130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0687 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  100 
 
 		 946 aa  1867    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  30.47 
 
 		 988 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  24.78 
 
 		 923 aa  282  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  24.33 
 
 		 924 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  25.36 
 
 		 869 aa  271  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  24.92 
 
 		 911 aa  270  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  30.79 
 
 		 882 aa  269  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  26.61 
 
 		 797 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 825 aa  267  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  25.23 
 
 		 869 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  25.23 
 
 		 869 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  25 
 
 		 869 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  24.78 
 
 		 915 aa  255  3e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.96 
 
 		 857 aa  249  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  30.19 
 
 		 819 aa  238  6e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  24.58 
 
 		 772 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.74 
 
 		 769 aa  217  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  31.67 
 
 		 782 aa  211  6e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  25.41 
 
 		 1111 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  24.97 
 
 		 1114 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1037 aa  201  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.64 
 
 		 737 aa  197  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  25.8 
 
 		 955 aa  194  6e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  30.27 
 
 		 759 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.45 
 
 		 692 aa  170  9e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  32.2 
 
 		 695 aa  160  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.57 
 
 		 785 aa  156  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.86 
 
 		 711 aa  154  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  24.46 
 
 		 789 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  25.42 
 
 		 623 aa  147  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  25.05 
 
 		 666 aa  146  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  25.05 
 
 		 666 aa  145  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.76 
 
 		 631 aa  145  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  26.04 
 
 		 666 aa  144  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  29.25 
 
 		 683 aa  144  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  25.62 
 
 		 666 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1246 aa  142  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  25.98 
 
 		 666 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  29.18 
 
 		 597 aa  142  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  25.47 
 
 		 666 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  25.83 
 
 		 666 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  25.83 
 
 		 666 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  24.84 
 
 		 663 aa  139  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  38.15 
 
 		 728 aa  138  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 		 733 aa  136  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.69 
 
 		 666 aa  130  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  27.42 
 
 		 512 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0820  hypothetical protein  23.75 
 
 		 863 aa  127  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.5 
 
 		 702 aa  127  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  25.17 
 
 		 772 aa  124  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  30.68 
 
 		 649 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  22.45 
 
 		 754 aa  117  7.999999999999999e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  20.83 
 
 		 940 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.72 
 
 		 732 aa  116  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 678 aa  112  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  25.72 
 
 		 721 aa  110  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.73 
 
 		 678 aa  108  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 669 aa  108  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  20.79 
 
 		 953 aa  106  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 669 aa  105  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  20.45 
 
 		 981 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  29.38 
 
 		 740 aa  102  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0549  hypothetical protein  23.85 
 
 		 767 aa  102  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.02 
 
 		 646 aa  99.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  20.14 
 
 		 981 aa  99.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  19.83 
 
 		 953 aa  98.2  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  19.72 
 
 		 953 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  21.1 
 
 		 721 aa  92.8  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  19.5 
 
 		 953 aa  91.3  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  22.55 
 
 		 721 aa  90.9  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  23.76 
 
 		 993 aa  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  23.76 
 
 		 993 aa  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.5 
 
 		 726 aa  87.8  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  19.86 
 
 		 941 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  19.86 
 
 		 941 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  19.86 
 
 		 941 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  29.41 
 
 		 954 aa  84.7  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  20.72 
 
 		 991 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  24.16 
 
 		 967 aa  84  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  28.26 
 
 		 823 aa  84.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  25 
 
 		 1002 aa  80.9  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  28.18 
 
 		 1068 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  24.78 
 
 		 718 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.31 
 
 		 876 aa  79.3  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  24.47 
 
 		 887 aa  79.3  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  23.66 
 
 		 718 aa  78.2  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.76 
 
 		 723 aa  77.8  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  25.44 
 
 		 720 aa  77.8  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.48 
 
 		 728 aa  77.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  27.91 
 
 		 1068 aa  76.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.71 
 
 		 718 aa  76.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  25.76 
 
 		 724 aa  75.5  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  29.17 
 
 		 705 aa  74.3  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  24.01 
 
 		 876 aa  73.6  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  27.02 
 
 		 717 aa  72.8  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0273  membrane protein-like protein  30.38 
 
 		 982 aa  71.6  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  28.79 
 
 		 737 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  27.23 
 
 		 958 aa  70.5  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2524  hypothetical protein  28.85 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  23.75 
 
 		 1040 aa  69.7  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>