More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0519 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  100 
 
 
674 aa  1288    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  100 
 
 
674 aa  1288    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  78.69 
 
 
679 aa  850    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  99.41 
 
 
674 aa  1283    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  79.58 
 
 
678 aa  875    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  51.6 
 
 
711 aa  496  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  51.35 
 
 
576 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  50.46 
 
 
686 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  42.06 
 
 
745 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  45.11 
 
 
707 aa  429  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  43.24 
 
 
709 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  47.9 
 
 
673 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  42.07 
 
 
699 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  41.19 
 
 
699 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  42.26 
 
 
713 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  38.68 
 
 
737 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  37.88 
 
 
753 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  46.57 
 
 
708 aa  365  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  40.44 
 
 
682 aa  360  6e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  39.4 
 
 
712 aa  351  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  36.91 
 
 
730 aa  347  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  40.87 
 
 
701 aa  347  5e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  38.34 
 
 
699 aa  340  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  40.51 
 
 
714 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  38.5 
 
 
775 aa  335  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  37.39 
 
 
702 aa  330  5.0000000000000004e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  38.78 
 
 
778 aa  324  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  36.98 
 
 
706 aa  320  7.999999999999999e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  37.74 
 
 
702 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  38.73 
 
 
764 aa  318  3e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  39.6 
 
 
714 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  36.34 
 
 
733 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  37.02 
 
 
780 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.82 
 
 
812 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.9 
 
 
697 aa  306  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  38.32 
 
 
700 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  39.8 
 
 
727 aa  298  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  37.14 
 
 
750 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  29.86 
 
 
713 aa  279  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  36.38 
 
 
777 aa  278  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  36.26 
 
 
762 aa  277  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  37.59 
 
 
704 aa  273  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  36.72 
 
 
713 aa  265  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  30.5 
 
 
743 aa  257  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  31.66 
 
 
743 aa  256  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  30.81 
 
 
743 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  30.81 
 
 
743 aa  253  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  30.81 
 
 
743 aa  253  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  30.31 
 
 
743 aa  253  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  30.53 
 
 
743 aa  251  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  29.85 
 
 
743 aa  250  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  30.48 
 
 
743 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  34.36 
 
 
712 aa  246  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  30.81 
 
 
743 aa  241  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0027  MMPL domain protein  45.85 
 
 
352 aa  223  9e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.232375 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  28.13 
 
 
882 aa  207  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  33.28 
 
 
726 aa  207  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  32.59 
 
 
719 aa  204  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  29.43 
 
 
723 aa  204  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  30.28 
 
 
747 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  42.22 
 
 
339 aa  187  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  29.43 
 
 
836 aa  174  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  31.91 
 
 
778 aa  164  7e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  28.43 
 
 
740 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  28.99 
 
 
717 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  28.86 
 
 
752 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  26.66 
 
 
729 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  28.81 
 
 
726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.96 
 
 
724 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  32.09 
 
 
860 aa  146  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  29.01 
 
 
723 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.74 
 
 
736 aa  144  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  29.72 
 
 
724 aa  143  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  25.92 
 
 
758 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  25.69 
 
 
737 aa  143  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  31.44 
 
 
738 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  35.87 
 
 
358 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  27.08 
 
 
718 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  39.37 
 
 
1146 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  41.6 
 
 
1077 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  29.17 
 
 
842 aa  141  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  26.15 
 
 
740 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  27.88 
 
 
735 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  28.48 
 
 
978 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  29.23 
 
 
796 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  27.48 
 
 
737 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  28.87 
 
 
968 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  39.43 
 
 
1001 aa  137  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  29.29 
 
 
761 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  27.52 
 
 
983 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  27.52 
 
 
983 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  40.83 
 
 
998 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2167  RND superfamily drug efflux protein  30.21 
 
 
825 aa  135  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00341827 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  40.83 
 
 
998 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  27.52 
 
 
979 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  40.83 
 
 
998 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  34.08 
 
 
974 aa  134  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  29.04 
 
 
751 aa  133  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  27.81 
 
 
966 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  27.6 
 
 
832 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>