More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2010 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01980  multidrug efflux system, subunit B  42.43 
 
 		 1040 aa  763    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01981  multidrug efflux system, subunit C  49.27 
 
 		 1025 aa  736    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1580  acriflavin resistance protein  49.27 
 
 		 1025 aa  736    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0262852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1581  acriflavin resistance protein  42.52 
 
 		 1040 aa  765    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132425  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2217  multidrug efflux system subunit MdtB  42.52 
 
 		 1040 aa  764    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3487  acriflavin resistance protein  48.58 
 
 		 1036 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685883  normal  0.0180328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3583  acriflavin resistance protein  43.64 
 
 		 1035 aa  824    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03142  drug efflux pump transmembrane protein  41.31 
 
 		 1041 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  49.94 
 
 		 1033 aa  834    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4417  acriflavin resistance protein  56.8 
 
 		 1093 aa  1111    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1489  acriflavin resistance protein  42.37 
 
 		 1071 aa  796    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2755  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.68 
 
 		 1035 aa  709    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1566  multidrug efflux system subunit MdtB  42.52 
 
 		 1040 aa  765    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1597  acriflavin resistance protein  46.33 
 
 		 1044 aa  708    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1233  acriflavin resistance protein  47.49 
 
 		 1043 aa  745    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2484  acriflavin resistance protein  49.04 
 
 		 1035 aa  709    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  40.37 
 
 		 1029 aa  751    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1787  acriflavin resistance protein  42.18 
 
 		 1044 aa  741    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.342493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0571  acriflavin resistance protein  43.61 
 
 		 1046 aa  786    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606736  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2429  acriflavin resistance protein  46.75 
 
 		 1034 aa  853    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.618846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2188  acriflavin resistance protein  43.73 
 
 		 1035 aa  825    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3101  multidrug efflux system subunit MdtC  49.91 
 
 		 1024 aa  988    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0416497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1265  acriflavin resistance protein  45.8 
 
 		 1044 aa  832    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2419  acriflavin resistance protein  42.19 
 
 		 1053 aa  757    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2924  acriflavin resistance protein  41.28 
 
 		 1044 aa  756    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0978854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1499  multidrug resistance protein mdtC  56.18 
 
 		 1100 aa  1122    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3251  acriflavin resistance protein  39.93 
 
 		 1053 aa  684    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272492  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0985  multidrug efflux system subunit MdtB  42.43 
 
 		 1040 aa  764    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.442979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2522  acriflavin resistance protein  43.59 
 
 		 1034 aa  795    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984252  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2523  acriflavin resistance protein  46.85 
 
 		 1035 aa  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1168  acriflavin resistance protein  46.16 
 
 		 1038 aa  682    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4304  acriflavin resistance protein  56.78 
 
 		 1102 aa  1165    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123043  normal  0.121863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2368  multidrug efflux system subunit MdtC  49.51 
 
 		 1025 aa  740    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2367  multidrug efflux system subunit MdtB  42.52 
 
 		 1040 aa  766    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1213  multidrug efflux system subunit MdtC  49.82 
 
 		 1024 aa  985    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286734  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0765  putative multidrug efflux protein  41.01 
 
 		 1026 aa  702    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4317  acriflavin resistance protein  55.21 
 
 		 1156 aa  1145    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.463113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1330  multidrug efflux system subunit MdtC  49.82 
 
 		 1024 aa  986    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4416  acriflavin resistance protein  44.03 
 
 		 1039 aa  799    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.248497  normal  0.815285 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2868  AcrB/AcrD/AcrF family protein  57.2 
 
 		 1100 aa  1132    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3536  putative component of multidrug efflux pump, mdtB-like protein  43.05 
 
 		 1048 aa  888    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  39.71 
 
 		 1042 aa  754    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2331  acriflavin resistance protein  43.46 
 
 		 1035 aa  827    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0100478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1170  acriflavin resistance protein  56.4 
 
 		 1102 aa  1157    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273811  normal  0.0444118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2709  RND efflux transporter  43.52 
 
 		 1043 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2521  acriflavin resistance protein  56.9 
 
 		 1104 aa  1132    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225998  normal  0.0602775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4167  acriflavin resistance protein  42.83 
 
 		 1035 aa  736    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0984  multidrug efflux system subunit MdtC  49.64 
 
 		 1025 aa  740    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.352298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2560  acriflavin resistance protein  41.42 
 
 		 1034 aa  783    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478642  normal  0.875545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0743  acriflavin resistance protein  42.48 
 
