287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1941 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  45.27 
 
 		 799 aa  701    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  43.04 
 
 		 826 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  43.26 
 
 		 787 aa  652    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  45.27 
 
 		 799 aa  702    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  65.58 
 
 		 772 aa  1038    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  44.95 
 
 		 787 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  83.4 
 
 		 771 aa  1301    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  82.75 
 
 		 771 aa  1305    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  45.53 
 
 		 796 aa  697    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  83.53 
 
 		 771 aa  1304    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  44.92 
 
 		 796 aa  687    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  47.84 
 
 		 784 aa  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  50.06 
 
 		 784 aa  773    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  44.32 
 
 		 794 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  43.36 
 
 		 820 aa  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  45.27 
 
 		 799 aa  697    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  45.4 
 
 		 799 aa  704    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  45.74 
 
 		 790 aa  704    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  81.01 
 
 		 769 aa  1261    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  88.05 
 
 		 770 aa  1377    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  83.53 
 
 		 771 aa  1305    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  100 
 
 		 767 aa  1555    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  66.02 
 
 		 771 aa  1024    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  83.27 
 
 		 771 aa  1311    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  83.27 
 
 		 771 aa  1311    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  86.18 
 
 		 767 aa  1341    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  82.79 
 
 		 768 aa  1280    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  87.92 
 
 		 772 aa  1390    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  46 
 
 		 793 aa  705    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  82.75 
 
 		 771 aa  1284    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  82.88 
 
 		 771 aa  1308    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  42.86 
 
 		 799 aa  641    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  83.53 
 
 		 771 aa  1305    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  81.41 
 
 		 768 aa  1273    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  43.34 
 
 		 795 aa  652    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  44.31 
 
 		 813 aa  633  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  42.71 
 
 		 808 aa  630  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  43.17 
 
 		 816 aa  625  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  42.49 
 
 		 821 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  42.62 
 
 		 821 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  42.78 
 
 		 794 aa  624  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  43.29 
 
 		 783 aa  624  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  42.06 
 
 		 831 aa  618  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  41.53 
 
 		 834 aa  611  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  43.8 
 
 		 810 aa  601  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  41.72 
 
 		 808 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  40.73 
 
 		 786 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  39.69 
 
 		 786 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  40.73 
 
 		 786 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  41 
 
 		 804 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  40.96 
 
 		 799 aa  581  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  41.94 
 
 		 786 aa  582  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  40.23 
 
 		 786 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  39.58 
 
 		 827 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  41.55 
 
 		 797 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  41.19 
 
 		 786 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  40.52 
 
 		 786 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  40.52 
 
 		 786 aa  572  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  40.52 
 
 		 786 aa  572  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  40.18 
 
 		 804 aa  557  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  39.28 
 
 		 813 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  40.25 
 
 		 813 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  39.92 
 
 		 809 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  27.24 
 
 		 808 aa  292  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  27.79 
 
 		 799 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  25.71 
 
 		 797 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  26.78 
 
 		 791 aa  270  8.999999999999999e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  28.21 
 
 		 796 aa  269  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  23.51 
 
 		 790 aa  253  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  25.29 
 
 		 792 aa  248  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  24.37 
 
 		 830 aa  228  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  22.68 
 
 		 805 aa  220  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  22.55 
 
 		 806 aa  219  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  24.97 
 
 		 805 aa  219  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  24.97 
 
 		 805 aa  219  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.21 
 
 		 764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.78 
 
 		 1051 aa  142  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.85 
 
 		 773 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  22.12 
 
 		 788 aa  127  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  19.49 
 
 		 808 aa  117  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.7 
 
 		 831 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  21.88 
 
 		 792 aa  110  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  24.32 
 
 		 905 aa  106  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.13 
 
 		 806 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  22.43 
 
 		 804 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  21.13 
 
 		 767 aa  100  7e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.84 
 
 		 755 aa  100  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.34 
 
 		 803 aa  98.6  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.77 
 
 		 807 aa  98.6  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  22.97 
 
 		 864 aa  92  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  21.14 
 
 		 869 aa  92  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  20.52 
 
 		 811 aa  91.7  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  21.84 
 
 		 869 aa  91.3  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  19.46 
 
 		 727 aa  88.6  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  21.36 
 
 		 674 aa  84.3  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.97 
 
 		 778 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  21.5 
 
 		 674 aa  82.4  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  21.17 
 
 		 765 aa  82  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  19.92 
 
 		 779 aa  81.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  21.92 
 
 		 764 aa  79.7  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>