267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0691 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  48.12 
 
 
879 aa  685    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  50.93 
 
 
842 aa  771    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  100 
 
 
805 aa  1603    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  43.16 
 
 
832 aa  595  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  42.84 
 
 
923 aa  587  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  33.18 
 
 
895 aa  430  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  34.01 
 
 
1011 aa  395  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  34.61 
 
 
1204 aa  389  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  33.95 
 
 
1131 aa  371  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  33.25 
 
 
1109 aa  353  8.999999999999999e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  31.73 
 
 
862 aa  325  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  31.33 
 
 
855 aa  323  9.000000000000001e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  31.46 
 
 
862 aa  308  3e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  31.59 
 
 
874 aa  308  3e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  31.29 
 
 
872 aa  308  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  27.95 
 
 
1359 aa  250  8e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  25.68 
 
 
860 aa  209  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.08 
 
 
746 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  22.66 
 
 
748 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.07 
 
 
764 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  24.45 
 
 
778 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  25.97 
 
 
752 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  22.03 
 
 
864 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.45 
 
 
756 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  23.68 
 
 
812 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  22.89 
 
 
777 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  23.68 
 
 
752 aa  110  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  25.16 
 
 
1051 aa  107  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.44 
 
 
758 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  21.71 
 
 
777 aa  106  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  24.53 
 
 
835 aa  98.6  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  23.98 
 
 
872 aa  94  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  27.21 
 
 
380 aa  92.4  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  19.42 
 
 
778 aa  92.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  23.08 
 
 
865 aa  88.6  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  23.77 
 
 
889 aa  85.9  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.24 
 
 
905 aa  85.5  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  25.25 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  22.47 
 
 
800 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  24.57 
 
 
385 aa  84  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  22.46 
 
 
694 aa  82.8  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  25.73 
 
 
898 aa  82.4  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  23.48 
 
 
687 aa  82.8  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  27.04 
 
 
385 aa  80.5  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.1 
 
 
807 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  23.07 
 
 
768 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  21.79 
 
 
813 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  27.04 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  20.92 
 
 
807 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  21.83 
 
 
756 aa  77  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  22.85 
 
 
849 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.34 
 
 
773 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  22.43 
 
 
789 aa  75.9  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  19.49 
 
 
727 aa  75.5  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  24.55 
 
 
869 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.8 
 
 
1045 aa  75.5  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  24.55 
 
 
869 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  22.69 
 
 
861 aa  75.1  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  21.46 
 
 
816 aa  73.9  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  22.59 
 
 
815 aa  73.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  24.7 
 
 
806 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  21.68 
 
 
796 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  22.89 
 
 
771 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  24.2 
 
 
792 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.05 
 
 
747 aa  68.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  29.14 
 
 
893 aa  67.4  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  21.27 
 
 
801 aa  67  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  21.14 
 
 
797 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  24.71 
 
 
755 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  23.56 
 
 
772 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  21.68 
 
 
796 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  20.97 
 
 
790 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  22.89 
 
 
771 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  22.89 
 
 
771 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  22.07 
 
 
895 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  21.29 
 
 
689 aa  65.5  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  22.01 
 
 
820 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  30.52 
 
 
890 aa  64.7  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  25.81 
 
 
825 aa  64.7  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  20.92 
 
 
799 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  25.08 
 
 
1013 aa  64.7  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  20.88 
 
 
799 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  31.85 
 
 
845 aa  64.7  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  21.06 
 
 
799 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  21.29 
 
 
793 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  22.07 
 
 
770 aa  63.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  26.7 
 
 
811 aa  63.9  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  20.71 
 
 
799 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  25.16 
 
 
755 aa  63.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  22.53 
 
 
771 aa  63.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  25.56 
 
 
804 aa  62.4  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  24.82 
 
 
803 aa  62.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  22.03 
 
 
771 aa  62.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  21.39 
 
 
834 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  28.09 
 
 
769 aa  62.4  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  24.07 
 
 
815 aa  62  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  26.72 
 
 
771 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  26.72 
 
 
771 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  26.72 
 
 
771 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  20.62 
 
 
799 aa  62  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>