More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6559 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  100 
 
 		 812 aa  1583    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  42.89 
 
 		 713 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  39.43 
 
 		 730 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  42.29 
 
 		 699 aa  472  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  41.29 
 
 		 712 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  48.37 
 
 		 701 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  40 
 
 		 699 aa  438  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  40.58 
 
 		 745 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  40.34 
 
 		 709 aa  426  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  39.5 
 
 		 699 aa  422  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  40 
 
 		 682 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  37.61 
 
 		 753 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  39.61 
 
 		 702 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  37.7 
 
 		 737 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  39.09 
 
 		 778 aa  405  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  38.77 
 
 		 706 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  40.31 
 
 		 714 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  35.94 
 
 		 702 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  36.92 
 
 		 733 aa  369  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  45.51 
 
 		 714 aa  366  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  37.9 
 
 		 780 aa  362  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  39.86 
 
 		 576 aa  348  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.86 
 
 		 697 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  37.94 
 
 		 764 aa  330  6e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  35.58 
 
 		 750 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  37.23 
 
 		 775 aa  324  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  37.84 
 
 		 713 aa  324  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  41.27 
 
 		 700 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  38.8 
 
 		 674 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  38.8 
 
 		 674 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  38.63 
 
 		 674 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  37.39 
 
 		 727 aa  311  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  40.39 
 
 		 707 aa  300  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  39.07 
 
 		 679 aa  293  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  42.79 
 
 		 762 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  38.54 
 
 		 678 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  37.91 
 
 		 673 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  38.43 
 
 		 704 aa  288  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  40.46 
 
 		 686 aa  273  9e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  38.93 
 
 		 708 aa  260  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  28.83 
 
 		 713 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  35 
 
 		 711 aa  254  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  29.33 
 
 		 743 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  29.33 
 
 		 743 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  28.64 
 
 		 743 aa  251  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  29.15 
 
 		 743 aa  250  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  29.08 
 
 		 743 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  29.2 
 
 		 743 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  28.88 
 
 		 743 aa  247  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  28.57 
 
 		 743 aa  244  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  29.38 
 
 		 743 aa  241  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  29.38 
 
 		 743 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  47.93 
 
 		 339 aa  234  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  36.51 
 
 		 358 aa  207  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  29.54 
 
 		 882 aa  197  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  30.59 
 
 		 747 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  24.97 
 
 		 723 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  52.82 
 
 		 777 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  29.09 
 
 		 719 aa  170  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  27.65 
 
 		 726 aa  160  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  27.7 
 
 		 920 aa  146  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  27.96 
 
 		 717 aa  146  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  26.92 
 
 		 794 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  38.16 
 
 		 974 aa  139  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  42.86 
 
 		 712 aa  134  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  40.21 
 
 		 1077 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  25.78 
 
 		 746 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  24.84 
 
 		 704 aa  131  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  39.67 
 
 		 1146 aa  131  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  28.75 
 
 		 766 aa  130  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  27.16 
 
 		 781 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.69 
 
 		 724 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  39.36 
 
 		 974 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  35.92 
 
 		 981 aa  128  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  39.71 
 
 		 740 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  28.7 
 
 		 741 aa  127  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  27.15 
 
 		 778 aa  126  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  30.11 
 
 		 724 aa  125  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  27.13 
 
 		 842 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  28.73 
 
 		 718 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  24.62 
 
 		 740 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.15 
 
 		 740 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  31.95 
 
 		 1054 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  26.45 
 
 		 740 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  43.46 
 
 		 1001 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  42.56 
 
 		 998 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  42.56 
 
 		 998 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  42.56 
 
 		 998 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  29.57 
 
 		 714 aa  121  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  42.35 
 
 		 1000 aa  121  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  39.73 
 
 		 1089 aa  119  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  37.78 
 
 		 948 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  27.16 
 
 		 903 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  27.56 
 
 		 737 aa  116  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  25.74 
 
 		 1013 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40 
 
 		 736 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  46.36 
 
 		 1013 aa  115  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  27.74 
 
 		 1040 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  28 
 
 		 723 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  27.85 
 
 		 832 aa  114  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>