More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2958 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01980  multidrug efflux system, subunit B  47.64 
 
 
1040 aa  904    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01981  multidrug efflux system, subunit C  46.06 
 
 
1025 aa  868    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1580  acriflavin resistance protein  46.06 
 
 
1025 aa  868    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0262852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1581  acriflavin resistance protein  47.74 
 
 
1040 aa  905    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  60.43 
 
 
1032 aa  1228    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.98 
 
 
1048 aa  868    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3583  acriflavin resistance protein  42.82 
 
 
1035 aa  801    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268046  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2429  acriflavin resistance protein  44.07 
 
 
1034 aa  806    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.618846 
 
 
-
 
NC_003296  RS03142  drug efflux pump transmembrane protein  48.98 
 
 
1041 aa  964    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  49.9 
 
 
1033 aa  957    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0134  acriflavin resistance protein  44.9 
 
 
1065 aa  886    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.76 
 
 
1034 aa  891    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.582807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2755  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.38 
 
 
1035 aa  813    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1644  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.98 
 
 
1048 aa  868    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0374438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1128  acriflavin resistance protein  46.76 
 
 
1034 aa  886    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0555006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2483  acriflavin resistance protein  46.86 
 
 
1036 aa  882    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.137837  normal  0.300491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2484  acriflavin resistance protein  43.37 
 
 
1035 aa  814    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1029 aa  2066    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0570  acriflavin resistance protein  48.71 
 
 
1103 aa  722    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.231767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0571  acriflavin resistance protein  48.87 
 
 
1046 aa  923    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3425  acriflavin resistance protein  51.2 
 
 
1065 aa  1009    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2319  RND efflux transporter  45.96 
 
 
1023 aa  827    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1265  acriflavin resistance protein  49.46 
 
 
1044 aa  932    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.192962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1521  acriflavin resistance protein  45.44 
 
 
1032 aa  882    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0510494  normal  0.0716903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1522  acriflavin resistance protein  47.89 
 
 
1040 aa  923    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1233  acriflavin resistance protein  48.74 
 
 
1043 aa  937    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1500  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.34 
 
 
1036 aa  894    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2671  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.28 
 
 
1048 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2522  acriflavin resistance protein  48.04 
 
 
1034 aa  913    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984252  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2523  acriflavin resistance protein  43.06 
 
 
1035 aa  816    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4662  acriflavin resistance protein  46.51 
 
 
1033 aa  895    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.545759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4304  acriflavin resistance protein  44.09 
 
 
1102 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123043  normal  0.121863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4305  acriflavin resistance protein  46.93 
 
 
1037 aa  875    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0526146  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  59.14 
 
 
1037 aa  1215    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1335  putative RND efflux transporter  52.29 
 
 
1028 aa  965    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.14004  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1970  acriflavin resistance protein  50.68 
 
 
1029 aa  990    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1368  multidrug resistance protein MdtB  46.02 
 
 
1036 aa  894    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1950  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.8 
 
 
1048 aa  887    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2867  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.44 
 
 
1036 aa  894    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0133  acriflavin resistance protein  41.86 
 
 
1030 aa  766    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2022  acriflavin resistance protein  57.37 
 
 
1041 aa  1110    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  55.26 
 
 
1042 aa  1112    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2900  acriflavin resistance protein  44.73 
 
 
1037 aa  847    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0921711  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2901  acriflavin resistance protein  49.07 
 
 
1038 aa  939    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0661735  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0379  acriflavin resistance protein  50.78 
 
 
1024 aa  942    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  53.9 
 
 
1041 aa  1102    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2559  acriflavin resistance protein  49.17 
 
 
1042 aa  926    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108247  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2560  acriflavin resistance protein  43.1 
 
 
1034 aa  839    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478642  normal  0.875545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0743  acriflavin resistance protein  45.61 
 
 
1044 aa  862    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0744  acriflavin resistance protein  43.35 
 
 
1051 aa  764    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.842453 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2531  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.18 
 
 
1048 aa  873    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2827  acriflavin resistance protein  44.54 
 