 		 1044 aa  793    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0744  acriflavin resistance protein  42.96 
 
 		 1051 aa  748    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.842453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1773  acriflavin resistance protein  57.96 
 
 		 1103 aa  1184    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0248948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0134  acriflavin resistance protein  45.45 
 
 		 1065 aa  849    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2828  acriflavin resistance protein  50.77 
 
 		 1107 aa  1050    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376428  normal  0.152401 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1550  acriflavin resistance protein D  42.44 
 
 		 1071 aa  812    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2909  multidrug efflux system protein  58.65 
 
 		 1103 aa  1177    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2855  acriflavin resistance protein  45.5 
 
 		 1054 aa  691    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.427735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2010  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  100 
 
 		 1106 aa  2211    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2923  acriflavin resistance protein  42.8 
 
 		 1074 aa  809    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0817893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2570  acriflavin resistance protein  42.28 
 
 		 1041 aa  784    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0830521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4168  acriflavin resistance protein  54.36 
 
 		 1091 aa  1070    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0885638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  41.97 
 
 		 1042 aa  810    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2801  acriflavin resistance protein  44.1 
 
 		 1032 aa  830    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0747979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1512  acriflavin resistance protein  41.25 
 
 		 1042 aa  714    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.901552  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1509  acriflavin resistance protein  44.32 
 
 		 1048 aa  664    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2063  acriflavin resistance protein  41.6 
 
 		 1032 aa  763    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1157  multidrug efflux system subunit MdtC  49.39 
 
 		 1025 aa  737    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2288  acriflavin resistance protein  49.49 
 
 		 1089 aa  882    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0721362  normal  0.38307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3602  acriflavin resistance protein  54.9 
 
 		 1096 aa  1114    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3554  multidrug efflux system subunit MdtC  49.36 
 
 		 1026 aa  1004    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2710  RND efflux transporter  48.13 
 
 		 1036 aa  691    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0513  acriflavin resistance protein  42.83 
 
 		 1051 aa  780    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0135048  normal  0.800803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0600  acriflavin resistance protein  44.56 
 
 		 1066 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654802  normal  0.436006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2187  acriflavin resistance protein  43.39 
 
 		 1032 aa  795    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2830  acriflavin resistance protein  45.22 
 
 		 1092 aa  900    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2831  acriflavin resistance protein  50.64 
 
 		 1032 aa  759    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0717  acriflavin resistance protein  56.49 
 
 		 1102 aa  1161    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2258  acriflavin resistance protein  49.14 
 
 		 1053 aa  775    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal  0.166006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2218  multidrug efflux system subunit MdtC  49.15 
 
 		 1025 aa  735    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2095  acriflavin resistance protein  44.44 
 
 		 1053 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238073  normal  0.0214179 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1362  multidrug resistance protein MdtC  56.18 
 
 		 1100 aa  1122    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1078  acriflavin resistance protein  56.17 
 
 		 1102 aa  1149    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.955454  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2106  acriflavin resistance protein  56.35 
 
 		 1102 aa  1134    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31890  putative RND efflux transporter  43.52 
 
 		 1043 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31900  putative efflux transporter  47.88 
 
 		 1036 aa  687    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2330  acriflavin resistance protein  43.37 
 
 		 1032 aa  791    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1196  acriflavin resistance protein  56.58 
 
 		 1102 aa  1161    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.458181  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2418  acriflavin resistance protein  76.57 
 
 		 1099 aa  1617    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1078  acriflavin resistance protein  56.17 
 
 		 1102 aa  1149    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.204501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1367  multidrug resistance protein MdtC  56.18 
 
 		 1100 aa  1122    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3307  acriflavin resistance protein  49.73 
 
 		 1069 aa  1019    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2203  acriflavin resistance protein  45.38 
 
 		 1029 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2204  acriflavin resistance protein  51.41 
 
 		 1036 aa  738    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2800  acriflavin resistance protein  47.18 
 
 		 1035 aa  686    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2686  multidrug efflux system subunit MdtC  47.56 
 
 		 1025 aa  747    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2040  acriflavin resistance protein  49.72 
 
 		 1070 aa  969    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1158  multidrug efflux system subunit MdtB  42.5 
 
 		 1040 aa  763    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2593  acriflavin resistance protein  49.46 
 
 		 1072 aa  1012    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1565  multidrug efflux system subunit MdtC  49.27 
 
 		 1025 aa  736    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.9011  normal  0.896126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0345  acriflavin resistance protein  44.69 
 
 		 1051 aa  702    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>