More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2920 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  57.8 
 
 		 714 aa  672    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  89.53 
 
 		 699 aa  1166    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 706 aa  1373    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  57.55 
 
 		 714 aa  615  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  45.61 
 
 		 699 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  46.44 
 
 		 713 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  42.26 
 
 		 753 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  45.77 
 
 		 702 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  47.4 
 
 		 701 aa  488  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  44.4 
 
 		 778 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  43.06 
 
 		 737 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  43.23 
 
 		 682 aa  485  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  44.17 
 
 		 745 aa  479  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  43.85 
 
 		 733 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  44.3 
 
 		 750 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  41.25 
 
 		 699 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  39.22 
 
 		 730 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  43.24 
 
 		 780 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  41.89 
 
 		 709 aa  438  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  43.42 
 
 		 697 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  39.77 
 
 		 702 aa  436  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  42.28 
 
 		 775 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  42.11 
 
 		 777 aa  425  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  42.7 
 
 		 727 aa  425  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  45.23 
 
 		 762 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  40.2 
 
 		 712 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  41.37 
 
 		 764 aa  409  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.41 
 
 		 812 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  41.5 
 
 		 713 aa  391  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  43.9 
 
 		 576 aa  388  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  41.36 
 
 		 700 aa  364  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  41.03 
 
 		 704 aa  337  5e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  41.29 
 
 		 707 aa  333  5e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  37.58 
 
 		 674 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  37.42 
 
 		 674 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  37.42 
 
 		 674 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  38.11 
 
 		 678 aa  297  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  39.58 
 
 		 708 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  41.07 
 
 		 686 aa  291  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  39.87 
 
 		 679 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  39.17 
 
 		 673 aa  277  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  28.73 
 
 		 713 aa  273  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  36.4 
 
 		 711 aa  270  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  33.24 
 
 		 712 aa  268  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  30.1 
 
 		 743 aa  251  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  44.9 
 
 		 339 aa  251  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  29.65 
 
 		 743 aa  251  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  30 
 
 		 743 aa  250  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  30 
 
 		 743 aa  250  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  29.58 
 
 		 743 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  29.72 
 
 		 743 aa  248  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  30 
 
 		 743 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  43.64 
 
 		 358 aa  246  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  29.9 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  29.47 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  30.07 
 
 		 743 aa  234  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  29.66 
 
 		 882 aa  209  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  29.01 
 
 		 740 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  31.33 
 
 		 726 aa  197  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  29 
 
 		 719 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  28.61 
 
 		 747 aa  185  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  29.83 
 
 		 778 aa  183  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  28.25 
 
 		 723 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  28.08 
 
 		 836 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  28.3 
 
 		 717 aa  167  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  25.95 
 
 		 758 aa  156  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  37.84 
 
 		 974 aa  153  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  28.7 
 
 		 842 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  25.15 
 
 		 737 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  23.57 
 
 		 704 aa  145  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  31.2 
 
 		 724 aa  144  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  36.2 
 
 		 981 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  37.1 
 
 		 974 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  26.4 
 
 		 710 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  27.31 
 
 		 934 aa  141  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  27.07 
 
 		 779 aa  141  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  25.48 
 
 		 743 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  27.39 
 
 		 718 aa  140  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  40.84 
 
 		 1077 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  28.7 
 
 		 726 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  27.25 
 
 		 734 aa  137  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  26.77 
 
 		 729 aa  137  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  27.82 
 
 		 832 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  26.26 
 
 		 732 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  25.5 
 
 		 740 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  48.47 
 
 		 998 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  36.61 
 
 		 1146 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  48.47 
 
 		 998 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  48.47 
 
 		 998 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  30.97 
 
 		 704 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  26.38 
 
 		 749 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  45.21 
 
 		 1001 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  26.99 
 
 		 781 aa  132  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  26.51 
 
 		 758 aa  131  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  28.2 
 
 		 740 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0027  MMPL domain protein  36.61 
 
 		 352 aa  129  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.232375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  44.62 
 
 		 1000 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  27.46 
 
 		 735 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  28.09 
 
 		 718 aa  128  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  28.15 
 
 		 741 aa  127  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>