126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1445 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1445  integral membrane protein, putative  100 
 
 
493 aa  965    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.431426  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2167  RND superfamily drug efflux protein  45.34 
 
 
825 aa  337  2.9999999999999997e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00341827 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  26.84 
 
 
934 aa  65.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  28.18 
 
 
1049 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  24.06 
 
 
1146 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  28.48 
 
 
699 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  29.6 
 
 
804 aa  57.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  31.43 
 
 
898 aa  56.6  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  25.76 
 
 
967 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  19.28 
 
 
1013 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  28.85 
 
 
974 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  29.52 
 
 
738 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  26.62 
 
 
974 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  28.21 
 
 
709 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  32.46 
 
 
704 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  25.79 
 
 
1109 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  22.81 
 
 
737 aa  53.9  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  26.62 
 
 
981 aa  53.5  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  25.79 
 
 
1109 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  23.15 
 
 
1001 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  24.26 
 
 
805 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  22.79 
 
 
968 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  25.49 
 
 
741 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  32.04 
 
 
726 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  25.21 
 
 
685 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  31.25 
 
 
731 aa  50.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  20.4 
 
 
1003 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  22.51 
 
 
397 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  19.42 
 
 
1022 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  19.42 
 
 
1022 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  24.58 
 
 
860 aa  50.1  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  24.06 
 
 
893 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.71 
 
 
740 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1643  hypothetical protein  24.28 
 
 
866 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  31.82 
 
 
717 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  23.29 
 
 
385 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  22.96 
 
 
1054 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  25.33 
 
 
730 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1580  hypothetical protein  26.04 
 
 
869 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000620673 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  23.29 
 
 
385 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  23.53 
 
 
745 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  23.29 
 
 
385 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  24.29 
 
 
758 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1709  hypothetical protein  27.84 
 
 
688 aa  48.5  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  23.29 
 
 
968 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1480  hypothetical protein  23.08 
 
 
701 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0156637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  29.41 
 
 
841 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  36.36 
 
 
1040 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0027  MMPL domain protein  24.14 
 
 
352 aa  47.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.232375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  25.15 
 
 
747 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  27.5 
 
 
674 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  27.5 
 
 
674 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  21.15 
 
 
968 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  22.63 
 
 
958 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  26.36 
 
 
806 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  27.07 
 
 
778 aa  47  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  23.29 
 
 
832 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  29.13 
 
 
717 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  28.07 
 
 
701 aa  47  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  22.92 
 
 
714 aa  47  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  25.16 
 
 
795 aa  47  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  21.74 
 
 
836 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  28.72 
 
 
783 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  28.79 
 
 
1246 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  26.92 
 
 
972 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  25.41 
 
 
910 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  19.4 
 
 
1028 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  31.78 
 
 
775 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  27.66 
 
 
752 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  27.5 
 
 
674 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  30.48 
 
 
718 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  25.61 
 
 
861 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.64 
 
 
723 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  28.57 
 
 
1359 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  27.01 
 
 
1204 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  37.33 
 
 
724 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  25.17 
 
 
831 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  22.22 
 
 
1002 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  28.26 
 
 
945 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  26.24 
 
 
729 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  24.32 
 
 
777 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  22.46 
 
 
730 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  22.46 
 
 
730 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  25.52 
 
 
730 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  25.52 
 
 
730 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  30.13 
 
 
713 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  29.86 
 
 
712 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  22.46 
 
 
730 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  22.46 
 
 
730 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  22.46 
 
 
730 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  22.46 
 
 
730 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  25.83 
 
 
803 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  26.47 
 
 
747 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  25.32 
 
 
724 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 
766 aa  45.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  19.4 
 
 
1040 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  21.58 
 
 
948 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  30.34 
 
 
1038 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  22.46 
 
 
730 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  22.95 
 
 
794 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>