More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1170 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01980  multidrug efflux system, subunit B  48.08 
 
 		 1040 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01981  multidrug efflux system, subunit C  57.29 
 
 		 1025 aa  855    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1580  acriflavin resistance protein  57.29 
 
 		 1025 aa  854    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0262852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1581  acriflavin resistance protein  48.21 
 
 		 1040 aa  671    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.93 
 
 		 1032 aa  661    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2429  acriflavin resistance protein  52.63 
 
 		 1034 aa  763    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.618846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3583  acriflavin resistance protein  48.23 
 
 		 1035 aa  926    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03142  drug efflux pump transmembrane protein  43.82 
 
 		 1041 aa  803    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  62.76 
 
 		 1033 aa  985    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3933  multidrug resistance protein mdtB  46.8 
 
 		 1042 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.906804 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1213  multidrug efflux system subunit MdtC  58.32 
 
 		 1024 aa  883    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286734  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2755  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.73 
 
 		 1035 aa  948    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1644  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.99 
 
 		 1048 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0374438  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2710  RND efflux transporter  56.03 
 
 		 1036 aa  812    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2483  acriflavin resistance protein  47.12 
 
 		 1036 aa  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.137837  normal  0.300491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2484  acriflavin resistance protein  53.08 
 
 		 1035 aa  773    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  45.2 
 
 		 1029 aa  875    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0570  acriflavin resistance protein  49.88 
 
 		 1103 aa  752    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.231767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0571  acriflavin resistance protein  43.7 
 
 		 1046 aa  781    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606736  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2584  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.99 
 
 		 1048 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3425  acriflavin resistance protein  37.84 
 
 		 1065 aa  676    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  45.16 
 
 		 1035 aa  901    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1265  acriflavin resistance protein  51.62 
 
 		 1044 aa  749    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1521  acriflavin resistance protein  46.47 
 
 		 1032 aa  682    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0510494  normal  0.0716903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1522  acriflavin resistance protein  45.39 
 
 		 1040 aa  688    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3169  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.99 
 
 		 1048 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0164478  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1499  multidrug resistance protein mdtC  87.93 
 
 		 1100 aa  1820    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1500  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.34 
 
 		 1036 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2671  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.12 
 
 		 1048 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2522  acriflavin resistance protein  47.95 
 
 		 1034 aa  729    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984252  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2523  acriflavin resistance protein  53.15 
 
 		 1035 aa  811    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1787  acriflavin resistance protein  45.5 
 
 		 1044 aa  838    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.342493 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2531  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.99 
 
 		 1048 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4304  acriflavin resistance protein  97.1 
 
 		 1102 aa  2051    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123043  normal  0.121863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4305  acriflavin resistance protein  45.26 
 
 		 1037 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0526146  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  44.8 
 
 		 1037 aa  659    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0134  acriflavin resistance protein  47.92 
 
 		 1065 aa  927    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1362  multidrug resistance protein MdtC  87.93 
 
 		 1100 aa  1820    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1950  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.63 
 
 		 1048 aa  661    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2867  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.13 
 
 		 1036 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2868  AcrB/AcrD/AcrF family protein  88.2 
 
 		 1100 aa  1837    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3536  putative component of multidrug efflux pump, mdtB-like protein  49.22 
 
 		 1048 aa  789    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1233  acriflavin resistance protein  52.3 
 
 		 1043 aa  843    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2900  acriflavin resistance protein  46.16 
 
 		 1037 aa  679    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0921711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2901  acriflavin resistance protein  46.36 
 
 		 1038 aa  676    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0661735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3934  multidrug ABC transporter  47.63 
 
 		 1035 aa  683    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.962709 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.99 
 
 		 1048 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  45.37 
 
 		 1041 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2559  acriflavin resistance protein  46.86 
 
 		 1042 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2560  acriflavin resistance protein  46.29 
 
 		 1034 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478642  normal  0.875545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0743  acriflavin resistance protein  45.91 
 
 		 1044 aa  871    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0744  acriflavin resistance protein  50.84 
 
