204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1522 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  49.02 
 
 		 674 aa  637    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  49.62 
 
 		 674 aa  640    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1522  RND efflux transporter  100 
 
 		 669 aa  1274    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.707162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  41.43 
 
 		 689 aa  427  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  24.47 
 
 		 694 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  26.02 
 
 		 692 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  23.16 
 
 		 694 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.13 
 
 		 764 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  23.43 
 
 		 767 aa  102  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  20.28 
 
 		 755 aa  96.3  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  20.44 
 
 		 751 aa  95.1  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  19.22 
 
 		 796 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  20.55 
 
 		 799 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  20.18 
 
 		 799 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  21.17 
 
 		 794 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  20 
 
 		 799 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  27.93 
 
 		 727 aa  85.1  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  19.85 
 
 		 786 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  19.2 
 
 		 793 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  20.37 
 
 		 799 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  19.04 
 
 		 796 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  17.97 
 
 		 756 aa  81.6  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  19.85 
 
 		 786 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  19.85 
 
 		 786 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  19.32 
 
 		 787 aa  81.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  18.83 
 
 		 790 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.62 
 
 		 807 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.45 
 
 		 806 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  24.92 
 
 		 905 aa  78.6  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.7 
 
 		 1226 aa  77.4  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  28.82 
 
 		 898 aa  76.6  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  20.42 
 
 		 763 aa  77  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  19.58 
 
 		 784 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.94 
 
 		 798 aa  76.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  19.77 
 
 		 786 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  23.26 
 
 		 1225 aa  75.5  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  22.02 
 
 		 824 aa  75.5  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  18.8 
 
 		 816 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  22.08 
 
 		 788 aa  73.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.53 
 
 		 967 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  19.12 
 
 		 795 aa  72.8  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  21.29 
 
 		 787 aa  72.4  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  20.57 
 
 		 764 aa  70.1  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.36 
 
 		 807 aa  69.7  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.7 
 
 		 778 aa  68.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  23.31 
 
 		 877 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  20.35 
 
 		 794 aa  67.8  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  19.35 
 
 		 786 aa  67.4  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.11 
 
 		 789 aa  66.6  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  25.99 
 
 		 815 aa  66.6  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  19.48 
 
 		 799 aa  65.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  21.42 
 
 		 783 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  20.16 
 
 		 864 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  19.39 
 
 		 835 aa  65.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  19.13 
 
 		 786 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  19.13 
 
 		 786 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  17.44 
 
 		 784 aa  65.1  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  24.66 
 
 		 881 aa  65.1  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  20.38 
 
 		 768 aa  63.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  28.28 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  23.78 
 
 		 813 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  20.62 
 
 		 800 aa  61.2  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.92 
 
 		 808 aa  61.2  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  27.5 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.41 
 
 		 1172 aa  61.2  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  24.08 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  24.08 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  25.31 
 
 		 769 aa  60.8  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  23.93 
 
 		 771 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  23.93 
 
 		 771 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  18.92 
 
 		 808 aa  60.8  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  26.92 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  23.93 
 
 		 771 aa  60.8  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  20.61 
 
 		 797 aa  60.8  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  23.31 
 
 		 771 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  23.31 
 
 		 771 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  21.82 
 
 		 799 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  23.31 
 
 		 771 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  23.03 
 
 		 861 aa  60.1  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  23.31 
 
 		 771 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  23.31 
 
 		 771 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  24.68 
 
 		 753 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  20.93 
 
 		 772 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  20.59 
 
 		 786 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  19.51 
 
 		 1051 aa  58.9  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  20.12 
 
 		 770 aa  58.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  22.7 
 
 		 767 aa  58.2  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  21.82 
 
 		 804 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  30.95 
 
 		 849 aa  57.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  22.44 
 
 		 823 aa  57.8  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  23.57 
 
 		 792 aa  57.8  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.67 
 
 		 1291 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  19.01 
 
 		 831 aa  57.4  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  21.71 
 
 		 768 aa  57  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  20.95 
 
 		 792 aa  57  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  22.57 
 
 		 823 aa  56.6  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  22.84 
 
 		 860 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  25.95 
 
 		 791 aa  56.2  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  20.96 
 
 		 771 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  19.57 
 
 		 816 aa  55.5  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>