More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3602 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01980  multidrug efflux system, subunit B  45.99 
 
 		 1040 aa  672    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01981  multidrug efflux system, subunit C  57.02 
 
 		 1025 aa  1150    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1580  acriflavin resistance protein  57.02 
 
 		 1025 aa  1150    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0262852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1581  acriflavin resistance protein  46.12 
 
 		 1040 aa  674    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.95 
 
 		 1032 aa  884    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2685  multidrug efflux system subunit MdtB  46.6 
 
 		 1040 aa  914    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3583  acriflavin resistance protein  48.81 
 
 		 1035 aa  969    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2430  acriflavin resistance protein  49.02 
 
 		 1030 aa  948    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157087  normal  0.957896 
 
 
-
 
NC_003296  RS03142  drug efflux pump transmembrane protein  47.71 
 
 		 1041 aa  920    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  66.32 
 
 		 1033 aa  1038    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1026  acriflavin resistance protein  41.41 
 
 		 1032 aa  800    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.2 
 
 		 1034 aa  863    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.582807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2755  AcrB/AcrD/AcrF family protein  50.83 
 
 		 1035 aa  1003    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2710  RND efflux transporter  53.42 
 
 		 1036 aa  1037    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1128  acriflavin resistance protein  44.88 
 
 		 1034 aa  852    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0555006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2483  acriflavin resistance protein  46.92 
 
 		 1036 aa  687    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.137837  normal  0.300491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2484  acriflavin resistance protein  50.69 
 
 		 1035 aa  1012    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  44.28 
 
 		 1029 aa  852    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0570  acriflavin resistance protein  58.55 
 
 		 1103 aa  925    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.231767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0571  acriflavin resistance protein  46.94 
 
 		 1046 aa  914    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1363  multidrug resistance protein MdtB  46.81 
 
 		 1036 aa  898    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387551  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3425  acriflavin resistance protein  39.28 
 
 		 1065 aa  688    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2319  RND efflux transporter  42.39 
 
 		 1023 aa  729    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1265  acriflavin resistance protein  50.46 
 
 		 1044 aa  991    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1521  acriflavin resistance protein  47.17 
 
 		 1032 aa  669    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0510494  normal  0.0716903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1522  acriflavin resistance protein  47.93 
 
 		 1040 aa  934    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1499  multidrug resistance protein mdtC  66.64 
 
 		 1100 aa  1321    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1500  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.9 
 
 		 1036 aa  901    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2709  RND efflux transporter  47.63 
 
 		 1043 aa  704    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2522  acriflavin resistance protein  47.34 
 
 		 1034 aa  907    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984252  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2523  acriflavin resistance protein  53.73 
 
 		 1035 aa  822    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4662  acriflavin resistance protein  44.85 
 
 		 1033 aa  849    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4304  acriflavin resistance protein  66.94 
 
 		 1102 aa  1383    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123043  normal  0.121863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4305  acriflavin resistance protein  46.29 
 
 		 1037 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0526146  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  44.26 
 
 		 1037 aa  884    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3933  multidrug resistance protein mdtB  48.56 
 
 		 1042 aa  917    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.906804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1335  putative RND efflux transporter  42.12 
 
 		 1028 aa  735    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.14004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  42.75 
 
 		 1032 aa  831    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1950  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.54 
 
 		 1048 aa  861    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2867  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.63 
 
 		 1036 aa  893    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2868  AcrB/AcrD/AcrF family protein  66.67 
 
 		 1100 aa  1334    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3536  putative component of multidrug efflux pump, mdtB-like protein  46.3 
 
 		 1048 aa  950    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  43.93 
 
 		 1042 aa  858    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2900  acriflavin resistance protein  45.85 
 
 		 1037 aa  891    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0921711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2901  acriflavin resistance protein  48.2 
 
 		 1038 aa  920    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0661735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0134  acriflavin resistance protein  49.5 
 
 		 1065 aa  964    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1362  multidrug resistance protein MdtC  66.64 
 
 		 1100 aa  1321    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  44.27 
 
 		 1041 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2559  acriflavin resistance protein  47.37 
 
 		 1042 aa  904    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2560  acriflavin resistance protein  44.99 
 
 		 1034 aa  851    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478642  normal  0.875545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0743  acriflavin resistance protein  46.98 
 
