More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4247 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 726 aa  1413    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  44.9 
 
 		 740 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  43.71 
 
 		 723 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  45.17 
 
 		 719 aa  464  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  41.29 
 
 		 747 aa  419  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.11 
 
 		 736 aa  329  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  34.26 
 
 		 709 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  26.74 
 
 		 713 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  29.72 
 
 		 743 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  29.67 
 
 		 743 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  29.26 
 
 		 743 aa  269  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  29.53 
 
 		 743 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  29.26 
 
 		 743 aa  269  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  29.08 
 
 		 743 aa  269  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  28.75 
 
 		 743 aa  267  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  29.59 
 
 		 743 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  29.22 
 
 		 743 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  29.53 
 
 		 743 aa  260  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  30.4 
 
 		 730 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  31.75 
 
 		 745 aa  250  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  31.67 
 
 		 712 aa  249  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  33.38 
 
 		 674 aa  244  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  33.38 
 
 		 674 aa  244  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  31.59 
 
 		 713 aa  243  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  33.23 
 
 		 674 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  31.79 
 
 		 699 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  31.52 
 
 		 712 aa  228  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  31.18 
 
 		 702 aa  223  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  33.51 
 
 		 576 aa  222  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  32.37 
 
 		 699 aa  219  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  31.42 
 
 		 682 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  31.36 
 
 		 706 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  29.86 
 
 		 753 aa  214  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  30.81 
 
 		 699 aa  209  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  30.28 
 
 		 778 aa  208  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.89 
 
 		 697 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  28.28 
 
 		 737 aa  201  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  30.73 
 
 		 714 aa  201  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  26.07 
 
 		 882 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  27.66 
 
 		 981 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  27.87 
 
 		 974 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  32.72 
 
 		 679 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  32.25 
 
 		 726 aa  197  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  32.33 
 
 		 750 aa  197  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  32.06 
 
 		 678 aa  194  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  29.22 
 
 		 702 aa  194  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  32.13 
 
 		 701 aa  193  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  29.63 
 
 		 778 aa  191  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  31.95 
 
 		 714 aa  189  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  28.85 
 
 		 717 aa  189  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  34.25 
 
 		 686 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  26.08 
 
 		 974 aa  187  8e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  29.71 
 
 		 737 aa  186  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  26.62 
 
 		 735 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  28.81 
 
 		 775 aa  181  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.48 
 
 		 812 aa  180  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  28.49 
 
 		 743 aa  180  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  30.24 
 
 		 707 aa  178  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  30.92 
 
 		 723 aa  177  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  29.97 
 
 		 780 aa  177  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  30.35 
 
 		 673 aa  174  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  31.03 
 
 		 727 aa  171  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  29.55 
 
 		 733 aa  171  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  28.42 
 
 		 760 aa  170  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  30.61 
 
 		 718 aa  170  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  27.78 
 
 		 734 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  27.63 
 
 		 832 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.31 
 
 		 735 aa  167  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  28.23 
 
 		 920 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  26.88 
 
 		 966 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  30.97 
 
 		 711 aa  164  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  27.85 
 
 		 758 aa  163  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  28.09 
 
 		 755 aa  163  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  26.51 
 
 		 836 aa  162  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  28.21 
 
 		 752 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.46 
 
 		 729 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  25.16 
 
 		 758 aa  161  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  29.62 
 
 		 1013 aa  161  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  28.88 
 
 		 983 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  28.88 
 
 		 983 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  30.99 
 
 		 728 aa  160  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  28.88 
 
 		 979 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  29.03 
 
 		 735 aa  159  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  29.21 
 
 		 978 aa  159  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  28.45 
 
 		 732 aa  158  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  23.32 
 
 		 829 aa  157  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  23.32 
 
 		 829 aa  157  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  30.7 
 
 		 968 aa  157  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  31.35 
 
 		 1077 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  30.06 
 
 		 704 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  26.66 
 
 		 740 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  26.51 
 
 		 710 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  29.81 
 
 		 700 aa  153  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  24.78 
 
 		 1049 aa  153  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  29.94 
 
 		 731 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  30.43 
 
 		 1002 aa  152  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  30.37 
 
 		 708 aa  151  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  26.81 
 
 		 704 aa  150  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  27.92 
 
 		 842 aa  150  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  28.66 
 
 		 1054 aa  150  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>