More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2686 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01980  multidrug efflux system, subunit B  48.83 
 
 
1040 aa  904    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01981  multidrug efflux system, subunit C  91.61 
 
 
1025 aa  1876    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1580  acriflavin resistance protein  91.51 
 
 
1025 aa  1873    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0262852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1581  acriflavin resistance protein  48.93 
 
 
1040 aa  907    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.38 
 
 
1032 aa  879    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2584  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.61 
 
 
1048 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3583  acriflavin resistance protein  54.16 
 
 
1035 aa  1071    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268046  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2429  acriflavin resistance protein  58.24 
 
 
1034 aa  1126    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.618846 
 
 
-
 
NC_003296  RS03142  drug efflux pump transmembrane protein  49.32 
 
 
1041 aa  957    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  64.26 
 
 
1033 aa  1306    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1335  putative RND efflux transporter  45.68 
 
 
1028 aa  832    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.14004  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1368  multidrug resistance protein MdtB  48.39 
 
 
1036 aa  914    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.73 
 
 
1034 aa  861    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.582807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2755  AcrB/AcrD/AcrF family protein  55.41 
 
 
1035 aa  1101    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1644  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.61 
 
 
1048 aa  874    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0374438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1128  acriflavin resistance protein  47.02 
 
 
1034 aa  860    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0555006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2483  acriflavin resistance protein  48.98 
 
 
1036 aa  901    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.137837  normal  0.300491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2484  acriflavin resistance protein  55.44 
 
 
1035 aa  1098    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  45.08 
 
 
1029 aa  866    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0570  acriflavin resistance protein  62.95 
 
 
1103 aa  974    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.231767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0571  acriflavin resistance protein  48.92 
 
 
1046 aa  926    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3425  acriflavin resistance protein  44.52 
 
 
1065 aa  858    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2319  RND efflux transporter  41.57 
 
 
1023 aa  704    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1265  acriflavin resistance protein  51.02 
 
 
1044 aa  929    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.192962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1521  acriflavin resistance protein  50.1 
 
 
1032 aa  966    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0510494  normal  0.0716903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1522  acriflavin resistance protein  49.8 
 
 
1040 aa  924    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1499  multidrug resistance protein mdtC  58.27 
 
 
1100 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1500  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.43 
 
 
1036 aa  915    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2671  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.71 
 
 
1048 aa  879    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2522  acriflavin resistance protein  50.15 
 
 
1034 aa  942    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984252  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2523  acriflavin resistance protein  55.86 
 
 
1035 aa  1125    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4662  acriflavin resistance protein  46.63 
 
 
1033 aa  871    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.545759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4304  acriflavin resistance protein  58.4 
 
 
1102 aa  905    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123043  normal  0.121863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4305  acriflavin resistance protein  48.88 
 
 
1037 aa  901    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0526146  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  45.78 
 
 
1037 aa  877    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1970  acriflavin resistance protein  46.4 
 
 
1029 aa  851    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1950  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48 
 
 
1048 aa  890    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2867  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.14 
 
 
1036 aa  910    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2868  AcrB/AcrD/AcrF family protein  58.27 
 
 
1100 aa  884    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818421  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2022  acriflavin resistance protein  43.42 
 
 
1041 aa  768    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  44.63 
 
 
1042 aa  884    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2900  acriflavin resistance protein  49.66 
 
 
1037 aa  943    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0921711  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2901  acriflavin resistance protein  50.2 
 
 
1038 aa  932    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0661735  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0379  acriflavin resistance protein  45.39 
 
 
1024 aa  835    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  45.81 
 
 
1041 aa  911    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2559  acriflavin resistance protein  49.31 
 
 
1042 aa  907    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108247  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2560  acriflavin resistance protein  49.07 
 
 
1034 aa  959    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478642  normal  0.875545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0743  acriflavin resistance protein  48 
 
 
1044 aa  906    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0744  acriflavin resistance protein  57.17 
 
 
1051 aa  1074    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.842453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2827  acriflavin resistance protein  45.48 
 
 
1052 aa  802    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.68497  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2828  acriflavin resistance protein  53.9 
 
