161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0766 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  100 
 
 		 689 aa  1359    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  40.32 
 
 		 674 aa  476  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  40.03 
 
 		 674 aa  474  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1522  RND efflux transporter  41.22 
 
 		 669 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.707162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  24.42 
 
 		 694 aa  134  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  23.69 
 
 		 694 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.29 
 
 		 764 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  22.64 
 
 		 727 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  22.78 
 
 		 692 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  23.47 
 
 		 767 aa  106  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  28.51 
 
 		 905 aa  82.8  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  21.5 
 
 		 808 aa  79.7  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  24.21 
 
 		 861 aa  80.1  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  21.82 
 
 		 763 aa  78.2  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  29.31 
 
 		 898 aa  76.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  23.01 
 
 		 788 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  22.01 
 
 		 799 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  21.35 
 
 		 784 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  21.17 
 
 		 864 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  20.93 
 
 		 756 aa  69.7  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  22.49 
 
 		 821 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  22.05 
 
 		 793 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.09 
 
 		 807 aa  68.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  20.15 
 
 		 816 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  21.88 
 
 		 828 aa  67.8  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  25.25 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  26.58 
 
 		 779 aa  67.8  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.82 
 
 		 804 aa  67  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  21.81 
 
 		 778 aa  67.4  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  26.49 
 
 		 385 aa  67  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  26.74 
 
 		 388 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  25.95 
 
 		 385 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.3 
 
 		 773 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  23.46 
 
 		 807 aa  66.6  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  19.04 
 
 		 815 aa  65.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  31.15 
 
 		 862 aa  65.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  20.27 
 
 		 813 aa  64.3  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  31.79 
 
 		 1131 aa  63.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  19.8 
 
 		 860 aa  63.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  21.19 
 
 		 805 aa  62.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.78 
 
 		 967 aa  61.6  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  27.03 
 
 		 1204 aa  62  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  22.88 
 
 		 877 aa  60.5  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  27.85 
 
 		 855 aa  60.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  19.8 
 
 		 792 aa  60.1  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  21.24 
 
 		 1359 aa  59.7  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  20.93 
 
 		 784 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  21.31 
 
 		 764 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.64 
 
 		 803 aa  59.3  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  25 
 
 		 895 aa  59.3  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  20.94 
 
 		 865 aa  58.9  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  25.75 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  22.85 
 
 		 800 aa  57.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  20.16 
 
 		 795 aa  57.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  21.67 
 
 		 751 aa  57.8  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  30.41 
 
 		 1011 aa  57.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.2 
 
 		 789 aa  57.4  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  21.8 
 
 		 794 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  20.99 
 
 		 881 aa  57.4  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  20.24 
 
 		 825 aa  57.4  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  22.26 
 
 		 815 aa  57.4  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  27.61 
 
 		 806 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  20.82 
 
 		 787 aa  57  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  22.92 
 
 		 796 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  32 
 
 		 755 aa  57  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  25.84 
 
 		 748 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  24.4 
 
 		 1274 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  29.14 
 
 		 872 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  31.85 
 
 		 798 aa  55.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  22.68 
 
 		 796 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  19.04 
 
 		 804 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  23.67 
 
 		 821 aa  55.1  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  26.6 
 
 		 879 aa  54.7  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  19.78 
 
 		 835 aa  54.7  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2449  acriflavin resistance protein  24.92 
 
 		 1104 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.302925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  23.94 
 
 		 816 aa  54.7  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  22.29 
 
 		 799 aa  54.3  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  20 
 
 		 767 aa  54.3  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.41 
 
 		 717 aa  53.9  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  27.37 
 
 		 790 aa  53.9  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  21.11 
 
 		 889 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  24.73 
 
 		 812 aa  53.9  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  27.32 
 
 		 842 aa  53.9  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  21.82 
 
 		 797 aa  53.5  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.72 
 
 		 886 aa  53.9  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  24.46 
 
 		 387 aa  53.9  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  19.24 
 
 		 831 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  20.27 
 
 		 771 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  33.09 
 
 		 860 aa  53.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  23.75 
 
 		 797 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  25 
 
 		 792 aa  52.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  18.65 
 
 		 837 aa  52.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  22 
 
 		 799 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  25.64 
 
 		 779 aa  52  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2521  acriflavin resistance protein  24.45 
 
 		 1104 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225998  normal  0.0602775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  20.38 
 
 		 865 aa  51.6  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  23.03 
 
 		 799 aa  51.2  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  18.17 
 
 		 786 aa  51.2  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  21.29 
 
 		 874 aa  50.8  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2744  acriflavin resistance protein  24.45 
 
 		 1104 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>