227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0645 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  59.2 
 
 		 821 aa  905    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  47.54 
 
 		 799 aa  739    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  57.05 
 
 		 826 aa  873    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  48.16 
 
 		 799 aa  738    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  48.03 
 
 		 784 aa  717    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  46.83 
 
 		 787 aa  715    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  49.23 
 
 		 796 aa  753    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  49.87 
 
 		 796 aa  751    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  48.39 
 
 		 794 aa  732    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  60.1 
 
 		 808 aa  924    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  57.95 
 
 		 831 aa  914    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  56.31 
 
 		 809 aa  793    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  49.81 
 
 		 790 aa  740    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  47.79 
 
 		 799 aa  740    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  56 
 
 		 808 aa  823    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  100 
 
 		 834 aa  1685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  48.87 
 
 		 793 aa  738    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  60.03 
 
 		 821 aa  917    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  53.95 
 
 		 799 aa  838    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  47.34 
 
 		 795 aa  692    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  56.05 
 
 		 813 aa  804    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  56.4 
 
 		 813 aa  814    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  57.39 
 
 		 813 aa  854    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  60.7 
 
 		 827 aa  961    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  47.54 
 
 		 799 aa  739    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  41.89 
 
 		 772 aa  619  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  43.21 
 
 		 771 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  43.21 
 
 		 771 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  42.65 
 
 		 771 aa  618  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  42.3 
 
 		 771 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  42.3 
 
 		 771 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  42.3 
 
 		 771 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  42.43 
 
 		 771 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  42.17 
 
 		 771 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  42.65 
 
 		 768 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  42.32 
 
 		 771 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  41.67 
 
 		 767 aa  602  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  42.01 
 
 		 769 aa  592  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  41.3 
 
 		 770 aa  595  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  40.94 
 
 		 767 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  40.03 
 
 		 768 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  40.23 
 
 		 772 aa  569  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  40.21 
 
 		 771 aa  557  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  37.86 
 
 		 784 aa  540  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  38.36 
 
 		 820 aa  534  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  35.91 
 
 		 816 aa  500  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  38.93 
 
 		 810 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  36.46 
 
 		 787 aa  478  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  36.8 
 
 		 794 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  36.27 
 
 		 783 aa  466  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  36.04 
 
 		 786 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  35.99 
 
 		 786 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  35.99 
 
 		 786 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  35.9 
 
 		 786 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  36.12 
 
 		 786 aa  445  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  35.94 
 
 		 804 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  36.21 
 
 		 786 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  34.39 
 
 		 786 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  34.52 
 
 		 786 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  34.52 
 
 		 786 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  35.52 
 
 		 804 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  34.92 
 
 		 799 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  34.36 
 
 		 797 aa  412  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  28.97 
 
 		 791 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  25.96 
 
 		 797 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  27.94 
 
 		 799 aa  266  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  26.5 
 
 		 792 aa  261  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  26.55 
 
 		 808 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  26.32 
 
 		 790 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  26.55 
 
 		 796 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  25.41 
 
 		 830 aa  223  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  26.33 
 
 		 805 aa  213  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  26.33 
 
 		 805 aa  213  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  24.35 
 
 		 806 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  24.35 
 
 		 805 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.9 
 
 		 764 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  19.09 
 
 		 808 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.42 
 
 		 1051 aa  94.7  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  20.64 
 
 		 788 aa  93.6  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  18.96 
 
 		 831 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  23.53 
 
 		 778 aa  85.5  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  23.32 
 
 		 727 aa  82  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  18.87 
 
 		 773 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  18.43 
 
 		 806 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  20.15 
 
 		 905 aa  76.6  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.74 
 
 		 804 aa  72.8  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  23.27 
 
 		 869 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  23.27 
 
 		 869 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  20.41 
 
 		 803 aa  66.6  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  23.06 
 
 		 861 aa  65.9  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  22.97 
 
 		 737 aa  65.1  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  22.22 
 
 		 898 aa  63.9  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  21.88 
 
 		 694 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  21.39 
 
 		 805 aa  62.4  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  21.6 
 
 		 674 aa  62  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  28.15 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  20.35 
 
 		 748 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  26.67 
 
 		 385 aa  60.1  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  19.12 
 
 		 755 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.09 
 
 		 807 aa  60.1  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>