291 aa  71.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  25.21 
 
 
905 aa  70.9  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6094  MMPL family membrane protein  21.96 
 
 
823 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125086  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2816  exporter-like protein  22.85 
 
 
826 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249956  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  31.44 
 
 
1013 aa  70.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  24.12 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  28.37 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  28 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  31.52 
 
 
748 aa  68.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  29 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.32 
 
 
1109 aa  67.8  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  27.38 
 
 
1011 aa  67.8  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  20.85 
 
 
807 aa  67  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  20.72 
 
 
816 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  23.98 
 
 
826 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  25.16 
 
 
730 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  26.82 
 
 
764 aa  65.5  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  22.22 
 
 
695 aa  65.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>