More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1508 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 704 aa  1359    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  45.67 
 
 		 713 aa  478  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  43.28 
 
 		 699 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  41.04 
 
 		 753 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  43.15 
 
 		 745 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  41.6 
 
 		 712 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  43.34 
 
 		 699 aa  428  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  42.11 
 
 		 709 aa  426  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  39.26 
 
 		 730 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  40.11 
 
 		 737 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  41.86 
 
 		 699 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  41.03 
 
 		 706 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  44.38 
 
 		 701 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  42.92 
 
 		 682 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  42.26 
 
 		 702 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  43.16 
 
 		 714 aa  399  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  45.54 
 
 		 576 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.74 
 
 		 697 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  39.38 
 
 		 733 aa  369  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  41.31 
 
 		 778 aa  365  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  38.11 
 
 		 780 aa  365  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  42.02 
 
 		 750 aa  365  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.66 
 
 		 812 aa  362  9e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  41 
 
 		 700 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  40.55 
 
 		 764 aa  360  7e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  38.65 
 
 		 702 aa  356  5.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  38 
 
 		 775 aa  350  5e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  40.5 
 
 		 674 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  40.75 
 
 		 714 aa  343  7e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  32.87 
 
 		 743 aa  343  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  40.03 
 
 		 674 aa  342  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  40.03 
 
 		 674 aa  342  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  33.15 
 
 		 743 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  33.38 
 
 		 743 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  33.15 
 
 		 743 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  42.48 
 
 		 707 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  33.01 
 
 		 743 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  33.29 
 
 		 743 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  33.33 
 
 		 743 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  33.33 
 
 		 743 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  32.64 
 
 		 743 aa  333  8e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  41.61 
 
 		 727 aa  326  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  39.46 
 
 		 713 aa  324  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  33.1 
 
 		 743 aa  323  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  29.49 
 
 		 713 aa  320  7e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  40.22 
 
 		 762 aa  311  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  41.22 
 
 		 686 aa  303  7.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  40.19 
 
 		 679 aa  302  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  41.87 
 
 		 673 aa  301  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  41.13 
 
 		 708 aa  297  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  38.41 
 
 		 711 aa  295  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  40.51 
 
 		 678 aa  293  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  34.78 
 
 		 712 aa  292  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  45.7 
 
 		 339 aa  228  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  28.97 
 
 		 723 aa  213  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  28.74 
 
 		 882 aa  200  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  32.88 
 
 		 747 aa  197  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  30.88 
 
 		 726 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  29.02 
 
 		 719 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  35.76 
 
 		 358 aa  180  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  33.71 
 
 		 777 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  26.79 
 
 		 740 aa  167  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  27.26 
 
 		 717 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  33.54 
 
 		 724 aa  154  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.29 
 
 		 736 aa  151  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  25.4 
 
 		 758 aa  150  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  38.33 
 
 		 974 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  26.27 
 
 		 740 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  28.15 
 
 		 981 aa  148  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  27.48 
 
 		 974 aa  147  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  28.63 
 
 		 731 aa  144  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  27.21 
 
 		 726 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  26.21 
 
 		 737 aa  140  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  31.17 
 
 		 741 aa  140  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  28.26 
 
 		 781 aa  138  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  28.71 
 
 		 766 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  30.53 
 
 		 1000 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  25.82 
 
 		 920 aa  135  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  36.84 
 
 		 1146 aa  134  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.79 
 
 		 724 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  33.45 
 
 		 1077 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  32.54 
 
 		 1001 aa  132  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  29.12 
 
 		 1002 aa  130  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  31.9 
 
 		 998 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  31.9 
 
 		 998 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  31.9 
 
 		 998 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  26.46 
 
 		 836 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  28.14 
 
 		 718 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  24.2 
 
 		 743 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  24.44 
 
 		 1109 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  28.57 
 
 		 740 aa  126  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  24.2 
 
 		 1109 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  26.59 
 
 		 860 aa  125  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  29.75 
 
 		 723 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  30.45 
 
 		 723 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  26.08 
 
 		 1013 aa  122  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  27.62 
 
 		 842 aa  122  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  27.98 
 
 		 761 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  21.74 
 
 		 704 aa  121  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.16 
 
 		 746 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>