More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3150 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  63.25 
 
 		 748 aa  1009    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  100 
 
 		 755 aa  1541    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  54.34 
 
 		 812 aa  802    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  43.9 
 
 		 778 aa  646    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  33.74 
 
 		 752 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  32.83 
 
 		 756 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  32.66 
 
 		 758 aa  432  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  33.73 
 
 		 777 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  33.88 
 
 		 752 aa  415  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  32.74 
 
 		 747 aa  412  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  33.38 
 
 		 777 aa  409  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  32.13 
 
 		 746 aa  396  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  31.28 
 
 		 864 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  26.01 
 
 		 687 aa  236  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  23.34 
 
 		 821 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  25.77 
 
 		 865 aa  214  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  23.48 
 
 		 889 aa  211  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  24.58 
 
 		 764 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  29.03 
 
 		 385 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  28.61 
 
 		 385 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  28.03 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  28.34 
 
 		 380 aa  154  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  25.81 
 
 		 388 aa  147  9e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  28.12 
 
 		 921 aa  144  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  29.75 
 
 		 387 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  23.64 
 
 		 1359 aa  137  7.000000000000001e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  24.91 
 
 		 842 aa  125  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.84 
 
 		 1051 aa  121  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  23.73 
 
 		 895 aa  117  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  22.02 
 
 		 773 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  25.43 
 
 		 862 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  21.77 
 
 		 923 aa  111  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  22.24 
 
 		 1011 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.56 
 
 		 872 aa  107  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  19.51 
 
 		 755 aa  106  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  17.75 
 
 		 806 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  21.5 
 
 		 805 aa  104  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.76 
 
 		 831 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  23.42 
 
 		 807 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  22.28 
 
 		 835 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  21.2 
 
 		 825 aa  94.4  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  20.33 
 
 		 813 aa  92.8  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  18.89 
 
 		 796 aa  91.3  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.62 
 
 		 905 aa  90.5  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  22.46 
 
 		 855 aa  89.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  21.34 
 
 		 779 aa  88.2  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  20.41 
 
 		 788 aa  87.4  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  22.28 
 
 		 898 aa  85.9  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  24.31 
 
 		 832 aa  85.9  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  20.28 
 
 		 821 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  28.44 
 
 		 1204 aa  85.1  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  19.68 
 
 		 778 aa  84.7  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  23.68 
 
 		 981 aa  84.3  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  18.85 
 
 		 792 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.4 
 
 		 807 aa  84  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  20.85 
 
 		 803 aa  82.8  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  19.67 
 
 		 800 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  20.63 
 
 		 815 aa  82  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  20.3 
 
 		 786 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  25.08 
 
 		 861 aa  81.6  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  21.58 
 
 		 811 aa  81.3  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  20.74 
 
 		 828 aa  80.5  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  21.29 
 
 		 816 aa  80.1  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  20.48 
 
 		 786 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  20.34 
 
 		 1022 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  20.48 
 
 		 786 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  24.79 
 
 		 1013 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  20.34 
 
 		 1022 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  20.75 
 
 		 756 aa  78.6  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  21.36 
 
 		 799 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  27.95 
 
 		 874 aa  78.2  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  26.86 
 
 		 767 aa  77.8  0.0000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  18.33 
 
 		 808 aa  77.8  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  22 
 
 		 800 aa  77.4  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  29.44 
 
 		 1131 aa  77  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  20.25 
 
 		 815 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.98 
 
 		 704 aa  76.3  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  33.33 
 
 		 1109 aa  75.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  19.52 
 
 		 786 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  20.58 
 
 		 1028 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  18.5 
 
 		 788 aa  75.5  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  20.1 
 
 		 1040 aa  75.1  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  19.83 
 
 		 786 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  20.7 
 
 		 824 aa  74.3  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  23.62 
 
 		 974 aa  73.9  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  20.67 
 
 		 821 aa  73.9  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  19.59 
 
 		 789 aa  73.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  20.42 
 
 		 786 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  20.42 
 
 		 786 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  21.69 
 
 		 681 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  20.04 
 
 		 816 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  24.06 
 
 		 974 aa  70.5  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  23.69 
 
 		 794 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  21.35 
 
 		 764 aa  69.7  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  20.1 
 
 		 787 aa  68.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  22.09 
 
 		 791 aa  68.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.04 
 
 		 804 aa  68.2  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  20.95 
 
 		 763 aa  67.4  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  27.03 
 
 		 879 aa  67.4  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  30.29 
 
 		 1128 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>