More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4493 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  100 
 
 		 358 aa  699    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  63.44 
 
 		 682 aa  362  4e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  59.28 
 
 		 699 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  48.86 
 
 		 753 aa  317  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  48.86 
 
 		 737 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  49.25 
 
 		 733 aa  288  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  48.41 
 
 		 702 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  50.42 
 
 		 777 aa  265  8e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  48.81 
 
 		 697 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  46.93 
 
 		 713 aa  249  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  50.13 
 
 		 775 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  47.67 
 
 		 780 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  48.01 
 
 		 702 aa  235  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  50 
 
 		 714 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  45.11 
 
 		 745 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  47.2 
 
 		 700 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  43.41 
 
 		 706 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  44.48 
 
 		 699 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  47.65 
 
 		 727 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  42.77 
 
 		 709 aa  219  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  48.09 
 
 		 750 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  37.97 
 
 		 730 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  40.97 
 
 		 699 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  49.85 
 
 		 714 aa  209  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  48.87 
 
 		 762 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  45.23 
 
 		 778 aa  200  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  40.87 
 
 		 712 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  46.31 
 
 		 713 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.25 
 
 		 812 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  43.26 
 
 		 701 aa  182  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  46.97 
 
 		 764 aa  176  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  40.89 
 
 		 707 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  35.48 
 
 		 704 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  29.09 
 
 		 713 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0027  MMPL domain protein  37.97 
 
 		 352 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.232375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  42.52 
 
 		 576 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  28.25 
 
 		 981 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  36.05 
 
 		 674 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  36.93 
 
 		 678 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  36.05 
 
 		 674 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  36.05 
 
 		 674 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  39.02 
 
 		 679 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  39.74 
 
 		 708 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  28.16 
 
 		 974 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  30.82 
 
 		 712 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  39.48 
 
 		 686 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  38.53 
 
 		 673 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  26.44 
 
 		 974 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  34.17 
 
 		 778 aa  103  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  41.63 
 
 		 711 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  34.19 
 
 		 1002 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  36.27 
 
 		 743 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  36.27 
 
 		 743 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  36.27 
 
 		 743 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  36.27 
 
 		 743 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  35.75 
 
 		 743 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  35.75 
 
 		 743 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  35.75 
 
 		 743 aa  89.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  35.75 
 
 		 743 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  30.17 
 
 		 1146 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  32.09 
 
 		 726 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  27.89 
 
 		 957 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  35.23 
 
 		 743 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  26.74 
 
 		 959 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  29.73 
 
 		 1013 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  35.75 
 
 		 743 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  31.11 
 
 		 964 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  28.86 
 
 		 1089 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  27.95 
 
 		 968 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  32.91 
 
 		 747 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  28.66 
 
 		 719 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  27.6 
 
 		 1068 aa  84  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  29.96 
 
 		 962 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  26.22 
 
 		 944 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  25.61 
 
 		 967 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  27.38 
 
 		 882 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  24.32 
 
 		 1109 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  29.28 
 
 		 723 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  28.77 
 
 		 1001 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  27.39 
 
 		 968 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  24.32 
 
 		 1109 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  29.91 
 
 		 945 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  29.91 
 
 		 945 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  26.96 
 
 		 740 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  29.49 
 
 		 968 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  27.67 
 
 		 1022 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  29.49 
 
 		 968 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  27.67 
 
 		 1022 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  29.49 
 
 		 968 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  27.53 
 
 		 1011 aa  76.6  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  31.33 
 
 		 941 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  29.45 
 
 		 998 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  29.45 
 
 		 998 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  29.45 
 
 		 998 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  28.67 
 
 		 1000 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  27.27 
 
 		 751 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  29.96 
 
 		 787 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  26.61 
 
 		 1054 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  24.06 
 
 		 1049 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  26.27 
 
 		 1040 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>