More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2418 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01980  multidrug efflux system, subunit B  44.34 
 
 		 1040 aa  797    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01981  multidrug efflux system, subunit C  52.77 
 
 		 1025 aa  756    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1580  acriflavin resistance protein  52.77 
 
 		 1025 aa  757    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0262852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1581  acriflavin resistance protein  44.43 
 
 		 1040 aa  799    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.11 
 
 		 1032 aa  763    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2429  acriflavin resistance protein  49.87 
 
 		 1034 aa  683    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.618846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3583  acriflavin resistance protein  45.6 
 
 		 1035 aa  870    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2430  acriflavin resistance protein  42.17 
 
 		 1030 aa  704    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157087  normal  0.957896 
 
 
-
 
NC_003296  RS03142  drug efflux pump transmembrane protein  44.28 
 
 		 1041 aa  815    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  55.35 
 
 		 1033 aa  836    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2217  multidrug efflux system subunit MdtB  44.43 
 
 		 1040 aa  798    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2755  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.16 
 
 		 1035 aa  695    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1644  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.42 
 
 		 1048 aa  729    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0374438  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1787  acriflavin resistance protein  41.85 
 
 		 1044 aa  726    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.342493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2483  acriflavin resistance protein  40.67 
 
 		 1036 aa  666    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.137837  normal  0.300491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2484  acriflavin resistance protein  48.84 
 
 		 1035 aa  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1214  multidrug efflux system subunit MdtB  43.56 
 
 		 1052 aa  807    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.243575  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0134  acriflavin resistance protein  46.45 
 
 		 1065 aa  848    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0571  acriflavin resistance protein  40.44 
 
 		 1046 aa  663    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606736  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1026  acriflavin resistance protein  38.45 
 
 		 1032 aa  704    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3425  acriflavin resistance protein  39.04 
 
 		 1065 aa  700    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  40.62 
 
 		 1032 aa  764    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1265  acriflavin resistance protein  45.91 
 
 		 1044 aa  850    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192962 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2368  multidrug efflux system subunit MdtC  53.03 
 
 		 1025 aa  761    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1522  acriflavin resistance protein  43.96 
 
 		 1040 aa  807    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1499  multidrug resistance protein mdtC  59.24 
 
 		 1100 aa  1143    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1500  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.78 
 
 		 1036 aa  775    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2671  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.51 
 
 		 1048 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2522  acriflavin resistance protein  41.68 
 
 		 1034 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984252  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2523  acriflavin resistance protein  47.75 
 
 		 1035 aa  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3934  multidrug ABC transporter  43.58 
 
 		 1035 aa  806    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.962709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2288  acriflavin resistance protein  50.88 
 
 		 1089 aa  908    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0721362  normal  0.38307 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4304  acriflavin resistance protein  58.57 
 
 		 1102 aa  1178    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123043  normal  0.121863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2187  acriflavin resistance protein  44.53 
 
 		 1032 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  39.14 
 
 		 1037 aa  714    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1368  multidrug resistance protein MdtB  42.79 
 
 		 1036 aa  777    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3933  multidrug resistance protein mdtB  44.57 
 
 		 1042 aa  788    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.906804 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1367  multidrug resistance protein MdtC  59.24 
 
 		 1100 aa  1143    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1950  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.63 
 
 		 1048 aa  768    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2867  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.95 
 
 		 1036 aa  777    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2868  AcrB/AcrD/AcrF family protein  59.89 
 
 		 1100 aa  1159    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818421  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2022  acriflavin resistance protein  40.66 
 
 		 1041 aa  669    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2188  acriflavin resistance protein  45.51 
 
 		 1035 aa  870    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2900  acriflavin resistance protein  42.87 
 
 		 1037 aa  791    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0921711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2901  acriflavin resistance protein  43.84 
 
 		 1038 aa  797    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0661735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0379  acriflavin resistance protein  41.24 
 
 		 1024 aa  758    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2709  RND efflux transporter  43.64 
 
 		 1043 aa  780    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2559  acriflavin resistance protein  44.2 
 
 		 1042 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2560  acriflavin resistance protein  43.15 
 
 		 1034 aa  825    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478642  normal  0.875545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0743  acriflavin resistance protein  43.12 
 
