261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2196 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  44.09 
 
 		 799 aa  642    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  47.15 
 
 		 799 aa  732    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  43.57 
 
 		 826 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  47.87 
 
 		 790 aa  727    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  64.15 
 
 		 772 aa  1024    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  43.67 
 
 		 787 aa  643    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  93.13 
 
 		 771 aa  1454    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  46.26 
 
 		 796 aa  707    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  50.58 
 
 		 784 aa  787    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  46.04 
 
 		 796 aa  702    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  47.09 
 
 		 799 aa  732    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  46.3 
 
 		 794 aa  710    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  43.56 
 
 		 820 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  43.36 
 
 		 831 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  100 
 
 		 771 aa  1563    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  83.92 
 
 		 769 aa  1308    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  81.45 
 
 		 770 aa  1295    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  44.42 
 
 		 787 aa  666    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  66.02 
 
 		 771 aa  1030    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  94.94 
 
 		 771 aa  1476    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  94.94 
 
 		 771 aa  1476    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  47.22 
 
 		 799 aa  736    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  85.05 
 
 		 768 aa  1313    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  49.09 
 
 		 784 aa  723    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  47.87 
 
 		 793 aa  724    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  94.94 
 
 		 771 aa  1477    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  82.75 
 
 		 767 aa  1295    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  95.72 
 
 		 771 aa  1466    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  82.75 
 
 		 768 aa  1310    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  80.96 
 
 		 772 aa  1305    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  83.27 
 
 		 767 aa  1315    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  95.85 
 
 		 771 aa  1467    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  43.75 
 
 		 795 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  47.35 
 
 		 799 aa  734    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  95.85 
 
 		 771 aa  1467    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  95.72 
 
 		 771 aa  1465    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  42.56 
 
 		 794 aa  634  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  43.53 
 
 		 783 aa  634  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  42.76 
 
 		 821 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  44.91 
 
 		 813 aa  632  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  42.64 
 
 		 821 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  42.17 
 
 		 834 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  42.03 
 
 		 816 aa  624  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  42.65 
 
 		 808 aa  618  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  44.06 
 
 		 810 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  42.21 
 
 		 808 aa  602  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  40.44 
 
 		 786 aa  595  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  40.73 
 
 		 786 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  40.73 
 
 		 786 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  42.65 
 
 		 797 aa  589  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  41.19 
 
 		 799 aa  588  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  40.1 
 
 		 827 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  40.6 
 
 		 786 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  41.52 
 
 		 786 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  41.53 
 
 		 786 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  41.53 
 
 		 786 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  40.13 
 
 		 804 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  41.11 
 
 		 786 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  40.15 
 
 		 786 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  39.64 
 
 		 804 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  39.81 
 
 		 813 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  39.95 
 
 		 813 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  40.16 
 
 		 809 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  26.99 
 
 		 797 aa  313  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  29.16 
 
 		 799 aa  308  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  28.4 
 
 		 791 aa  301  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  25.99 
 
 		 790 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  25.42 
 
 		 808 aa  280  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  28.59 
 
 		 796 aa  277  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  25.22 
 
 		 792 aa  263  6.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  24.71 
 
 		 805 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  24.59 
 
 		 806 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  24.81 
 
 		 805 aa  229  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  24.81 
 
 		 805 aa  229  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  23.97 
 
 		 830 aa  229  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.99 
 
 		 1051 aa  136  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.61 
 
 		 764 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.95 
 
 		 788 aa  131  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.39 
 
 		 773 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.63 
 
 		 808 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.8 
 
 		 831 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.57 
 
 		 755 aa  106  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  20.99 
 
 		 767 aa  97.1  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  22.31 
 
 		 804 aa  95.5  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.6 
 
 		 905 aa  95.1  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  19.74 
 
 		 806 aa  92.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  20.93 
 
 		 792 aa  90.9  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  18.97 
 
 		 807 aa  90.9  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  22.86 
 
 		 864 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  20.99 
 
 		 869 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  20.99 
 
 		 869 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  21.48 
 
 		 778 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  22.15 
 
 		 752 aa  83.2  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  20.73 
 
 		 803 aa  82.4  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  20.53 
 
 		 898 aa  78.6  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  21.1 
 
 		 821 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  20.34 
 
 		 764 aa  71.2  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  21.6 
 
 		 748 aa  70.9  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  21.46 
 
 		 694 aa  70.1  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  18.46 
 
 		 779 aa  70.1  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>