More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2167 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2167  RND superfamily drug efflux protein  100 
 
 
825 aa  1636    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00341827 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1445  integral membrane protein, putative  45.74 
 
 
493 aa  343  9e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.431426  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  31.17 
 
 
934 aa  181  7e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  27.79 
 
 
860 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1643  hypothetical protein  27.72 
 
 
866 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  26.17 
 
 
741 aa  144  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1450  hypothetical protein  28.6 
 
 
863 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  29.19 
 
 
674 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  29.01 
 
 
674 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  29.01 
 
 
674 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1580  hypothetical protein  37.77 
 
 
869 aa  125  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000620673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  27.29 
 
 
730 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  25.62 
 
 
738 aa  124  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  26.42 
 
 
699 aa  124  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  29.36 
 
 
702 aa  124  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  27.22 
 
 
727 aa  124  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  27.5 
 
 
753 aa  121  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  26.13 
 
 
723 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  25.34 
 
 
758 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  29.42 
 
 
704 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  26.3 
 
 
738 aa  119  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  25.48 
 
 
732 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  29.87 
 
 
699 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  36.56 
 
 
750 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  26.15 
 
 
718 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  28.42 
 
 
699 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  26.59 
 
 
701 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  27.08 
 
 
738 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  26.39 
 
 
978 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  24.91 
 
 
736 aa  110  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  26.56 
 
 
734 aa  110  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  26.79 
 
 
737 aa  110  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  38.51 
 
 
1077 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  26.88 
 
 
697 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  27.39 
 
 
733 aa  108  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  26.06 
 
 
717 aa  108  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  25.16 
 
 
983 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  25.16 
 
 
983 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  25.4 
 
 
979 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  36.2 
 
 
836 aa  106  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  24.87 
 
 
770 aa  106  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  37.23 
 
 
764 aa  105  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  22.61 
 
 
1155 aa  105  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  25.88 
 
 
731 aa  105  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  28.21 
 
 
682 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  22.73 
 
 
730 aa  104  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  34.92 
 
 
743 aa  104  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  36.02 
 
 
1146 aa  104  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  22.62 
 
 
730 aa  104  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  33.98 
 
 
743 aa  104  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  30.04 
 
 
974 aa  104  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  34.39 
 
 
743 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  33.01 
 
 
743 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  33.01 
 
 
743 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  25.85 
 
 
743 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  33.01 
 
 
743 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  33.01 
 
 
743 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  27.83 
 
 
761 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  25.81 
 
 
968 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  34.39 
 
 
743 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  31.15 
 
 
974 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  38.51 
 
 
1062 aa  102  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  38.51 
 
 
1062 aa  102  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  33.86 
 
 
743 aa  102  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  23.49 
 
 
738 aa  102  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  24.58 
 
 
740 aa  101  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  36.9 
 
 
780 aa  100  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  23.95 
 
 
832 aa  100  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  28.5 
 
 
893 aa  99.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  24.51 
 
 
793 aa  99.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  27.56 
 
 
706 aa  99.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  25.31 
 
 
729 aa  99  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  26.2 
 
 
775 aa  99.4  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  32.85 
 
 
743 aa  99  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  38.51 
 
 
702 aa  99.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  25.76 
 
 
731 aa  99  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  38.3 
 
 
339 aa  99  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  35.71 
 
 
712 aa  98.6  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  25.8 
 
 
758 aa  98.6  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  24.51 
 
 
734 aa  98.6  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  25.33 
 
 
728 aa  98.2  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  26.75 
 
 
731 aa  97.8  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  25.94 
 
 
713 aa  97.8  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  23.75 
 
 
751 aa  97.8  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.33 
 
 
723 aa  97.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  45.79 
 
 
700 aa  97.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  23.95 
 
 
717 aa  97.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  33.56 
 
 
981 aa  96.3  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  33.16 
 
 
740 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  24.22 
 
 
733 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  38 
 
 
1002 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  25.3 
 
 
766 aa  95.5  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  23.8 
 
 
743 aa  95.9  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  27.46 
 
 
726 aa  95.5  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  26.12 
 
 
710 aa  95.9  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  37.5 
 
 
679 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  21.76 
 
 
829 aa  95.1  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  38.46 
 
 
778 aa  95.5  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  21.76 
 
 
829 aa  95.1  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  25.85 
 
 
712 aa  95.1  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>