 		 1044 aa  905    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0744  acriflavin resistance protein  51.47 
 
 		 1051 aa  748    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.842453 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1367  multidrug resistance protein MdtC  66.64 
 
 		 1100 aa  1321    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2827  acriflavin resistance protein  44.06 
 
 		 1052 aa  785    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.68497  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2828  acriflavin resistance protein  56.13 
 
 		 1107 aa  1190    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376428  normal  0.152401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2908  multidrug efflux system protein  47.88 
 
 		 1040 aa  885    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442487  normal  0.66419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2909  multidrug efflux system protein  67.6 
 
 		 1103 aa  1390    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2009  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  45.54 
 
 		 1041 aa  868    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0269291  normal  0.0260573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2010  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  55.39 
 
 		 1106 aa  1080    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2570  acriflavin resistance protein  46.73 
 
 		 1041 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0830521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2571  acriflavin resistance protein  46.21 
 
 		 1037 aa  877    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0468972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  44.24 
 
 		 1042 aa  899    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1511  acriflavin resistance protein  47.09 
 
 		 1037 aa  869    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1233  acriflavin resistance protein  53.35 
 
 		 1043 aa  1085    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1509  acriflavin resistance protein  49.95 
 
 		 1048 aa  1031    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2063  acriflavin resistance protein  45.63 
 
 		 1032 aa  658    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2064  acriflavin resistance protein  47.17 
 
 		 1042 aa  924    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.730897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3602  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1096 aa  2197    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3603  acriflavin resistance protein  47.58 
 
 		 1037 aa  863    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0448996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0512  acriflavin resistance protein  62.69 
 
 		 1100 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0513  acriflavin resistance protein  47.57 
 
 		 1051 aa  914    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0135048  normal  0.800803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0600  acriflavin resistance protein  47.66 
 
 		 1066 aa  704    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654802  normal  0.436006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  45.44 
 
 		 1035 aa  922    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2830  acriflavin resistance protein  49.77 
 
 		 1092 aa  1013    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2831  acriflavin resistance protein  55.19 
 
 		 1032 aa  1125    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0717  acriflavin resistance protein  66.48 
 
 		 1102 aa  1372    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0718  acriflavin resistance protein  45.91 
 
 		 1039 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3934  multidrug ABC transporter  46.86 
 
 		 1035 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.962709 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0765  putative multidrug efflux protein  41.42 
 
 		 1026 aa  708    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1078  acriflavin resistance protein  67.21 
 
 		 1102 aa  1377    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.955454  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1079  acriflavin resistance protein  45.76 
 
 		 1039 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31890  putative RND efflux transporter  47.75 
 
 		 1043 aa  708    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31900  putative efflux transporter  53.52 
 
 		 1036 aa  1038    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45890  putative RND efflux transporter  46.26 
 
 		 1036 aa  857    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.961343 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1196  acriflavin resistance protein  66.58 
 
 		 1102 aa  1373    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.458181  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1197  acriflavin resistance protein  45.91 
 
 		 1039 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  46.08 
 
 		 1055 aa  948    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2203  acriflavin resistance protein  49.94 
 
 		 1029 aa  742    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2204  acriflavin resistance protein  61.47 
 
 		 1036 aa  914    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1368  multidrug resistance protein MdtB  46.81 
 
 		 1036 aa  901    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2686  multidrug efflux system subunit MdtC  57.29 
 
 		 1025 aa  1149    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  45.81 
 
 		 1041 aa  888    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2429  acriflavin resistance protein  51.57 
 
 		 1034 aa  990    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.618846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2040  acriflavin resistance protein  56.11 
 
 		 1070 aa  1102    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2592  acriflavin resistance protein  43.92 
 
 		 1108 aa  802    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.616304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2593  acriflavin resistance protein  57.19 
 
 		 1072 aa  1210    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2188  acriflavin resistance protein  48.63 
 
 		 1035 aa  966    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0345  acriflavin resistance protein  48.54 
 
 		 1051 aa  754    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2287  acriflavin resistance protein  43.98 
 
 		 1026 aa  784    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362502  normal  0.921003 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2288  acriflavin resistance protein  54.6 
 
 		 1089 aa  1006    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0721362  normal  0.38307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>