267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1526 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  100 
 
 		 756 aa  1495    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  54.92 
 
 		 751 aa  731    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  43.33 
 
 		 763 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  29.39 
 
 		 755 aa  267  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  25.9 
 
 		 778 aa  217  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  26.89 
 
 		 807 aa  210  7e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  26.5 
 
 		 837 aa  194  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.8 
 
 		 764 aa  189  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  25.43 
 
 		 800 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  25.07 
 
 		 779 aa  183  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  24.32 
 
 		 815 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.29 
 
 		 808 aa  177  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  25.2 
 
 		 811 aa  177  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  25.71 
 
 		 831 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  23.83 
 
 		 792 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  23.61 
 
 		 789 aa  165  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  23.62 
 
 		 806 aa  160  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.28 
 
 		 788 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  25.51 
 
 		 824 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1083 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  25.59 
 
 		 821 aa  139  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  22.72 
 
 		 764 aa  138  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  23.26 
 
 		 807 aa  138  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  23.55 
 
 		 765 aa  137  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  24.39 
 
 		 872 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.39 
 
 		 967 aa  134  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  25.73 
 
 		 835 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  22.46 
 
 		 773 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  26.17 
 
 		 825 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  22.3 
 
 		 816 aa  127  8.000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  22.28 
 
 		 779 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  22.16 
 
 		 828 aa  125  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  23.59 
 
 		 823 aa  125  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.88 
 
 		 762 aa  125  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  23.73 
 
 		 801 aa  121  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  23.72 
 
 		 1051 aa  118  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  22.86 
 
 		 823 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  21.39 
 
 		 804 aa  115  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  22.74 
 
 		 823 aa  114  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  21.31 
 
 		 813 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  24.89 
 
 		 865 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.05 
 
 		 717 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  21.9 
 
 		 821 aa  113  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  24.57 
 
 		 860 aa  112  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  20.88 
 
 		 815 aa  111  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  24.06 
 
 		 788 aa  109  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.98 
 
 		 803 aa  107  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.82 
 
 		 905 aa  102  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  21.52 
 
 		 800 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.72 
 
 		 723 aa  95.9  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  17.95 
 
 		 767 aa  94.4  6e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  36.36 
 
 		 859 aa  94  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  23.68 
 
 		 808 aa  94  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  23.4 
 
 		 792 aa  93.2  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  21.92 
 
 		 791 aa  91.3  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  23.72 
 
 		 881 aa  90.5  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  23.93 
 
 		 877 aa  89.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  20.9 
 
 		 869 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  21.37 
 
 		 797 aa  89  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  21.96 
 
 		 778 aa  89  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  20.78 
 
 		 869 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  23.6 
 
 		 1204 aa  88.6  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  21.06 
 
 		 674 aa  88.6  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  21.34 
 
 		 674 aa  88.6  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  21.86 
 
 		 861 aa  88.2  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  22.17 
 
 		 694 aa  88.2  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  23.05 
 
 		 752 aa  87  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  22.9 
 
 		 787 aa  84.7  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  23.36 
 
 		 832 aa  84.3  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  21.36 
 
 		 788 aa  84  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  22.43 
 
 		 694 aa  84  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  21.24 
 
 		 898 aa  83.2  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  21.23 
 
 		 788 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  21.19 
 
 		 789 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  24.79 
 
 		 784 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.1 
 
 		 758 aa  80.9  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  22.56 
 
 		 895 aa  80.9  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  20 
 
 		 727 aa  80.5  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  20.99 
 
 		 1359 aa  79.7  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  21.33 
 
 		 789 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  24.36 
 
 		 874 aa  76.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  24.12 
 
 		 772 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  22.65 
 
 		 804 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  22.56 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  23.81 
 
 		 799 aa  73.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  20.13 
 
 		 692 aa  73.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  22.15 
 
 		 777 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.95 
 
 		 776 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  19.64 
 
 		 755 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  22.68 
 
 		 794 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  20.83 
 
 		 805 aa  72  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  20.65 
 
 		 797 aa  72  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  21.14 
 
 		 790 aa  70.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  23.35 
 
 		 790 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  21.25 
 
 		 689 aa  69.3  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  21.9 
 
 		 799 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20 
 
 		 746 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  20.16 
 
 		 785 aa  69.7  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  19.84 
 
 		 756 aa  69.7  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  22.42 
 
 		 783 aa  69.3  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>