More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2251 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  74.06 
 
 		 778 aa  926    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 702 aa  1390    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  53.5 
 
 		 713 aa  590  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  51.85 
 
 		 714 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  49.64 
 
 		 699 aa  560  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  50.93 
 
 		 682 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  48.22 
 
 		 713 aa  549  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  45.58 
 
 		 753 aa  529  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  49.06 
 
 		 701 aa  520  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  45.28 
 
 		 730 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  46.76 
 
 		 699 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  51.43 
 
 		 714 aa  510  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  45.3 
 
 		 737 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  45.77 
 
 		 706 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  47.59 
 
 		 780 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  47.46 
 
 		 733 aa  497  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  45.99 
 
 		 745 aa  490  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  44.05 
 
 		 702 aa  485  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  44.3 
 
 		 712 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  46.39 
 
 		 775 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  43.99 
 
 		 699 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  42.12 
 
 		 709 aa  479  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  46.33 
 
 		 697 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  46.1 
 
 		 750 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  45.26 
 
 		 777 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  44.17 
 
 		 764 aa  463  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  44.94 
 
 		 727 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.23 
 
 		 812 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  44.7 
 
 		 762 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  40.67 
 
 		 576 aa  363  8e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  38.29 
 
 		 674 aa  332  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  38.29 
 
 		 674 aa  332  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  38.14 
 
 		 674 aa  330  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  42.2 
 
 		 704 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  38.1 
 
 		 707 aa  317  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  51.83 
 
 		 339 aa  313  7.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  41.41 
 
 		 678 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  41.98 
 
 		 679 aa  308  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  38.82 
 
 		 673 aa  299  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  40.96 
 
 		 686 aa  298  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  37.89 
 
 		 708 aa  294  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  28.33 
 
 		 713 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  39.64 
 
 		 711 aa  283  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  48.01 
 
 		 358 aa  262  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  31.29 
 
 		 743 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  31.29 
 
 		 743 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  31.48 
 
 		 743 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  31.58 
 
 		 743 aa  248  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  31.16 
 
 		 743 aa  246  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  31.34 
 
 		 743 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  31.48 
 
 		 743 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  30.65 
 
 		 743 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  30.89 
 
 		 743 aa  242  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  31.34 
 
 		 743 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  58.19 
 
 		 700 aa  223  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  29.74 
 
 		 882 aa  204  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  29.18 
 
 		 740 aa  200  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  31.02 
 
 		 778 aa  192  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  29.53 
 
 		 747 aa  193  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  28.86 
 
 		 723 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  29.22 
 
 		 726 aa  183  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  28.69 
 
 		 719 aa  170  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  27.4 
 
 		 737 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  45.26 
 
 		 712 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  29.25 
 
 		 724 aa  153  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  33.21 
 
 		 974 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  25.36 
 
 		 758 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  27.94 
 
 		 717 aa  144  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  40.66 
 
 		 1146 aa  144  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  33.98 
 
 		 981 aa  143  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  41.33 
 
 		 1077 aa  142  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.67 
 
 		 746 aa  140  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.08 
 
 		 741 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  26.45 
 
 		 732 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  28.03 
 
 		 718 aa  138  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  26.94 
 
 		 836 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  36.53 
 
 		 974 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  28.16 
 
 		 714 aa  136  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  27.04 
 
 		 997 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  29.38 
 
 		 732 aa  135  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  27.27 
 
 		 779 aa  135  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  36.21 
 
 		 959 aa  134  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  36.48 
 
 		 945 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  36.48 
 
 		 945 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  27.34 
 
 		 729 aa  131  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  40 
 
 		 1003 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  25.78 
 
 		 729 aa  130  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  33.89 
 
 		 948 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  28.23 
 
 		 726 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  41.71 
 
 		 1001 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  41.92 
 
 		 998 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  41.92 
 
 		 998 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  34.5 
 
 		 941 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  41.92 
 
 		 998 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  35.34 
 
 		 944 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  33.89 
 
 		 955 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  24.41 
 
 		 829 aa  127  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  33.89 
 
 		 955 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  24.41 
 
 		 829 aa  127  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  33.89 
 
 		 955 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>