More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2521 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01980  multidrug efflux system, subunit B  43.7 
 
 		 1040 aa  806    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01981  multidrug efflux system, subunit C  54.84 
 
 		 1025 aa  786    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1580  acriflavin resistance protein  54.84 
 
 		 1025 aa  786    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0262852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1581  acriflavin resistance protein  43.8 
 
 		 1040 aa  807    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132425  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2521  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1104 aa  2201    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225998  normal  0.0602775 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2686  multidrug efflux system subunit MdtC  54.84 
 
 		 1025 aa  791    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3583  acriflavin resistance protein  48.23 
 
 		 1035 aa  964    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2368  multidrug efflux system subunit MdtC  54.97 
 
 		 1025 aa  790    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03142  drug efflux pump transmembrane protein  45.06 
 
 		 1041 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  60.33 
 
 		 1033 aa  922    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4317  acriflavin resistance protein  75.84 
 
 		 1156 aa  1667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.463113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2418  acriflavin resistance protein  57.21 
 
 		 1099 aa  1152    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2755  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.86 
 
 		 1035 aa  753    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2258  acriflavin resistance protein  50.18 
 
 		 1053 aa  986    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal  0.166006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2257  acriflavin resistance protein  43.91 
 
 		 1043 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2483  acriflavin resistance protein  45.34 
 
 		 1036 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.137837  normal  0.300491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2484  acriflavin resistance protein  48.63 
 
 		 1035 aa  743    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1565  multidrug efflux system subunit MdtC  54.84 
 
 		 1025 aa  786    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.9011  normal  0.896126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3536  putative component of multidrug efflux pump, mdtB-like protein  48.08 
 
 		 1048 aa  736    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0571  acriflavin resistance protein  43.77 
 
 		 1046 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2367  multidrug efflux system subunit MdtB  43.61 
 
 		 1040 aa  805    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2709  RND efflux transporter  45.47 
 
 		 1043 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  44.4 
 
 		 1035 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1265  acriflavin resistance protein  49.52 
 
 		 1044 aa  724    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1521  acriflavin resistance protein  47.14 
 
 		 1032 aa  649    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0510494  normal  0.0716903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1522  acriflavin resistance protein  45.66 
 
 		 1040 aa  648    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1499  multidrug resistance protein mdtC  65.27 
 
 		 1100 aa  1300    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0985  multidrug efflux system subunit MdtB  43.7 
 
 		 1040 aa  806    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.442979 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3102  multidrug efflux system subunit MdtB  45.25 
 
 		 1052 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2522  acriflavin resistance protein  45.95 
 
 		 1034 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984252  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2523  acriflavin resistance protein  50.51 
 
 		 1035 aa  767    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1331  multidrug efflux system subunit MdtB  45.25 
 
 		 1052 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2218  multidrug efflux system subunit MdtC  54.84 
 
 		 1025 aa  785    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4304  acriflavin resistance protein  65.18 
 
 		 1102 aa  1351    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123043  normal  0.121863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1597  acriflavin resistance protein  50.38 
 
 		 1044 aa  754    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2331  acriflavin resistance protein  48.05 
 
 		 1035 aa  965    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0100478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2429  acriflavin resistance protein  50.32 
 
 		 1034 aa  701    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.618846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3934  multidrug ABC transporter  47.01 
 
 		 1035 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.962709 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3307  acriflavin resistance protein  53.05 
 
 		 1069 aa  1127    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0984  multidrug efflux system subunit MdtC  55.1 
 
 		 1025 aa  790    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.352298 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2868  AcrB/AcrD/AcrF family protein  64.5 
 
 		 1100 aa  1305    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818421  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1213  multidrug efflux system subunit MdtC  56.39 
 
 		 1024 aa  835    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286734  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2800  acriflavin resistance protein  47.67 
 
 		 1035 aa  735    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2900  acriflavin resistance protein  45.95 
 
 		 1037 aa  889    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0921711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2801  acriflavin resistance protein  45.7 
 
 		 1032 aa  668    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0747979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4167  acriflavin resistance protein  48.15 
 
 		 1035 aa  674    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0134  acriflavin resistance protein  46.66 
 
 		 1065 aa  882    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1367  multidrug resistance protein MdtC  65.27 
 
 		 1100 aa  1300    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  45.59 
 
 		 1041 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3251  acriflavin resistance protein  42.18 
 
