More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0154 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  54.6 
 
 		 756 aa  787    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  100 
 
 		 751 aa  1468    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  43.16 
 
 		 763 aa  533  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  31.13 
 
 		 755 aa  318  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  24.67 
 
 		 778 aa  229  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  25.56 
 
 		 815 aa  220  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.69 
 
 		 807 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.09 
 
 		 837 aa  215  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.9 
 
 		 764 aa  202  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  26.17 
 
 		 811 aa  197  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  26.22 
 
 		 764 aa  190  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  26.09 
 
 		 792 aa  185  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  24.34 
 
 		 800 aa  182  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  23.8 
 
 		 779 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  23.46 
 
 		 831 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.13 
 
 		 808 aa  171  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  26.04 
 
 		 825 aa  164  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  23.55 
 
 		 789 aa  160  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  24.01 
 
 		 807 aa  158  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.71 
 
 		 806 aa  157  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1083 aa  155  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  26.13 
 
 		 835 aa  154  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  21.75 
 
 		 813 aa  152  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  23.99 
 
 		 801 aa  150  9e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  24.18 
 
 		 765 aa  147  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  22.22 
 
 		 821 aa  147  9e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  22.77 
 
 		 779 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  25.31 
 
 		 824 aa  145  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  23.35 
 
 		 788 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  23.14 
 
 		 823 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  22.82 
 
 		 816 aa  142  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  23.02 
 
 		 823 aa  141  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  22.86 
 
 		 823 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  22.76 
 
 		 828 aa  137  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  21.75 
 
 		 821 aa  137  9e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  26.56 
 
 		 967 aa  136  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  24.25 
 
 		 800 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.78 
 
 		 773 aa  134  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.98 
 
 		 762 aa  131  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.6 
 
 		 1051 aa  130  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  21.36 
 
 		 797 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  21.84 
 
 		 815 aa  126  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.05 
 
 		 803 aa  123  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  25.31 
 
 		 788 aa  118  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  23.08 
 
 		 790 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  22.4 
 
 		 869 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.31 
 
 		 905 aa  114  7.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  23.31 
 
 		 804 aa  113  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  22.5 
 
 		 869 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  25.71 
 
 		 860 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  26.81 
 
 		 881 aa  111  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  26.3 
 
 		 865 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  23.74 
 
 		 788 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  24.16 
 
 		 789 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  23.74 
 
 		 788 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  22.11 
 
 		 792 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  21.06 
 
 		 898 aa  105  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  21.25 
 
 		 674 aa  102  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  17.58 
 
 		 767 aa  101  4e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  23.64 
 
 		 791 aa  101  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.54 
 
 		 717 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  20.73 
 
 		 674 aa  99.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  25.1 
 
 		 789 aa  99  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  24.68 
 
 		 785 aa  97.4  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  30.1 
 
 		 859 aa  97.4  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1522  RND efflux transporter  20.36 
 
 		 669 aa  97.4  9e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.707162  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  23.52 
 
 		 797 aa  97.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  25.76 
 
 		 895 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  21.3 
 
 		 808 aa  96.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  34.9 
 
 		 872 aa  94.4  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  24.1 
 
 		 797 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  21.13 
 
 		 727 aa  93.2  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  22.07 
 
 		 1359 aa  90.5  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.49 
 
 		 756 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  22.25 
 
 		 694 aa  88.6  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  24.52 
 
 		 877 aa  87.8  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  23.85 
 
 		 1204 aa  87.4  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  20.43 
 
 		 694 aa  87.4  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  22.07 
 
 		 799 aa  85.1  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.47 
 
 		 776 aa  84.7  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.51 
 
 		 723 aa  84  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  20.94 
 
 		 692 aa  82.8  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  23.77 
 
 		 874 aa  81.6  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  23.04 
 
 		 796 aa  80.5  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0528  RND superfamily transporter  25.5 
 
 		 789 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  21.98 
 
 		 864 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  21.36 
 
 		 772 aa  78.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  20.07 
 
 		 861 aa  78.6  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  21.8 
 
 		 805 aa  78.2  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  21.99 
 
 		 805 aa  77.8  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2688  RND superfamily transporter  27.22 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  20.53 
 
 		 799 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  21.01 
 
 		 689 aa  77.4  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  21.98 
 
 		 806 aa  77  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  19.59 
 
 		 747 aa  76.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.72 
 
 		 812 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  22.15 
 
 		 786 aa  75.1  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  22.15 
 
 		 786 aa  75.1  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  30.63 
 
 		 862 aa  74.3  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  21.39 
 
 		 786 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>