 		 1051 aa  760    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.842453 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1026  acriflavin resistance protein  40 
 
 		 1032 aa  762    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2188  acriflavin resistance protein  48.32 
 
 		 1035 aa  930    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2828  acriflavin resistance protein  55.53 
 
 		 1107 aa  1191    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376428  normal  0.152401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2685  multidrug efflux system subunit MdtB  47.75 
 
 		 1040 aa  677    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2908  multidrug efflux system protein  44.5 
 
 		 1040 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442487  normal  0.66419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2909  multidrug efflux system protein  81.6 
 
 		 1103 aa  1691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2009  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  44.29 
 
 		 1041 aa  844    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0269291  normal  0.0260573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2010  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  56.77 
 
 		 1106 aa  1132    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1363  multidrug resistance protein MdtB  45.34 
 
 		 1036 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387551  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2570  acriflavin resistance protein  46.36 
 
 		 1041 aa  689    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0830521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2571  acriflavin resistance protein  46.29 
 
 		 1037 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0468972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  43.29 
 
 		 1042 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1511  acriflavin resistance protein  47.31 
 
 		 1037 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1512  acriflavin resistance protein  45.35 
 
 		 1042 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.901552  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1509  acriflavin resistance protein  50.58 
 
 		 1048 aa  786    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2063  acriflavin resistance protein  45.96 
 
 		 1032 aa  668    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2064  acriflavin resistance protein  44.93 
 
 		 1042 aa  684    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.730897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3602  acriflavin resistance protein  66.48 
 
 		 1096 aa  1386    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3603  acriflavin resistance protein  47.74 
 
 		 1037 aa  870    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0448996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0512  acriflavin resistance protein  61.63 
 
 		 1100 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0513  acriflavin resistance protein  44.63 
 
 		 1051 aa  798    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0135048  normal  0.800803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0600  acriflavin resistance protein  48.73 
 
 		 1066 aa  725    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654802  normal  0.436006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  45.85 
 
 		 1032 aa  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2830  acriflavin resistance protein  50.09 
 
 		 1092 aa  1012    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2831  acriflavin resistance protein  54.79 
 
 		 1032 aa  1114    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0717  acriflavin resistance protein  99.27 
 
 		 1102 aa  2203    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0718  acriflavin resistance protein  45.9 
 
 		 1039 aa  663    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1078  acriflavin resistance protein  94.1 
 
 		 1102 aa  1961    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.955454  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1079  acriflavin resistance protein  45.72 
 
 		 1039 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31890  putative RND efflux transporter  47.45 
 
 		 1043 aa  917    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31900  putative efflux transporter  55.9 
 
 		 1036 aa  812    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1214  multidrug efflux system subunit MdtB  46.75 
 
 		 1052 aa  668    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.243575  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1196  acriflavin resistance protein  99.36 
 
 		 1102 aa  2204    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.458181  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1197  acriflavin resistance protein  45.9 
 
 		 1039 aa  663    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  46.19 
 
 		 1055 aa  676    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1367  multidrug resistance protein MdtC  87.93 
 
 		 1100 aa  1820    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2686  multidrug efflux system subunit MdtC  57.36 
 
 		 1025 aa  863    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2203  acriflavin resistance protein  50.57 
 
 		 1029 aa  749    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2204  acriflavin resistance protein  59.07 
 
 		 1036 aa  857    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2430  acriflavin resistance protein  48.39 
 
 		 1030 aa  916    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157087  normal  0.957896 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  45.77 
 
 		 1041 aa  645    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2040  acriflavin resistance protein  54.83 
 
 		 1070 aa  1090    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2187  acriflavin resistance protein  46.91 
 
 		 1032 aa  881    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2593  acriflavin resistance protein  56.08 
 
 		 1072 aa  1187    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2145  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.99 
 
 		 1048 aa  648    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.536412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0345  acriflavin resistance protein  49.24 
 
 		 1051 aa  778    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1368  multidrug resistance protein MdtB  45.21 
 
 		 1036 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2709  RND efflux transporter  47.54 
 
 		 1043 aa  919    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>