 		 1053 aa  741    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272492  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2560  acriflavin resistance protein  46.44 
 
 		 1034 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478642  normal  0.875545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0743  acriflavin resistance protein  45.51 
 
 		 1044 aa  859    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0744  acriflavin resistance protein  50.19 
 
 		 1051 aa  730    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.842453 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1330  multidrug efflux system subunit MdtC  56.39 
 
 		 1024 aa  835    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2187  acriflavin resistance protein  45.95 
 
 		 1032 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2828  acriflavin resistance protein  55.7 
 
 		 1107 aa  1172    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376428  normal  0.152401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2520  acriflavin resistance protein  46.17 
 
 		 1045 aa  659    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0450532  normal  0.025752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2909  multidrug efflux system protein  65.64 
 
 		 1103 aa  1329    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4168  acriflavin resistance protein  59.24 
 
 		 1091 aa  1196    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0885638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2010  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  56.64 
 
 		 1106 aa  1109    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2685  multidrug efflux system subunit MdtB  43.25 
 
 		 1040 aa  823    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2570  acriflavin resistance protein  45.48 
 
 		 1041 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0830521 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1233  acriflavin resistance protein  53.2 
 
 		 1043 aa  798    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  45.47 
 
 		 1042 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2855  acriflavin resistance protein  46.68 
 
 		 1054 aa  869    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.427735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2710  RND efflux transporter  53.69 
 
 		 1036 aa  792    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1509  acriflavin resistance protein  50.06 
 
 		 1048 aa  747    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1170  acriflavin resistance protein  64.85 
 
 		 1102 aa  1342    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273811  normal  0.0444118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2064  acriflavin resistance protein  45.21 
 
 		 1042 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.730897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3602  acriflavin resistance protein  61.95 
 
 		 1096 aa  1284    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2330  acriflavin resistance protein  46.08 
 
 		 1032 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0512  acriflavin resistance protein  52.13 
 
 		 1100 aa  805    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0513  acriflavin resistance protein  44.02 
 
 		 1051 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0135048  normal  0.800803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0600  acriflavin resistance protein  47.53 
 
 		 1066 aa  683    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654802  normal  0.436006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4318  acriflavin resistance protein  45.28 
 
 		 1041 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.329827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2830  acriflavin resistance protein  48.92 
 
 		 1092 aa  967    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2831  acriflavin resistance protein  53.85 
 
 		 1032 aa  783    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0717  acriflavin resistance protein  64.94 
 
 		 1102 aa  1340    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2106  acriflavin resistance protein  65.21 
 
 		 1102 aa  1315    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1362  multidrug resistance protein MdtC  65.27 
 
 		 1100 aa  1300    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2288  acriflavin resistance protein  52.36 
 
 		 1089 aa  975    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0721362  normal  0.38307 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1078  acriflavin resistance protein  64.94 
 
 		 1102 aa  1327    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.955454  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2217  multidrug efflux system subunit MdtB  43.8 
 
 		 1040 aa  806    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31890  putative RND efflux transporter  45.34 
 
 		 1043 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31900  putative efflux transporter  53.69 
 
 		 1036 aa  791    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1214  multidrug efflux system subunit MdtB  45.25 
 
 		 1052 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.243575  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1196  acriflavin resistance protein  65.03 
 
 		 1102 aa  1341    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.458181  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3101  multidrug efflux system subunit MdtC  56.7 
 
 		 1024 aa  837    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0416497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  44.5 
 
 		 1055 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2095  acriflavin resistance protein  49.74 
 
 		 1053 aa  719    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238073  normal  0.0214179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2203  acriflavin resistance protein  46.95 
 
 		 1029 aa  685    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2204  acriflavin resistance protein  56.54 
 
 		 1036 aa  815    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2188  acriflavin resistance protein  48.23 
 
 		 1035 aa  966    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  46.75 
 
 		 1041 aa  645    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2430  acriflavin resistance protein  45.28 
 
 		 1030 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157087  normal  0.957896 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2040  acriflavin resistance protein  53.34 
 
 		 1070 aa  1050    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1566  multidrug efflux system subunit MdtB  43.8 
 
 		 1040 aa  807    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2593  acriflavin resistance protein  54 
 
 		 1072 aa  1147    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3554  multidrug efflux system subunit MdtC  56.06 
 
 		 1026 aa  845    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0345  acriflavin resistance protein  45.19 
 
 		 1051 aa  691    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>