213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1940 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  42.69 
 
 		 860 aa  645    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  45.21 
 
 		 881 aa  712    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  100 
 
 		 877 aa  1793    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  41.2 
 
 		 865 aa  631  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  21.48 
 
 		 905 aa  173  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1083 aa  156  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  20.86 
 
 		 898 aa  155  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.24 
 
 		 837 aa  137  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.96 
 
 		 764 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  23.37 
 
 		 815 aa  120  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  27.5 
 
 		 792 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  19.66 
 
 		 816 aa  118  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.01 
 
 		 807 aa  112  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  18.36 
 
 		 821 aa  111  7.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  24.15 
 
 		 800 aa  110  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  25.6 
 
 		 1051 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  24.82 
 
 		 755 aa  107  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  22.8 
 
 		 779 aa  106  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  23.08 
 
 		 1204 aa  103  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  25.47 
 
 		 811 aa  102  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  24.95 
 
 		 756 aa  101  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  21.54 
 
 		 815 aa  100  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  25.59 
 
 		 789 aa  97.8  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  27.67 
 
 		 869 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  27.61 
 
 		 869 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  27.95 
 
 		 861 aa  95.5  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  20.94 
 
 		 767 aa  91.7  5e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  22.13 
 
 		 764 aa  89.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  27.82 
 
 		 835 aa  89  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  20.91 
 
 		 779 aa  88.6  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  24.12 
 
 		 805 aa  88.6  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  24.12 
 
 		 806 aa  88.6  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  22.99 
 
 		 1128 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  22.39 
 
 		 778 aa  86.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  21.06 
 
 		 808 aa  85.5  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  23.53 
 
 		 872 aa  85.1  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  21.2 
 
 		 813 aa  83.6  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  20.62 
 
 		 828 aa  82.8  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.44 
 
 		 773 aa  80.9  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  24.85 
 
 		 792 aa  80.9  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  21.95 
 
 		 830 aa  80.1  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  23.45 
 
 		 823 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  23.08 
 
 		 823 aa  78.2  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  22.93 
 
 		 765 aa  77  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  22.61 
 
 		 823 aa  77.4  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  18.83 
 
 		 831 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  24.73 
 
 		 751 aa  75.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.88 
 
 		 806 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  21.97 
 
 		 805 aa  75.5  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  21.97 
 
 		 805 aa  75.5  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  22.67 
 
 		 796 aa  72.8  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  24.79 
 
 		 807 aa  72.8  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  22.19 
 
 		 799 aa  72  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  23.44 
 
 		 824 aa  71.6  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  23.5 
 
 		 388 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  22.78 
 
 		 385 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  23.49 
 
 		 674 aa  70.1  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  23.42 
 
 		 674 aa  69.3  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  23.32 
 
 		 821 aa  68.6  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  19.29 
 
 		 803 aa  68.2  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1522  RND efflux transporter  27.6 
 
 		 669 aa  67.8  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.707162  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  22.25 
 
 		 385 aa  67  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  23.62 
 
 		 689 aa  67  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  25.93 
 
 		 768 aa  67.4  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.53 
 
 		 886 aa  67.4  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  23.42 
 
 		 385 aa  67.4  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  24.87 
 
 		 387 aa  66.6  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  21.18 
 
 		 804 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  21.03 
 
 		 801 aa  65.1  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  24.29 
 
 		 800 aa  65.1  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  22.39 
 
 		 797 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  21.89 
 
 		 788 aa  63.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  23.23 
 
 		 790 aa  63.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  21.65 
 
 		 777 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  31.17 
 
 		 883 aa  62.4  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  30.15 
 
 		 825 aa  62.4  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.52 
 
 		 1172 aa  62.4  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  19.6 
 
 		 694 aa  62.4  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.78 
 
 		 804 aa  62  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  21.59 
 
 		 727 aa  61.2  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  23.74 
 
 		 820 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.6 
 
 		 967 aa  60.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  23.25 
 
 		 796 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  22.58 
 
 		 380 aa  60.1  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  24.77 
 
 		 763 aa  59.3  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  28.4 
 
 		 920 aa  59.3  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  25.57 
 
 		 1011 aa  59.3  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  29.17 
 
 		 692 aa  59.3  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  23.74 
 
 		 799 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  21.81 
 
 		 791 aa  58.9  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.22 
 
 		 883 aa  58.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  19.27 
 
 		 859 aa  58.5  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  29.01 
 
 		 899 aa  58.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  22.59 
 
 		 772 aa  58.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  25.47 
 
 		 772 aa  58.5  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  24.38 
 
 		 799 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  22.8 
 
 		 694 aa  57.8  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  19.68 
 
 		 747 aa  57  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  26.55 
 
 		 769 aa  57.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  24.76 
 
 		 808 aa  57  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>