More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  100 
 
 		 775 aa  1490    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  64.23 
 
 		 762 aa  681    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  53.3 
 
 		 780 aa  620  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  51.99 
 
 		 682 aa  604  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  47.56 
 
 		 753 aa  597  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  50.66 
 
 		 699 aa  595  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  48.12 
 
 		 737 aa  581  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  51.36 
 
 		 733 aa  568  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  47.43 
 
 		 702 aa  540  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  48.64 
 
 		 697 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  48.96 
 
 		 777 aa  512  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  47.12 
 
 		 714 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  46.71 
 
 		 702 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  49.07 
 
 		 764 aa  495  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  46.59 
 
 		 714 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  48.93 
 
 		 750 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  46.9 
 
 		 700 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  49.53 
 
 		 727 aa  464  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  45.86 
 
 		 778 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  43.72 
 
 		 699 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  44.61 
 
 		 713 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  43.79 
 
 		 745 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  42.28 
 
 		 706 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  45.74 
 
 		 701 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  40.79 
 
 		 699 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  38.59 
 
 		 730 aa  416  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  41.51 
 
 		 709 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  40.24 
 
 		 712 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  42.95 
 
 		 713 aa  375  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.42 
 
 		 812 aa  343  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  39.59 
 
 		 674 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  39.3 
 
 		 674 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  39.3 
 
 		 674 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  39.86 
 
 		 576 aa  331  4e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  40.93 
 
 		 679 aa  318  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  53.78 
 
 		 339 aa  306  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  37.6 
 
 		 704 aa  304  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  39.04 
 
 		 707 aa  296  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  37.95 
 
 		 678 aa  292  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  37.1 
 
 		 711 aa  290  8e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  38.78 
 
 		 686 aa  283  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  36.97 
 
 		 673 aa  274  6e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  51.84 
 
 		 358 aa  270  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  28.95 
 
 		 713 aa  265  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  38.78 
 
 		 708 aa  264  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  29.27 
 
 		 743 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  29.05 
 
 		 743 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  29.05 
 
 		 743 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  29.69 
 
 		 743 aa  248  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  33.19 
 
 		 712 aa  246  9e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  28.92 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  29 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  29.15 
 
 		 743 aa  244  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  29 
 
 		 743 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  29.01 
 
 		 743 aa  238  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  29.28 
 
 		 743 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  29.2 
 
 		 882 aa  196  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  30.25 
 
 		 747 aa  179  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  26.59 
 
 		 740 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  29.71 
 
 		 778 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  33.67 
 
 		 719 aa  174  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  28.23 
 
 		 726 aa  171  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  27.03 
 
 		 723 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  27.9 
 
 		 758 aa  159  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  29.97 
 
 		 741 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.22 
 
 		 717 aa  154  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  28.71 
 
 		 796 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.75 
 
 		 796 aa  146  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  29.8 
 
 		 732 aa  145  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  30.32 
 
 		 966 aa  144  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  28.46 
 
 		 738 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  37.78 
 
 		 1146 aa  142  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  30 
 
 		 978 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  30.6 
 
 		 968 aa  140  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  32.62 
 
 		 974 aa  140  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  28.8 
 
 		 731 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.59 
 
 		 740 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  31.35 
 
 		 731 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  23.31 
 
 		 704 aa  136  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  42.94 
 
 		 1077 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  26.45 
 
 		 836 aa  134  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  26.54 
 
 		 737 aa  134  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  25.51 
 
 		 997 aa  134  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  33.04 
 
 		 981 aa  134  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.6 
 
 		 983 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.6 
 
 		 983 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  27.29 
 
 		 718 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  28.87 
 
 		 734 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  27.68 
 
 		 740 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  31.03 
 
 		 979 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  27.68 
 
 		 743 aa  132  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  32.3 
 
 		 974 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  28.16 
 
 		 704 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  27.31 
 
 		 749 aa  130  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  36.41 
 
 		 959 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  30.72 
 
 		 738 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  26.89 
 
 		 741 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  42.05 
 
 		 1001 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  36.89 
 
 		 945 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  36.89 
 
 		 945 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>