296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3357 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  40.34 
 
 		 824 aa  639    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  43.82 
 
 		 835 aa  691    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  46.07 
 
 		 825 aa  726    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  100 
 
 		 872 aa  1763    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  42.08 
 
 		 859 aa  623  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  37.72 
 
 		 828 aa  581  1e-164  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  38.65 
 
 		 816 aa  571  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  39.07 
 
 		 815 aa  567  1e-160  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  37.59 
 
 		 821 aa  564  1.0000000000000001e-159  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  36.22 
 
 		 813 aa  527  1e-148  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  35.92 
 
 		 821 aa  499  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  37.46 
 
 		 823 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  37.34 
 
 		 823 aa  481  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  37.22 
 
 		 823 aa  479  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  30.07 
 
 		 807 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  29.68 
 
 		 800 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  24.94 
 
 		 755 aa  224  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.98 
 
 		 764 aa  189  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  22.72 
 
 		 778 aa  183  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.72 
 
 		 807 aa  171  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  22.67 
 
 		 898 aa  168  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  25.16 
 
 		 756 aa  151  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.52 
 
 		 837 aa  145  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  22.57 
 
 		 815 aa  142  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  21.96 
 
 		 905 aa  141  4.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  23.39 
 
 		 860 aa  139  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.95 
 
 		 967 aa  137  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.74 
 
 		 808 aa  135  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  22.98 
 
 		 801 aa  134  7.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  21.29 
 
 		 811 aa  134  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  23.05 
 
 		 865 aa  130  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  24.28 
 
 		 1011 aa  129  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.39 
 
 		 806 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  21.38 
 
 		 792 aa  124  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.92 
 
 		 773 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  22.21 
 
 		 789 aa  122  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  21.58 
 
 		 797 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  21.31 
 
 		 804 aa  121  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  21.16 
 
 		 796 aa  120  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  20.46 
 
 		 779 aa  119  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.14 
 
 		 831 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.28 
 
 		 800 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  20.59 
 
 		 1051 aa  114  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1083 aa  114  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.55 
 
 		 788 aa  114  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  25.68 
 
 		 763 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  21.23 
 
 		 881 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  21.52 
 
 		 788 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  22.74 
 
 		 789 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  19.77 
 
 		 797 aa  101  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.7 
 
 		 762 aa  98.6  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  20.07 
 
 		 789 aa  97.8  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  28.61 
 
 		 803 aa  95.1  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  26.01 
 
 		 879 aa  94  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  27.41 
 
 		 788 aa  92.4  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  23.56 
 
 		 805 aa  92.4  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  21.36 
 
 		 752 aa  90.1  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  21.52 
 
 		 869 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  27.23 
 
 		 385 aa  89  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.75 
 
 		 717 aa  88.6  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  35.03 
 
 		 751 aa  88.6  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  27.72 
 
 		 385 aa  88.6  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  23.06 
 
 		 752 aa  87  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  31.37 
 
 		 1204 aa  86.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  19.17 
 
 		 785 aa  85.9  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  27.23 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  31.06 
 
 		 1131 aa  85.5  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  20.15 
 
 		 779 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  19.45 
 
 		 767 aa  82.4  0.00000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  27.81 
 
 		 895 aa  81.6  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  24.34 
 
 		 792 aa  81.3  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  27.27 
 
 		 380 aa  80.9  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  18.54 
 
 		 764 aa  78.2  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  28.21 
 
 		 388 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  27.54 
 
 		 727 aa  77.4  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  26.03 
 
 		 877 aa  77  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  21.89 
 
 		 791 aa  75.1  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.55 
 
 		 887 aa  74.7  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  19.83 
 
 		 797 aa  74.3  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  29.35 
 
 		 694 aa  74.3  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  19.75 
 
 		 765 aa  73.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  22.19 
 
 		 790 aa  72.8  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  23.19 
 
 		 842 aa  73.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  27.68 
 
 		 874 aa  72  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  22.11 
 
 		 830 aa  70.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  21.75 
 
 		 1128 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.92 
 
 		 882 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.94 
 
 		 882 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  26.61 
 
 		 855 aa  70.1  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  26.37 
 
 		 694 aa  70.1  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.92 
 
 		 882 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.92 
 
 		 669 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  27.27 
 
 		 778 aa  68.6  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  22.77 
 
 		 862 aa  68.2  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  27.17 
 
 		 862 aa  68.2  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2562  RND efflux transporter  27.32 
 
 		 697 aa  67.8  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  28.31 
 
 		 884 aa  67.4  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  25.65 
 
 		 692 aa  67  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  28.41 
 
 		 923 aa  67  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  27.52 
 
 		 788 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>