More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0586 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  100 
 
 
778 aa  1520    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  31.04 
 
 
740 aa  270  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  30.25 
 
 
723 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  30.71 
 
 
730 aa  244  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  29.93 
 
 
747 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  30.43 
 
 
753 aa  228  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  28.72 
 
 
882 aa  221  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  30.1 
 
 
737 aa  215  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  29.23 
 
 
713 aa  213  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.33 
 
 
812 aa  210  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  31.78 
 
 
733 aa  209  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  31.21 
 
 
780 aa  207  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  26.96 
 
 
743 aa  207  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  26.96 
 
 
743 aa  207  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  29.64 
 
 
743 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  29.64 
 
 
743 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  31.02 
 
 
702 aa  205  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  30.05 
 
 
699 aa  204  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  29.84 
 
 
726 aa  204  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  29.96 
 
 
706 aa  203  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  30.83 
 
 
713 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  28.26 
 
 
719 aa  198  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  32.5 
 
 
727 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  29.86 
 
 
778 aa  194  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  31.59 
 
 
714 aa  191  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  29.18 
 
 
777 aa  189  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  31.11 
 
 
775 aa  187  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  31.15 
 
 
674 aa  182  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  31.15 
 
 
674 aa  182  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  30.98 
 
 
674 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  27.41 
 
 
712 aa  180  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  29.8 
 
 
764 aa  176  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  32.45 
 
 
714 aa  171  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  29.54 
 
 
713 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  25.41 
 
 
743 aa  157  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  38.82 
 
 
743 aa  154  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  27.51 
 
 
836 aa  153  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  38.4 
 
 
743 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  38.4 
 
 
743 aa  153  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  38.4 
 
 
743 aa  150  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  36.11 
 
 
743 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  38.18 
 
 
1077 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  34.29 
 
 
981 aa  149  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  35.59 
 
 
974 aa  149  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  35.43 
 
 
974 aa  148  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  45.5 
 
 
712 aa  147  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  44.02 
 
 
697 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  41.12 
 
 
1146 aa  146  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  26.55 
 
 
735 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  41.71 
 
 
750 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  27.84 
 
 
758 aa  145  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  25.16 
 
 
920 aa  144  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  30.82 
 
 
711 aa  142  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  42.08 
 
 
699 aa  141  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  41.18 
 
 
1062 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  41.18 
 
 
1062 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  44.28 
 
 
701 aa  138  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  43.11 
 
 
709 aa  137  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  25.61 
 
 
737 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  37.55 
 
 
743 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  42.79 
 
 
682 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  26.39 
 
 
796 aa  135  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  41.15 
 
 
699 aa  135  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  41.7 
 
 
745 aa  134  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  36.65 
 
 
998 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  36.65 
 
 
998 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  36.65 
 
 
998 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  40.49 
 
 
339 aa  133  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  43.5 
 
 
1089 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  43.14 
 
 
702 aa  131  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  40 
 
 
576 aa  130  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  22.89 
 
 
893 aa  130  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  42.62 
 
 
1001 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  24.95 
 
 
1049 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  34.82 
 
 
1000 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  27.77 
 
 
731 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  24.09 
 
 
1002 aa  127  6e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  27.69 
 
 
1068 aa  127  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  25.06 
 
 
737 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  41.67 
 
 
673 aa  126  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  43.05 
 
 
1002 aa  127  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  41.45 
 
 
686 aa  125  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  42.58 
 
 
700 aa  124  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  45.27 
 
 
1013 aa  124  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  26.35 
 
 
729 aa  123  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  26.66 
 
 
737 aa  121  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  34.54 
 
 
948 aa  122  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  27.15 
 
 
779 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  46.88 
 
 
762 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  38.95 
 
 
707 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  33.33 
 
 
941 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  27.08 
 
 
735 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  40.76 
 
 
679 aa  118  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  22.74 
 
 
944 aa  117  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  27.58 
 
 
945 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  27.58 
 
 
945 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  28.29 
 
 
1109 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  39.69 
 
 
708 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  26.23 
 
 
729 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2362  MMPL domain protein  29.37 
 
 
773 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0878397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>