More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0591 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  38.39 
 
 
1040 aa  739    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  36.47 
 
 
1054 aa  730    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  37.06 
 
 
1049 aa  720    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  100 
 
 
1109 aa  2204    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  98.74 
 
 
1109 aa  2177    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  33.92 
 
 
1038 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  33.93 
 
 
1041 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  34.31 
 
 
1041 aa  560  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  34.06 
 
 
1038 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  33.84 
 
 
1038 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  34.12 
 
 
1038 aa  554  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  34.03 
 
 
1038 aa  549  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  33.84 
 
 
888 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  31.25 
 
 
1026 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  27.55 
 
 
1068 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  29.99 
 
 
1002 aa  392  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2741  hypothetical protein  32.39 
 
 
810 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  29.29 
 
 
1246 aa  328  3e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  25.21 
 
 
998 aa  297  9e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  25.21 
 
 
998 aa  297  9e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  25.21 
 
 
998 aa  296  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  24.46 
 
 
1000 aa  295  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  23.76 
 
 
1001 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  22.88 
 
 
1077 aa  281  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  23.99 
 
 
1146 aa  279  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  22.96 
 
 
1002 aa  266  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  23.13 
 
 
1062 aa  265  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  23.13 
 
 
1062 aa  265  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  22.3 
 
 
1011 aa  256  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  22.44 
 
 
1022 aa  242  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  22.44 
 
 
1022 aa  242  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  23.08 
 
 
1013 aa  241  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  21.57 
 
 
1003 aa  236  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  21.92 
 
 
1089 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  21.96 
 
 
1013 aa  223  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  22.11 
 
 
1040 aa  215  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  21.89 
 
 
1028 aa  213  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  27.25 
 
 
981 aa  175  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  28.22 
 
 
974 aa  175  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  25.73 
 
 
974 aa  160  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  22.86 
 
 
967 aa  153  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  22.35 
 
 
958 aa  144  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  24.95 
 
 
945 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  24.95 
 
 
945 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  22.81 
 
 
968 aa  141  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  22.57 
 
 
968 aa  138  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  22.73 
 
 
963 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  21.83 
 
 
955 aa  135  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  21.83 
 
 
955 aa  135  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  21.83 
 
 
955 aa  135  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  23.67 
 
 
1001 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  23.83 
 
 
470 aa  134  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  21.51 
 
 
962 aa  132  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1710  MMPL domain protein  19.98 
 
 
1050 aa  131  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  20.5 
 
 
964 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  21.93 
 
 
941 aa  128  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  32.79 
 
 
743 aa  127  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  27.64 
 
 
948 aa  127  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  33.2 
 
 
743 aa  127  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  32.65 
 
 
743 aa  126  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  32.65 
 
 
743 aa  126  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  32.38 
 
 
743 aa  125  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  32.65 
 
 
743 aa  125  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  32.65 
 
 
743 aa  125  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  29.02 
 
 
944 aa  125  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  32.24 
 
 
743 aa  124  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2740  hypothetical protein  40.91 
 
 
165 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0054266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  32.38 
 
 
743 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  32.67 
 
 
743 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  35.44 
 
 
753 aa  122  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  23.14 
 
 
968 aa  122  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  23.14 
 
 
968 aa  122  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  22.18 
 
 
959 aa  122  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  23.14 
 
 
968 aa  122  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  22.43 
 
 
968 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  24.64 
 
 
741 aa  119  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  22.39 
 
 
968 aa  119  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  32.47 
 
 
750 aa  118  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1227  MMPL  21.41 
 
 
814 aa  118  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  30.83 
 
 
339 aa  117  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  28.19 
 
 
882 aa  116  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  33.48 
 
 
576 aa  115  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  25.33 
 
 
713 aa  114  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  19.9 
 
 
957 aa  112  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  23.66 
 
 
699 aa  111  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  37.97 
 
 
702 aa  110  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  31.02 
 
 
764 aa  110  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  22.43 
 
 
681 aa  110  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  27.78 
 
 
709 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  31.3 
 
 
775 aa  109  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  34.18 
 
 
737 aa  109  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  31.98 
 
 
702 aa  108  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  33.07 
 
 
727 aa  109  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.17 
 
 
697 aa  108  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  30.29 
 
 
699 aa  108  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  26.69 
 
 
397 aa  107  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  22.04 
 
 
740 aa  107  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  30.45 
 
 
780 aa  107  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  28.82 
 
 
730 aa  105  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  33.51 
 
 
733 aa  104  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>