189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1117 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  100 
 
 		 765 aa  1542    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  35.45 
 
 		 800 aa  492  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  34.2 
 
 		 779 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  33.73 
 
 		 764 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  35.76 
 
 		 811 aa  470  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  31.56 
 
 		 792 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  23.9 
 
 		 755 aa  203  9e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  22.32 
 
 		 778 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  22.35 
 
 		 815 aa  172  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.97 
 
 		 764 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.3 
 
 		 717 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.03 
 
 		 837 aa  160  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.23 
 
 		 807 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  23.62 
 
 		 756 aa  147  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.87 
 
 		 723 aa  139  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  24.22 
 
 		 751 aa  132  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  22.85 
 
 		 779 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  19.82 
 
 		 831 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  23.17 
 
 		 835 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  20.25 
 
 		 821 aa  108  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  19.71 
 
 		 727 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  19.54 
 
 		 773 aa  104  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  22.3 
 
 		 763 aa  102  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  20.96 
 
 		 787 aa  102  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  22.88 
 
 		 788 aa  101  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  20.69 
 
 		 1051 aa  100  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  18.88 
 
 		 808 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  20.17 
 
 		 801 aa  99  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  22.72 
 
 		 785 aa  98.6  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  22.14 
 
 		 797 aa  97.8  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  20.92 
 
 		 823 aa  97.1  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  20.76 
 
 		 823 aa  97.4  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  19.41 
 
 		 789 aa  95.9  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  19.95 
 
 		 821 aa  95.5  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  21.52 
 
 		 789 aa  95.9  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  24.14 
 
 		 789 aa  95.5  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  20.59 
 
 		 823 aa  95.1  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  20.28 
 
 		 905 aa  94.7  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  22.01 
 
 		 820 aa  94.4  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  19.36 
 
 		 788 aa  94  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  22.9 
 
 		 797 aa  92.4  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  22.48 
 
 		 804 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1083 aa  90.9  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  21.22 
 
 		 770 aa  89.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  19.46 
 
 		 813 aa  88.6  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  20.49 
 
 		 816 aa  88.6  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  20.64 
 
 		 898 aa  87.4  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  22.01 
 
 		 788 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  21.98 
 
 		 799 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  20.73 
 
 		 786 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  21.19 
 
 		 767 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  22.65 
 
 		 796 aa  85.9  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  21.16 
 
 		 786 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  19.9 
 
 		 806 aa  84.7  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  22.42 
 
 		 869 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  20.53 
 
 		 772 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2688  RND superfamily transporter  22.66 
 
 		 787 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  20.83 
 
 		 784 aa  82  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  22.42 
 
 		 869 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  21.17 
 
 		 767 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  18.66 
 
 		 767 aa  80.1  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  20.49 
 
 		 768 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  23.26 
 
 		 804 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  21.42 
 
 		 786 aa  79  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  21.42 
 
 		 786 aa  79  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  18.9 
 
 		 828 aa  78.2  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  19.6 
 
 		 803 aa  78.2  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  22.05 
 
 		 1359 aa  78.2  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.29 
 
 		 967 aa  77.8  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  21.57 
 
 		 790 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  20.9 
 
 		 796 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  21.44 
 
 		 793 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  22.57 
 
 		 877 aa  75.1  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  20.5 
 
 		 783 aa  74.7  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.87 
 
 		 762 aa  74.3  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  23.17 
 
 		 881 aa  73.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  23.21 
 
 		 797 aa  72.8  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.49 
 
 		 804 aa  73.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  21.81 
 
 		 864 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  18.89 
 
 		 772 aa  72.4  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  20.71 
 
 		 796 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  21.55 
 
 		 786 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  20.25 
 
 		 692 aa  71.6  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  22.4 
 
 		 788 aa  71.2  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  20.41 
 
 		 771 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  20.41 
 
 		 771 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  21 
 
 		 799 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  21.18 
 
 		 786 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  20.19 
 
 		 768 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  20.88 
 
 		 799 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  20.48 
 
 		 784 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  20 
 
 		 794 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  21.18 
 
 		 786 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  29.79 
 
 		 807 aa  69.3  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  21.18 
 
 		 786 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  20.71 
 
 		 799 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  22.47 
 
 		 860 aa  68.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  20.71 
 
 		 799 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  20.69 
 
 		 769 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  19.5 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>