More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1805 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  62.03 
 
 		 803 aa  959    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  100 
 
 		 804 aa  1632    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  57.2 
 
 		 788 aa  877    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  38.77 
 
 		 808 aa  601  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  40.29 
 
 		 773 aa  592  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  38.97 
 
 		 806 aa  580  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  36.94 
 
 		 831 aa  559  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  23.62 
 
 		 755 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  25.36 
 
 		 778 aa  225  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  26.24 
 
 		 807 aa  215  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.22 
 
 		 764 aa  211  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  22.57 
 
 		 835 aa  187  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.57 
 
 		 837 aa  187  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  22.37 
 
 		 815 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  23.3 
 
 		 821 aa  169  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  23.06 
 
 		 807 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  22.28 
 
 		 789 aa  162  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  22.14 
 
 		 816 aa  161  4e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  21.37 
 
 		 756 aa  159  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  23.04 
 
 		 792 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  24.17 
 
 		 828 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  21.03 
 
 		 825 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  20.51 
 
 		 779 aa  152  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  21.78 
 
 		 801 aa  151  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.51 
 
 		 1051 aa  147  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  22.59 
 
 		 813 aa  145  4e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  24.22 
 
 		 799 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  23.29 
 
 		 764 aa  144  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  23.24 
 
 		 800 aa  144  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  21.53 
 
 		 872 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  21.96 
 
 		 791 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  20.31 
 
 		 811 aa  138  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  22.55 
 
 		 800 aa  136  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  23.63 
 
 		 823 aa  136  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  22.72 
 
 		 813 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  25.42 
 
 		 799 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  24.46 
 
 		 796 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  22.89 
 
 		 823 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  21.22 
 
 		 826 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  24.37 
 
 		 796 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  25.25 
 
 		 799 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.29 
 
 		 967 aa  131  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  23.91 
 
 		 794 aa  131  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  22.95 
 
 		 815 aa  131  6e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  25.25 
 
 		 799 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  22.67 
 
 		 790 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  21.79 
 
 		 821 aa  130  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  22.77 
 
 		 823 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  23.52 
 
 		 768 aa  127  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  22.72 
 
 		 793 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  24.83 
 
 		 799 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  19.75 
 
 		 784 aa  127  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  24.18 
 
 		 905 aa  127  9e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  24 
 
 		 821 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  21.81 
 
 		 795 aa  126  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  22.64 
 
 		 784 aa  125  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  23.29 
 
 		 808 aa  125  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  20.97 
 
 		 763 aa  124  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.34 
 
 		 762 aa  123  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  22.13 
 
 		 772 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  23.17 
 
 		 824 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  20.92 
 
 		 792 aa  122  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  22.6 
 
 		 767 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  20.55 
 
 		 799 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  23.16 
 
 		 751 aa  119  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  20.68 
 
 		 797 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  20.03 
 
 		 752 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  21.53 
 
 		 770 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  22.42 
 
 		 752 aa  114  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  23.19 
 
 		 771 aa  114  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  21.15 
 
 		 820 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  20.9 
 
 		 831 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  21.43 
 
 		 830 aa  113  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  22.59 
 
 		 768 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  25.13 
 
 		 787 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  19.65 
 
 		 790 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  19.67 
 
 		 789 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  20.39 
 
 		 816 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  23 
 
 		 772 aa  112  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  23.13 
 
 		 821 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  22.31 
 
 		 727 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  20.94 
 
 		 788 aa  109  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  20.55 
 
 		 813 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  23.13 
 
 		 767 aa  110  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  19.89 
 
 		 785 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  20.52 
 
 		 797 aa  108  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  22.83 
 
 		 787 aa  109  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  21.92 
 
 		 771 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  22.4 
 
 		 786 aa  108  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  21.09 
 
 		 786 aa  108  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  23.3 
 
 		 771 aa  107  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  20.03 
 
 		 788 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  20.61 
 
 		 834 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  20.13 
 
 		 788 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.83 
 
 		 747 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  21.88 
 
 		 771 aa  105  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  21.88 
 
 		 771 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  21.88 
 
 		 771 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  21.36 
 
 		 804 aa  104  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  20.33 
 
 		 796 aa  104  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>