187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1525 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  100 
 
 		 694 aa  1390    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  80.84 
 
 		 694 aa  1137    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  41.57 
 
 		 692 aa  536  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  33.01 
 
 		 727 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.32 
 
 		 764 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  24.11 
 
 		 674 aa  150  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  23.52 
 
 		 674 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  24.14 
 
 		 689 aa  132  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1522  RND efflux transporter  23.58 
 
 		 669 aa  126  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.707162  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  21.64 
 
 		 835 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  25.31 
 
 		 767 aa  106  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.35 
 
 		 807 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  21.65 
 
 		 828 aa  90.1  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  23.14 
 
 		 755 aa  89.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  23.28 
 
 		 815 aa  89  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  22.17 
 
 		 756 aa  88.6  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  31.07 
 
 		 898 aa  88.2  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  23.45 
 
 		 821 aa  87.8  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.24 
 
 		 1051 aa  87  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  24.41 
 
 		 905 aa  83.6  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  21.44 
 
 		 816 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  23.41 
 
 		 864 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  19.85 
 
 		 799 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  23.17 
 
 		 861 aa  79.3  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  20.08 
 
 		 799 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.67 
 
 		 789 aa  77.8  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  20.42 
 
 		 813 aa  77.4  0.0000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  20.55 
 
 		 788 aa  77.4  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  19.95 
 
 		 799 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  20.13 
 
 		 794 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  18.58 
 
 		 825 aa  74.7  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  24.32 
 
 		 806 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  21.08 
 
 		 815 aa  74.7  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  21.71 
 
 		 804 aa  74.7  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  20.41 
 
 		 821 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  19.57 
 
 		 799 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  19.57 
 
 		 796 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  23.14 
 
 		 824 aa  73.9  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  21.04 
 
 		 772 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.08 
 
 		 778 aa  73.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  21.82 
 
 		 895 aa  73.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.1 
 
 		 831 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.74 
 
 		 837 aa  71.2  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  19.82 
 
 		 790 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  22.2 
 
 		 807 aa  70.5  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  19.68 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  24.94 
 
 		 823 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  19.67 
 
 		 793 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  33.04 
 
 		 872 aa  67  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  20.42 
 
 		 784 aa  67.4  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  19.13 
 
 		 751 aa  66.6  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  23.06 
 
 		 788 aa  67  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  24.19 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  24.46 
 
 		 823 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  22.35 
 
 		 789 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  24.7 
 
 		 823 aa  64.7  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  23.54 
 
 		 763 aa  64.3  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  20.82 
 
 		 787 aa  63.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  20.6 
 
 		 771 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  20.6 
 
 		 771 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  26.74 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  24.56 
 
 		 800 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  22.66 
 
 		 881 aa  62.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  21.17 
 
 		 796 aa  62.4  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  19.2 
 
 		 748 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  20.37 
 
 		 771 aa  61.6  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  20.42 
 
 		 771 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  31.75 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  21.29 
 
 		 768 aa  61.6  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  20.77 
 
 		 787 aa  61.6  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  21.95 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  24.41 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  25.66 
 
 		 877 aa  61.2  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  22.49 
 
 		 788 aa  60.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.46 
 
 		 1172 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  21.72 
 
 		 795 aa  60.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  23.94 
 
 		 385 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  26.25 
 
 		 849 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  22.42 
 
 		 788 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  19.64 
 
 		 803 aa  59.7  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  27.5 
 
 		 1204 aa  59.7  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  22.04 
 
 		 1359 aa  59.7  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2562  RND efflux transporter  21.8 
 
 		 697 aa  58.9  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.58 
 
 		 800 aa  59.3  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  21.05 
 
 		 808 aa  59.3  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  21.18 
 
 		 771 aa  58.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  27.78 
 
 		 792 aa  58.2  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  19.93 
 
 		 811 aa  58.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  20.89 
 
 		 845 aa  58.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  17.44 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  20.19 
 
 		 779 aa  57.8  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  21.3 
 
 		 816 aa  57.4  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20 
 
 		 808 aa  57.4  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  27.98 
 
 		 859 aa  57.4  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1083 aa  57  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  21.71 
 
 		 797 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  19.96 
 
 		 799 aa  56.2  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  23.61 
 
 		 865 aa  56.2  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  25.29 
 
 		 860 aa  55.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  23.11 
 
 		 752 aa  55.8  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>