More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1447 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  43.52 
 
 		 771 aa  641    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  43.52 
 
 		 771 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  43.12 
 
 		 772 aa  669    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  43.53 
 
 		 772 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  43.71 
 
 		 771 aa  653    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  78.02 
 
 		 810 aa  1128    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  100 
 
 		 820 aa  1657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  43.52 
 
 		 771 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  43.14 
 
 		 767 aa  649    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  43.88 
 
 		 769 aa  658    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  57.07 
 
 		 816 aa  884    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  44.77 
 
 		 784 aa  677    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  43.26 
 
 		 771 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  43.48 
 
 		 770 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  43.32 
 
 		 771 aa  648    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  43.32 
 
 		 771 aa  648    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  43.52 
 
 		 771 aa  641    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  43.9 
 
 		 768 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  44.34 
 
 		 767 aa  653    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  43.06 
 
 		 771 aa  646    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  43.84 
 
 		 768 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  43.56 
 
 		 771 aa  630  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  41.78 
 
 		 796 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  42.44 
 
 		 796 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  42.34 
 
 		 784 aa  617  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  41.46 
 
 		 794 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  41.58 
 
 		 787 aa  608  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  41.12 
 
 		 787 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  40.85 
 
 		 795 aa  601  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  41.44 
 
 		 790 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  41.44 
 
 		 793 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  40.97 
 
 		 799 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  40.94 
 
 		 799 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  40.97 
 
 		 799 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  40.41 
 
 		 799 aa  592  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  42.27 
 
 		 813 aa  581  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  40.21 
 
 		 794 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  41.59 
 
 		 821 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  40.83 
 
 		 821 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  41.62 
 
 		 808 aa  562  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  38.91 
 
 		 799 aa  562  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  40.28 
 
 		 783 aa  561  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  40.36 
 
 		 826 aa  562  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  39.92 
 
 		 831 aa  555  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  41.34 
 
 		 808 aa  552  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  38.36 
 
 		 834 aa  545  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  40.74 
 
 		 804 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  39.45 
 
 		 799 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  39.69 
 
 		 786 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  39.82 
 
 		 786 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  39.82 
 
 		 786 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  39.66 
 
 		 786 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  40.13 
 
 		 786 aa  529  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  39.66 
 
 		 786 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  40.35 
 
 		 786 aa  525  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  39.79 
 
 		 786 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  40.98 
 
 		 804 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  40.05 
 
 		 797 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  38.03 
 
 		 786 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  37.72 
 
 		 827 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  40.68 
 
 		 813 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  39.87 
 
 		 813 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  40.46 
 
 		 809 aa  489  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  27.78 
 
 		 790 aa  299  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  28.81 
 
 		 799 aa  295  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  27.69 
 
 		 797 aa  286  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  29.61 
 
 		 796 aa  281  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  26.17 
 
 		 791 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  28.7 
 
 		 808 aa  270  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  25.95 
 
 		 792 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  25.13 
 
 		 806 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  25.22 
 
 		 805 aa  218  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  25.31 
 
 		 830 aa  211  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  24.22 
 
 		 805 aa  195  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  24.22 
 
 		 805 aa  195  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.81 
 
 		 764 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.94 
 
 		 831 aa  129  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.65 
 
 		 1051 aa  121  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  22.18 
 
 		 773 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  19.38 
 
 		 808 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  19.23 
 
 		 788 aa  98.2  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  22.32 
 
 		 869 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  20.57 
 
 		 811 aa  91.7  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  21.64 
 
 		 765 aa  90.5  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.76 
 
 		 755 aa  89.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  21.32 
 
 		 804 aa  88.2  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.6 
 
 		 778 aa  87.8  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  22.52 
 
 		 789 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  27.76 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  19.35 
 
 		 803 aa  82  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  22.46 
 
 		 800 aa  82  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  22.65 
 
 		 788 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  23.23 
 
 		 752 aa  80.1  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  21.52 
 
 		 788 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  25.54 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  26.79 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  26.2 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  29.61 
 
 		 806 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  21.73 
 
 		 1359 aa  75.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  20.67 
 
 		 788 aa  73.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>