More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1297 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  762    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  53.87 
 
 
385 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  52.8 
 
 
385 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  53.6 
 
 
385 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  50.79 
 
 
388 aa  418  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  51.19 
 
 
387 aa  383  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  28.65 
 
 
748 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  27.93 
 
 
778 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  28.34 
 
 
755 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  27.63 
 
 
764 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  24.78 
 
 
752 aa  135  9e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  27.3 
 
 
874 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  26.09 
 
 
752 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  27.57 
 
 
747 aa  126  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  28 
 
 
812 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  25.34 
 
 
777 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  25.89 
 
 
758 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  26.51 
 
 
1359 aa  116  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  27.43 
 
 
832 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  31.23 
 
 
855 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  24.33 
 
 
864 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  24.94 
 
 
1204 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  27.11 
 
 
1011 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  25.21 
 
 
746 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  24.34 
 
 
905 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.99 
 
 
756 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  25 
 
 
777 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  24.47 
 
 
861 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  35.85 
 
 
862 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  25.09 
 
 
895 aa  99.4  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  34.78 
 
 
845 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  35.38 
 
 
1109 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  37.67 
 
 
872 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  34.09 
 
 
1131 aa  92.8  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  21.72 
 
 
808 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  30.25 
 
 
923 aa  90.1  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  28.5 
 
 
842 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  38.06 
 
 
862 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  27.21 
 
 
805 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  24.23 
 
 
787 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  23.87 
 
 
816 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  29.2 
 
 
835 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  26.18 
 
 
815 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  24.27 
 
 
821 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  32.43 
 
 
1022 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  32.43 
 
 
1022 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  23.74 
 
 
865 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  32.43 
 
 
681 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  32.43 
 
 
1040 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  21.48 
 
 
898 aa  82.8  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  28 
 
 
893 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  22.99 
 
 
821 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  31.76 
 
 
1028 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  24.06 
 
 
807 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  22.31 
 
 
803 aa  80.1  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  29.48 
 
 
825 aa  79.7  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  33.78 
 
 
709 aa  80.1  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 
695 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  26.89 
 
 
821 aa  79.3  0.00000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  23.47 
 
 
981 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.63 
 
 
1045 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  30.99 
 
 
839 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  20.88 
 
 
881 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.89 
 
 
755 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  23.69 
 
 
685 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.51 
 
 
837 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  19.57 
 
 
815 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  23.55 
 
 
859 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  22.31 
 
 
771 aa  77  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  22.31 
 
 
771 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  25.46 
 
 
674 aa  76.6  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  33.83 
 
 
843 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  22.31 
 
 
771 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  22.31 
 
 
771 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  34.29 
 
 
879 aa  76.3  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1909  hypothetical protein  32.65 
 
 
692 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00515667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  19.94 
 
 
778 aa  76.3  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  28.41 
 
 
920 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.61 
 
 
773 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  30.13 
 
 
1013 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  24.44 
 
 
800 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  29.89 
 
 
972 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  26.32 
 
 
974 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  22.56 
 
 
756 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  27.68 
 
 
692 aa  74.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  29.61 
 
 
899 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.17 
 
 
1226 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  22.9 
 
 
767 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  24.43 
 
 
908 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  23.92 
 
 
831 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.31 
 
 
883 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  23.19 
 
 
729 aa  73.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  21.76 
 
 
830 aa  73.2  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.31 
 
 
883 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1709  hypothetical protein  25 
 
 
688 aa  73.2  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  27 
 
 
699 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.36 
 
 
812 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  23.67 
 
 
889 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.16 
 
 
1291 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  25.37 
 
 
767 aa  71.6  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>