More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11555 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  100 
 
 
1146 aa  2321    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  50.14 
 
 
1089 aa  999    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  49.45 
 
 
998 aa  946    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  49.7 
 
 
1062 aa  973    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  40.83 
 
 
1022 aa  689    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  49.45 
 
 
998 aa  946    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  49.7 
 
 
1062 aa  973    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  40.83 
 
 
1022 aa  689    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  49.65 
 
 
1000 aa  954    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  40.04 
 
 
1028 aa  652    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  52.16 
 
 
1002 aa  991    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  39.84 
 
 
1003 aa  667    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  40.08 
 
 
1013 aa  663    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  49.45 
 
 
998 aa  946    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  48.31 
 
 
1077 aa  1003    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  40.32 
 
 
1040 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  50.46 
 
 
1001 aa  949    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  31.34 
 
 
1011 aa  487  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  32.26 
 
 
1013 aa  452  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  28.16 
 
 
967 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  29.96 
 
 
941 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  28.33 
 
 
955 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  28.33 
 
 
955 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  28.33 
 
 
955 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  26.27 
 
 
962 aa  406  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  28.08 
 
 
968 aa  405  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  27.66 
 
 
944 aa  403  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  28.34 
 
 
948 aa  400  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  27.14 
 
 
959 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  28.04 
 
 
964 aa  395  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  27.29 
 
 
1001 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  27.47 
 
 
968 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  28.53 
 
 
957 aa  392  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  27.47 
 
 
968 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  27.59 
 
 
968 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  27.47 
 
 
968 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  27.46 
 
 
958 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  26.65 
 
 
968 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  27.59 
 
 
945 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  27.59 
 
 
945 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  27.66 
 
 
963 aa  369  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  36.12 
 
 
681 aa  355  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  27.86 
 
 
945 aa  343  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  27.45 
 
 
968 aa  331  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  43.39 
 
 
470 aa  314  5.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  25.66 
 
 
1054 aa  284  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  23.29 
 
 
1109 aa  281  6e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  23.72 
 
 
1109 aa  272  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  23.68 
 
 
1049 aa  268  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  25.62 
 
 
1068 aa  259  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  22.99 
 
 
1040 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  22.79 
 
 
1038 aa  239  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  23.82 
 
 
1038 aa  234  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  23.23 
 
 
1038 aa  221  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  23.14 
 
 
1041 aa  218  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  23.26 
 
 
1038 aa  217  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  22.71 
 
 
1038 aa  213  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  22.54 
 
 
1041 aa  212  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  24.02 
 
 
888 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  35.08 
 
 
397 aa  196  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  21.2 
 
 
1026 aa  177  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  37.45 
 
 
974 aa  168  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  38.27 
 
 
981 aa  164  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  37.04 
 
 
974 aa  160  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  36.43 
 
 
750 aa  152  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  28.22 
 
 
723 aa  148  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  33.33 
 
 
882 aa  145  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  40.09 
 
 
730 aa  144  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  42.86 
 
 
713 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  37.1 
 
 
576 aa  141  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  32.27 
 
 
713 aa  137  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  36.86 
 
 
753 aa  137  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  38.6 
 
 
764 aa  137  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  37.39 
 
 
743 aa  135  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  36.02 
 
 
743 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  36.02 
 
 
743 aa  134  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  36.02 
 
 
743 aa  134  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  36.02 
 
 
743 aa  134  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  38.49 
 
 
747 aa  133  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  36.29 
 
 
743 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  36.4 
 
 
743 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  33.82 
 
 
740 aa  132  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  43.59 
 
 
709 aa  132  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  43.79 
 
 
702 aa  131  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  35.17 
 
 
743 aa  131  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  34.75 
 
 
743 aa  131  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  36.59 
 
 
737 aa  130  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  44.74 
 
 
697 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  42.77 
 
 
702 aa  130  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  39.79 
 
 
699 aa  130  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  44.16 
 
 
701 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  38.91 
 
 
674 aa  128  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  38.91 
 
 
674 aa  128  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  38.91 
 
 
674 aa  128  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  36.52 
 
 
712 aa  127  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  40.45 
 
 
699 aa  127  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  29.49 
 
 
745 aa  127  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  44.08 
 
 
733 aa  127  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  36.02 
 
 
743 aa  127  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  40.27 
 
 
712 aa  127  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>