292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1652 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  100 
 
 		 779 aa  1593    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  52.44 
 
 		 792 aa  806    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  48.95 
 
 		 800 aa  773    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  44.02 
 
 		 811 aa  654    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  53.54 
 
 		 764 aa  800    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  33.95 
 
 		 765 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  25 
 
 		 778 aa  267  7e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.62 
 
 		 807 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  26.22 
 
 		 755 aa  247  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.53 
 
 		 837 aa  231  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  25.28 
 
 		 815 aa  226  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.54 
 
 		 764 aa  223  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.74 
 
 		 717 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  24.83 
 
 		 756 aa  196  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.13 
 
 		 723 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  21.49 
 
 		 808 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  23.6 
 
 		 801 aa  177  8e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.09 
 
 		 806 aa  173  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  22.05 
 
 		 789 aa  166  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  22.98 
 
 		 751 aa  163  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  24.04 
 
 		 763 aa  160  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  22.55 
 
 		 773 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.12 
 
 		 831 aa  155  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  23.67 
 
 		 767 aa  151  4e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.69 
 
 		 788 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  21.88 
 
 		 779 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.34 
 
 		 803 aa  146  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  22.43 
 
 		 869 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  22.43 
 
 		 869 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  20.91 
 
 		 807 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  22.2 
 
 		 905 aa  134  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  22.83 
 
 		 835 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  22.24 
 
 		 813 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.51 
 
 		 804 aa  132  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  20.8 
 
 		 1083 aa  131  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.34 
 
 		 1051 aa  130  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  22.4 
 
 		 828 aa  128  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  22.6 
 
 		 821 aa  127  9e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  20.36 
 
 		 821 aa  122  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  23.13 
 
 		 823 aa  121  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  22.47 
 
 		 788 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  19.64 
 
 		 799 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  22.8 
 
 		 823 aa  121  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  22.86 
 
 		 823 aa  120  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  21.5 
 
 		 824 aa  118  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  21.11 
 
 		 825 aa  118  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  22.11 
 
 		 785 aa  114  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  21.34 
 
 		 748 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  20.91 
 
 		 815 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  22.49 
 
 		 788 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  19.65 
 
 		 872 aa  111  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.58 
 
 		 967 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  19.53 
 
 		 796 aa  109  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  21.99 
 
 		 796 aa  108  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  20.46 
 
 		 816 aa  108  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  21.85 
 
 		 789 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  21.82 
 
 		 861 aa  105  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  22.55 
 
 		 860 aa  105  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  19.85 
 
 		 792 aa  105  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  24.95 
 
 		 788 aa  102  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  22.57 
 
 		 727 aa  100  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  22.8 
 
 		 877 aa  99  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  20.08 
 
 		 755 aa  98.6  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  21.9 
 
 		 898 aa  97.8  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  24.6 
 
 		 800 aa  97.8  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  21.76 
 
 		 865 aa  96.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  21.81 
 
 		 881 aa  95.9  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  20.31 
 
 		 787 aa  94.4  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  23.43 
 
 		 789 aa  93.6  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  19.04 
 
 		 791 aa  91.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.01 
 
 		 762 aa  90.1  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  20.13 
 
 		 752 aa  89.7  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  23.86 
 
 		 692 aa  88.2  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  18.81 
 
 		 771 aa  87.4  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0528  RND superfamily transporter  22.19 
 
 		 789 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  18.87 
 
 		 778 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.02 
 
 		 776 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  20.82 
 
 		 808 aa  85.1  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  21.76 
 
 		 783 aa  84.7  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  19.97 
 
 		 767 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  19.49 
 
 		 805 aa  84  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  19.49 
 
 		 805 aa  84  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  19.82 
 
 		 772 aa  84  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  21.93 
 
 		 797 aa  84  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2562  RND efflux transporter  22.36 
 
 		 697 aa  84  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  21.53 
 
 		 787 aa  83.2  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  18.81 
 
 		 797 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  21.64 
 
 		 797 aa  82.4  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  18.75 
 
 		 794 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  19.85 
 
 		 784 aa  81.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  19.09 
 
 		 771 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  18.79 
 
 		 771 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  20.24 
 
 		 831 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  17.74 
 
 		 796 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  19.93 
 
 		 806 aa  80.1  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  18.4 
 
 		 796 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.39 
 
 		 812 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  18.92 
 
 		 771 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  18.92 
 
 		 771 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  18.92 
 
 		 771 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>