More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3628 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  53.6 
 
 
733 aa  638    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  85.41 
 
 
753 aa  1191    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  100 
 
 
737 aa  1438    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  51.95 
 
 
699 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  54.22 
 
 
682 aa  618  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  49.17 
 
 
702 aa  618  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  51.59 
 
 
764 aa  581  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  49.58 
 
 
697 aa  545  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  49.93 
 
 
780 aa  541  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  48.31 
 
 
775 aa  537  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  48.85 
 
 
777 aa  528  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  47.91 
 
 
700 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  48.25 
 
 
714 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  46.05 
 
 
713 aa  499  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  44.24 
 
 
699 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  45.1 
 
 
702 aa  490  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  47.91 
 
 
762 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  47.3 
 
 
727 aa  488  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  48.17 
 
 
750 aa  487  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  43.06 
 
 
706 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  47.9 
 
 
714 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  44.22 
 
 
778 aa  445  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  43.39 
 
 
745 aa  439  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  43.22 
 
 
701 aa  437  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  40.3 
 
 
712 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  40.2 
 
 
709 aa  422  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  35.88 
 
 
730 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  39.83 
 
 
699 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.45 
 
 
812 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  41.18 
 
 
713 aa  382  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  39.18 
 
 
674 aa  356  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  39.18 
 
 
674 aa  356  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  39.02 
 
 
674 aa  354  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  42.17 
 
 
576 aa  348  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  39.72 
 
 
704 aa  344  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  56.77 
 
 
339 aa  332  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  38.21 
 
 
707 aa  323  8e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  39.05 
 
 
678 aa  319  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  38.84 
 
 
673 aa  313  9e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  38.79 
 
 
679 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  30.06 
 
 
713 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  50 
 
 
358 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  37.68 
 
 
686 aa  291  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  37.76 
 
 
711 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  37.87 
 
 
708 aa  276  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  33.18 
 
 
743 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  33.18 
 
 
743 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  32.65 
 
 
743 aa  259  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  32.06 
 
 
743 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  33.02 
 
 
743 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  32.86 
 
 
743 aa  253  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  32.86 
 
 
743 aa  253  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  32.86 
 
 
743 aa  253  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  31.5 
 
 
712 aa  251  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  32.33 
 
 
743 aa  250  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  33.18 
 
 
743 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  27.98 
 
 
723 aa  207  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  28.47 
 
 
740 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  29.88 
 
 
747 aa  194  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  30.1 
 
 
778 aa  188  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  27.84 
 
 
882 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  28.39 
 
 
726 aa  171  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  28.1 
 
 
719 aa  169  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  28.21 
 
 
717 aa  164  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  43.78 
 
 
974 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  38.89 
 
 
981 aa  154  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  36.59 
 
 
1146 aa  151  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  47.65 
 
 
1077 aa  151  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  41.28 
 
 
998 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  41.28 
 
 
998 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29 
 
 
736 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  41.28 
 
 
998 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  42 
 
 
1001 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  25.12 
 
 
997 aa  147  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  27.02 
 
 
758 aa  147  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  40.19 
 
 
974 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  41.28 
 
 
1000 aa  143  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  29.59 
 
 
726 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  27.71 
 
 
718 aa  140  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  26.71 
 
 
737 aa  140  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  32.73 
 
 
1040 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  26.62 
 
 
920 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  25.67 
 
 
740 aa  138  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  50.34 
 
 
1062 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  50.34 
 
 
1062 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  26.69 
 
 
796 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  33.92 
 
 
1054 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  31.48 
 
 
724 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  29.4 
 
 
766 aa  135  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  37.45 
 
 
1089 aa  135  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  35.71 
 
 
945 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  35.71 
 
 
945 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  25.73 
 
 
779 aa  134  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  25.44 
 
 
732 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.54 
 
 
740 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  27.39 
 
 
836 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  27.16 
 
 
741 aa  131  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  30.63 
 
 
723 aa  131  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  49.33 
 
 
1003 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  39.32 
 
 
1002 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>