More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1630 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  100 
 
 
1246 aa  2485    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  39.11 
 
 
1002 aa  645    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  42.63 
 
 
1038 aa  432  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  43.61 
 
 
1041 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  38.46 
 
 
1038 aa  416  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  40 
 
 
1038 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  43.78 
 
 
1041 aa  412  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  42.98 
 
 
1038 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  43.1 
 
 
1038 aa  405  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2741  hypothetical protein  42.93 
 
 
810 aa  406  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  32.01 
 
 
1049 aa  400  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  38.2 
 
 
1054 aa  376  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  34.48 
 
 
1040 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  46.22 
 
 
888 aa  332  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  34.19 
 
 
1109 aa  331  7e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  34 
 
 
1109 aa  330  9e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  29.89 
 
 
1068 aa  258  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  28.38 
 
 
1026 aa  228  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  24.91 
 
 
1002 aa  164  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  24.19 
 
 
1013 aa  152  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  28.87 
 
 
915 aa  149  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  22.98 
 
 
974 aa  148  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2740  hypothetical protein  56.95 
 
 
165 aa  147  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0054266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  28.84 
 
 
911 aa  147  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  23.52 
 
 
981 aa  147  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  32.69 
 
 
955 aa  144  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  21.79 
 
 
974 aa  144  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  29.07 
 
 
923 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  28.2 
 
 
924 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  24.72 
 
 
1003 aa  141  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  23.77 
 
 
1022 aa  139  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  23.77 
 
 
1022 aa  139  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  22.59 
 
 
1000 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  27.9 
 
 
869 aa  137  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  28.6 
 
 
1111 aa  137  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  27.7 
 
 
869 aa  136  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  27.7 
 
 
869 aa  136  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  27.7 
 
 
869 aa  136  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  24.91 
 
 
1001 aa  133  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 
825 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  26.08 
 
 
988 aa  130  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  25.69 
 
 
1146 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  28 
 
 
1114 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  22.74 
 
 
1013 aa  129  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  23.44 
 
 
1089 aa  125  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  28.37 
 
 
699 aa  125  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  30.5 
 
 
819 aa  125  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  27.53 
 
 
1040 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  30.11 
 
 
1028 aa  122  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  30.11 
 
 
470 aa  122  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  23.9 
 
 
998 aa  121  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  23.9 
 
 
998 aa  121  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  23.9 
 
 
998 aa  121  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.07 
 
 
946 aa  120  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  22.9 
 
 
681 aa  119  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  23.96 
 
 
967 aa  119  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  20.41 
 
 
1011 aa  119  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  25.93 
 
 
1077 aa  119  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  27.25 
 
 
882 aa  118  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  23.87 
 
 
963 aa  113  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  26.11 
 
 
730 aa  112  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  30.47 
 
 
1037 aa  111  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  23.02 
 
 
882 aa  107  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  25.25 
 
 
1062 aa  107  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  25.25 
 
 
1062 aa  107  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  22.88 
 
 
958 aa  106  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  28.33 
 
 
941 aa  106  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0820  hypothetical protein  27.18 
 
 
863 aa  104  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  27.96 
 
 
623 aa  104  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  27.67 
 
 
948 aa  103  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  29.91 
 
 
968 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  29.91 
 
 
968 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  29.91 
 
 
968 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  28.22 
 
 
772 aa  103  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  25.1 
 
 
726 aa  101  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  25.48 
 
 
709 aa  101  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  25.12 
 
 
758 aa  100  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.3 
 
 
857 aa  99.4  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  26.83 
 
 
797 aa  99  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.82 
 
 
782 aa  98.2  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  31.98 
 
 
745 aa  96.3  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  26.24 
 
 
962 aa  96.3  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  22.13 
 
 
968 aa  96.3  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  27.91 
 
 
772 aa  95.1  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  27.92 
 
 
968 aa  95.1  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  22.7 
 
 
778 aa  93.2  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  25.51 
 
 
944 aa  93.2  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  26.69 
 
 
945 aa  92.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  26.69 
 
 
945 aa  92.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  26.78 
 
 
740 aa  92  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  23.91 
 
 
723 aa  92  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  25.89 
 
 
701 aa  90.9  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  26.36 
 
 
959 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  28.21 
 
 
968 aa  91.3  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  21.94 
 
 
968 aa  91.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  24.91 
 
 
576 aa  90.5  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  25.82 
 
 
955 aa  90.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  23.4 
 
 
699 aa  90.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  25.82 
 
 
955 aa  90.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  25.82 
 
 
955 aa  90.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>