More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37330 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  51.95 
 
 		 737 aa  645    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  100 
 
 		 699 aa  1348    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  69.48 
 
 		 682 aa  842    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  51.76 
 
 		 753 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  53.49 
 
 		 733 aa  605  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  51.89 
 
 		 702 aa  600  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  50.66 
 
 		 775 aa  581  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  51.98 
 
 		 713 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  52.19 
 
 		 697 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  49.87 
 
 		 780 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  51.37 
 
 		 714 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  51.88 
 
 		 700 aa  550  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  49.64 
 
 		 702 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  50.27 
 
 		 750 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  49.13 
 
 		 745 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  50.65 
 
 		 714 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  49.53 
 
 		 777 aa  519  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  46.28 
 
 		 699 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  52.36 
 
 		 762 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  50.99 
 
 		 701 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  43.53 
 
 		 730 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  45.15 
 
 		 706 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  50.63 
 
 		 727 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  45.05 
 
 		 699 aa  487  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  47.2 
 
 		 778 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  45.02 
 
 		 709 aa  470  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  43.68 
 
 		 712 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  47.11 
 
 		 764 aa  462  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40 
 
 		 812 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  44.48 
 
 		 576 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  42.78 
 
 		 713 aa  398  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  42.54 
 
 		 674 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  42.54 
 
 		 674 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  42.54 
 
 		 674 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  43.08 
 
 		 707 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  59.63 
 
 		 358 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  63.44 
 
 		 339 aa  356  6.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  43.19 
 
 		 704 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  42.19 
 
 		 673 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  43.13 
 
 		 679 aa  335  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  41.18 
 
 		 678 aa  333  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  41.94 
 
 		 708 aa  323  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  41.4 
 
 		 686 aa  317  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  39.91 
 
 		 711 aa  308  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  29.39 
 
 		 713 aa  302  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  35.76 
 
 		 712 aa  289  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  31.29 
 
 		 743 aa  284  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  31.29 
 
 		 743 aa  284  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  31.56 
 
 		 743 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  31.43 
 
 		 743 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  31.16 
 
 		 743 aa  281  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  31.59 
 
 		 743 aa  279  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  31.63 
 
 		 743 aa  279  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  30.88 
 
 		 743 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  29.51 
 
 		 743 aa  267  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  31.43 
 
 		 743 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  29.26 
 
 		 723 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  30.01 
 
 		 747 aa  207  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  32.3 
 
 		 726 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  30.27 
 
 		 719 aa  189  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  27.51 
 
 		 740 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  38.77 
 
 		 974 aa  161  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  37.61 
 
 		 974 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  38.33 
 
 		 981 aa  153  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  43.72 
 
 		 1077 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  27.92 
 
 		 934 aa  147  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  40 
 
 		 1146 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  28.19 
 
 		 717 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.23 
 
 		 736 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.69 
 
 		 718 aa  142  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0027  MMPL domain protein  37.1 
 
 		 352 aa  140  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.232375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  30.1 
 
 		 766 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  27.99 
 
 		 758 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  27.4 
 
 		 794 aa  139  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  29.11 
 
 		 741 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  27.73 
 
 		 779 aa  135  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  27.39 
 
 		 740 aa  135  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  33.33 
 
 		 1054 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  35.14 
 
 		 882 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  25 
 
 		 746 aa  131  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  25.22 
 
 		 997 aa  131  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  26.54 
 
 		 737 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  28.83 
 
 		 717 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  50.68 
 
 		 1013 aa  130  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  44.85 
 
 		 1062 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  44.85 
 
 		 1062 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  46.98 
 
 		 1003 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  40.37 
 
 		 1001 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  31.36 
 
 		 724 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  43.81 
 
 		 998 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  43.81 
 
 		 998 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  43.81 
 
 		 998 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  38.97 
 
 		 1011 aa  129  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  26.8 
 
 		 836 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  29.14 
 
 		 731 aa  127  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  41.41 
 
 		 1002 aa  127  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  34.21 
 
 		 1040 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  37.85 
 
 		 1089 aa  126  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  34.4 
 
 		 959 aa  125  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2167  RND superfamily drug efflux protein  28.63 
 
 		 825 aa  124  8e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00341827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>