More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0347 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  55.73 
 
 
778 aa  645    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  100 
 
 
713 aa  1375    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  53.91 
 
 
702 aa  653    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  46.59 
 
 
745 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  46.46 
 
 
701 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  45.65 
 
 
714 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  42.51 
 
 
753 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  39.83 
 
 
730 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  43.5 
 
 
699 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  43.28 
 
 
682 aa  448  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  43.62 
 
 
713 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  42.17 
 
 
737 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  42.4 
 
 
699 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  44.03 
 
 
780 aa  436  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  41.51 
 
 
712 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  41.06 
 
 
699 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  45.84 
 
 
714 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  41.92 
 
 
706 aa  422  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  43.39 
 
 
733 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  43.21 
 
 
775 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  42.54 
 
 
764 aa  409  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  40 
 
 
709 aa  402  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  41.83 
 
 
777 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  39.42 
 
 
702 aa  390  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  42.9 
 
 
697 aa  389  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  43.51 
 
 
750 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  43.19 
 
 
762 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.07 
 
 
812 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  43.17 
 
 
727 aa  364  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  40.8 
 
 
576 aa  337  3.9999999999999995e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  41.28 
 
 
700 aa  334  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  37.5 
 
 
674 aa  296  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  38.63 
 
 
674 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  38.63 
 
 
674 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  37.45 
 
 
707 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  41.08 
 
 
679 aa  282  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  39.15 
 
 
704 aa  282  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  39.35 
 
 
678 aa  269  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  39 
 
 
708 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  29.02 
 
 
713 aa  265  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  48.99 
 
 
339 aa  259  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  37.83 
 
 
711 aa  256  9e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  31.33 
 
 
743 aa  249  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  31.19 
 
 
743 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  31.09 
 
 
743 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  33.06 
 
 
712 aa  242  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  30.36 
 
 
743 aa  243  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  30.74 
 
 
743 aa  242  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  30.91 
 
 
743 aa  242  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  30.91 
 
 
743 aa  242  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  38.96 
 
 
673 aa  242  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  30.74 
 
 
743 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  30.39 
 
 
743 aa  240  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  47.2 
 
 
358 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  31.05 
 
 
743 aa  230  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  30.93 
 
 
882 aa  206  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  27.36 
 
 
723 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  33.22 
 
 
747 aa  176  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  29.95 
 
 
778 aa  172  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  31.06 
 
 
726 aa  164  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  28.82 
 
 
740 aa  161  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  48.64 
 
 
686 aa  157  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  28.69 
 
 
719 aa  148  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  28.85 
 
 
717 aa  148  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  34.21 
 
 
974 aa  140  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  27.96 
 
 
758 aa  140  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  30.87 
 
 
724 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  27.48 
 
 
737 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  33.03 
 
 
974 aa  130  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  28.68 
 
 
741 aa  130  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  24.88 
 
 
997 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  50.34 
 
 
1013 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  32.57 
 
 
981 aa  128  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  28.97 
 
 
726 aa  127  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  28.23 
 
 
779 aa  126  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  29.13 
 
 
714 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  41.18 
 
 
1077 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  37.7 
 
 
1146 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  27.6 
 
 
836 aa  121  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  39.02 
 
 
945 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  39.02 
 
 
945 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  38.96 
 
 
1089 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  27.03 
 
 
732 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  47.65 
 
 
1003 aa  119  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  38.3 
 
 
998 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  38.3 
 
 
998 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  38.3 
 
 
998 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  38.3 
 
 
1001 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0027  MMPL domain protein  33.9 
 
 
352 aa  117  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.232375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  26.29 
 
 
920 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  29.87 
 
 
732 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  29.67 
 
 
751 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  27.69 
 
 
738 aa  114  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  28.87 
 
 
732 aa  114  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  43.62 
 
 
1062 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  43.62 
 
 
1062 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.34 
 
 
724 aa  114  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  36.7 
 
 
959 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  28.7 
 
 
832 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  33.49 
 
 
968 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>