 
1107 aa  1111    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376428  normal  0.152401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2908  multidrug efflux system protein  48.44 
 
 
1040 aa  884    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442487  normal  0.66419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2909  multidrug efflux system protein  59.14 
 
 
1103 aa  927    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2009  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  44.38 
 
 
1041 aa  816    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0269291  normal  0.0260573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2010  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  51.47 
 
 
1106 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3169  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.61 
 
 
1048 aa  872    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0164478  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2570  acriflavin resistance protein  49.61 
 
 
1041 aa  927    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0830521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2571  acriflavin resistance protein  49.56 
 
 
1037 aa  922    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0468972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  44.92 
 
 
1042 aa  910    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1511  acriflavin resistance protein  52.33 
 
 
1037 aa  971    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1512  acriflavin resistance protein  46.29 
 
 
1042 aa  823    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.901552  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1509  acriflavin resistance protein  50.2 
 
 
1048 aa  961    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2063  acriflavin resistance protein  49.26 
 
 
1032 aa  946    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2064  acriflavin resistance protein  49.31 
 
 
1042 aa  924    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.730897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3602  acriflavin resistance protein  57.1 
 
 
1096 aa  1153    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3603  acriflavin resistance protein  49.32 
 
 
1037 aa  916    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0448996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0512  acriflavin resistance protein  62.98 
 
 
1100 aa  971    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196913  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0513  acriflavin resistance protein  49.32 
 
 
1051 aa  938    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0135048  normal  0.800803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0600  acriflavin resistance protein  49.66 
 
 
1066 aa  930    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654802  normal  0.436006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3582  acriflavin resistance protein  43.97 
 
 
1069 aa  853    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2830  acriflavin resistance protein  47.48 
 
 
1092 aa  932    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2831  acriflavin resistance protein  56.37 
 
 
1032 aa  1085    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0717  acriflavin resistance protein  57.36 
 
 
1102 aa  897    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0718  acriflavin resistance protein  48.63 
 
 
1039 aa  910    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.61 
 
 
1048 aa  874    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2288  acriflavin resistance protein  52.54 
 
 
1089 aa  929    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0721362  normal  0.38307 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2686  multidrug efflux system subunit MdtC  100 
 
 
1025 aa  2074    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508411  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2531  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.71 
 
 
1048 aa  877    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1363  multidrug resistance protein MdtB  48.48 
 
 
1036 aa  915    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387551  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1362  multidrug resistance protein MdtC  58.27 
 
 
1100 aa  880    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1078  acriflavin resistance protein  57.7 
 
 
1102 aa  894    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.955454  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1079  acriflavin resistance protein  48.52 
 
 
1039 aa  906    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31890  putative RND efflux transporter  50.34 
 
 
1043 aa  955    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910827  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31900  putative efflux transporter  61.2 
 
 
1036 aa  1163    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329836  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45890  putative RND efflux transporter  48.94 
 
 
1036 aa  900    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.961343 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1196  acriflavin resistance protein  57.49 
 
 
1102 aa  898    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.458181  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1197  acriflavin resistance protein  48.63 
 
 
1039 aa  910    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  47.33 
 
 
1055 aa  915    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1367  multidrug resistance protein MdtC  58.27 
 
 
1100 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2203  acriflavin resistance protein  50.19 
 
 
1029 aa  939    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2204  acriflavin resistance protein  59.39 
 
 
1036 aa  1134    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2685  multidrug efflux system subunit MdtB  47.47 
 
 
1040 aa  935    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1026  acriflavin resistance protein  44.06 
 
 
1032 aa  828    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  47.48 
 
 
1041 aa  894    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1233  acriflavin resistance protein  55.1 
 
 
1043 aa  1082    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2040  acriflavin resistance protein  54.71 
 
 
1070 aa  1018    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234661  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2592  acriflavin resistance protein  44.11 
 
 
1108 aa  818    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.616304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2593  acriflavin resistance protein  55.77 
 
 
1072 aa  1122    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392078  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2145  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.61 
 
 
1048 aa  874    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.536412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0345  acriflavin resistance protein  50.24 
 
 
1051 aa  976    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>