 
1052 aa  798    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.68497  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2430  acriflavin resistance protein  49.31 
 
 
1030 aa  954    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157087  normal  0.957896 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2908  multidrug efflux system protein  47.83 
 
 
1040 aa  877    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442487  normal  0.66419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2909  multidrug efflux system protein  44.47 
 
 
1103 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2009  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  44.39 
 
 
1041 aa  845    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0269291  normal  0.0260573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2010  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  40.48 
 
 
1106 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2570  acriflavin resistance protein  49.27 
 
 
1041 aa  956    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0830521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2571  acriflavin resistance protein  44.24 
 
 
1037 aa  823    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0468972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  55.26 
 
 
1042 aa  1135    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1511  acriflavin resistance protein  42.31 
 
 
1037 aa  771    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1512  acriflavin resistance protein  44.3 
 
 
1042 aa  815    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.901552  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1509  acriflavin resistance protein  49.16 
 
 
1048 aa  965    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2063  acriflavin resistance protein  45.14 
 
 
1032 aa  877    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2064  acriflavin resistance protein  48.25 
 
 
1042 aa  930    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.730897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3602  acriflavin resistance protein  44.11 
 
 
1096 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3603  acriflavin resistance protein  47.53 
 
 
1037 aa  900    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0448996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0512  acriflavin resistance protein  46.61 
 
 
1100 aa  916    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196913  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0513  acriflavin resistance protein  48.43 
 
 
1051 aa  928    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0135048  normal  0.800803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0600  acriflavin resistance protein  49.95 
 
 
1066 aa  944    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654802  normal  0.436006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3582  acriflavin resistance protein  50.72 
 
 
1069 aa  1001    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2830  acriflavin resistance protein  46.71 
 
 
1092 aa  931    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2831  acriflavin resistance protein  48.03 
 
 
1032 aa  913    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0717  acriflavin resistance protein  44.34 
 
 
1102 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0718  acriflavin resistance protein  46.63 
 
 
1039 aa  883    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3169  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.98 
 
 
1048 aa  866    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0164478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1363  multidrug resistance protein MdtB  46.15 
 
 
1036 aa  891    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2584  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.28 
 
 
1048 aa  874    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1026  acriflavin resistance protein  48.43 
 
 
1032 aa  949    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2288  acriflavin resistance protein  41.3 
 
 
1089 aa  702    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0721362  normal  0.38307 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2685  multidrug efflux system subunit MdtB  46.95 
 
 
1040 aa  912    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1078  acriflavin resistance protein  44.1 
 
 
1102 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.955454  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1079  acriflavin resistance protein  46.15 
 
 
1039 aa  872    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31890  putative RND efflux transporter  48.92 
 
 
1043 aa  952    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910827  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31900  putative efflux transporter  46.24 
 
 
1036 aa  839    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329836  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45890  putative RND efflux transporter  45.74 
 
 
1036 aa  882    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.961343 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1196  acriflavin resistance protein  44.47 
 
 
1102 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.458181  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1197  acriflavin resistance protein  46.63 
 
 
1039 aa  883    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  62.02 
 
 
1055 aa  1295    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  60.67 
 
 
1032 aa  1255    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2287  acriflavin resistance protein  45.9 
 
 
1026 aa  806    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362502  normal  0.921003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2203  acriflavin resistance protein  49.56 
 
 
1029 aa  941    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2204  acriflavin resistance protein  49.7 
 
 
1036 aa  947    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  62.43 
 
 
1035 aa  1293    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  60.08 
 
 
1041 aa  1192    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2686  multidrug efflux system subunit MdtC  45.08 
 
 
1025 aa  859    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508411  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2040  acriflavin resistance protein  40.9 
 
 
1070 aa  761    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234661  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2592  acriflavin resistance protein  43.46 
 
 
1108 aa  796    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.616304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2593  acriflavin resistance protein  40.76 
 
 
1072 aa  803    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392078  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2145  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.98 
 
 
1048 aa  868    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.536412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>