 		 1044 aa  750    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0744  acriflavin resistance protein  47.89 
 
 		 1051 aa  674    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.842453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1335  putative RND efflux transporter  39.82 
 
 		 1028 aa  642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.14004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2531  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.42 
 
 		 1048 aa  728    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2827  acriflavin resistance protein  41.79 
 
 		 1052 aa  696    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.68497  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2828  acriflavin resistance protein  51.28 
 
 		 1107 aa  1051    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376428  normal  0.152401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2908  multidrug efflux system protein  41.82 
 
 		 1040 aa  738    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442487  normal  0.66419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2909  multidrug efflux system protein  60.04 
 
 		 1103 aa  1195    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1213  multidrug efflux system subunit MdtC  52.77 
 
 		 1024 aa  767    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286734  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2010  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  76.39 
 
 		 1106 aa  1551    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2570  acriflavin resistance protein  43.54 
 
 		 1041 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0830521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2571  acriflavin resistance protein  43.05 
 
 		 1037 aa  770    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0468972 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2367  multidrug efflux system subunit MdtB  44.25 
 
 		 1040 aa  796    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2287  acriflavin resistance protein  43.25 
 
 		 1026 aa  716    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362502  normal  0.921003 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1511  acriflavin resistance protein  44.24 
 
 		 1037 aa  770    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4168  acriflavin resistance protein  55.83 
 
 		 1091 aa  1068    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0885638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1509  acriflavin resistance protein  43.5 
 
 		 1048 aa  812    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2218  multidrug efflux system subunit MdtC  52.65 
 
 		 1025 aa  755    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2064  acriflavin resistance protein  44.35 
 
 		 1042 aa  815    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.730897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3602  acriflavin resistance protein  56.73 
 
 		 1096 aa  1138    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3603  acriflavin resistance protein  43.84 
 
 		 1037 aa  712    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0448996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0513  acriflavin resistance protein  42.69 
 
 		 1051 aa  747    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0135048  normal  0.800803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0600  acriflavin resistance protein  44.05 
 
 		 1066 aa  802    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654802  normal  0.436006 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3169  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.42 
 
 		 1048 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0164478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3582  acriflavin resistance protein  38.89 
 
 		 1069 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2830  acriflavin resistance protein  46.65 
 
 		 1092 aa  900    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2831  acriflavin resistance protein  52.71 
 
 		 1032 aa  755    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0717  acriflavin resistance protein  59.61 
 
 		 1102 aa  1189    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1233  acriflavin resistance protein  50.58 
 
 		 1043 aa  744    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.42 
 
 		 1048 aa  729    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1362  multidrug resistance protein MdtC  59.24 
 
 		 1100 aa  1143    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1363  multidrug resistance protein MdtB  42.78 
 
 		 1036 aa  776    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2685  multidrug efflux system subunit MdtB  43.43 
 
 		 1040 aa  803    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1078  acriflavin resistance protein  59.1 
 
 		 1102 aa  1157    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.955454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2710  RND efflux transporter  50.77 
 
 		 1036 aa  703    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31890  putative RND efflux transporter  43.64 
 
 		 1043 aa  780    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31900  putative efflux transporter  50.71 
 
 		 1036 aa  702    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3536  putative component of multidrug efflux pump, mdtB-like protein  41.61 
 
 		 1048 aa  822    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1196  acriflavin resistance protein  59.7 
 
 		 1102 aa  1189    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.458181  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1597  acriflavin resistance protein  46.23 
 
 		 1044 aa  887    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  41.15 
 
 		 1055 aa  774    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2584  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.42 
 
 		 1048 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2203  acriflavin resistance protein  46.67 
 
 		 1029 aa  870    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2204  acriflavin resistance protein  53.08 
 
 		 1036 aa  753    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  41.72 
 
 		 1041 aa  765    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  40.42 
 
 		 1035 aa  776    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2040  acriflavin resistance protein  50.37 
 
 		 1070 aa  975    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2686  multidrug efflux system subunit MdtC  52.65 
 
 		 1025 aa  754    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2592  acriflavin resistance protein  40.77 
 
 		 1108 aa  698    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.616304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2593  acriflavin resistance protein  50.91 
 
 		 1072 aa  1042    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2145  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.42 
 
 		 1048 aa  729    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.536412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>