More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0269 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  100 
 
 		 700 aa  1321    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  52.9 
 
 		 699 aa  596  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  49.3 
 
 		 753 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  52.42 
 
 		 682 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  48.95 
 
 		 737 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  47.95 
 
 		 733 aa  520  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  48.85 
 
 		 697 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  46.65 
 
 		 702 aa  504  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  47.3 
 
 		 775 aa  505  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  48.18 
 
 		 777 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  49.3 
 
 		 750 aa  488  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  46.08 
 
 		 713 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  46.58 
 
 		 780 aa  473  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  48.42 
 
 		 714 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  49.93 
 
 		 727 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  45.49 
 
 		 702 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  46.4 
 
 		 701 aa  452  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  49.52 
 
 		 762 aa  445  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  43.79 
 
 		 745 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  43.93 
 
 		 699 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  40.52 
 
 		 730 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  45.36 
 
 		 764 aa  426  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  47.1 
 
 		 714 aa  422  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  41.78 
 
 		 712 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  41.98 
 
 		 709 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  42.28 
 
 		 706 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  40.87 
 
 		 699 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  42.75 
 
 		 778 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.8 
 
 		 812 aa  362  9e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  43.27 
 
 		 707 aa  360  4e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  42.4 
 
 		 576 aa  352  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  39.91 
 
 		 674 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  40.62 
 
 		 674 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  40.62 
 
 		 674 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  41 
 
 		 704 aa  330  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  41.4 
 
 		 713 aa  321  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  43.44 
 
 		 708 aa  319  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  41.12 
 
 		 678 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  39.65 
 
 		 711 aa  299  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  53.71 
 
 		 339 aa  297  4e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  42.4 
 
 		 686 aa  296  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  40.65 
 
 		 679 aa  293  9e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  42.59 
 
 		 673 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  28.73 
 
 		 713 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  48.06 
 
 		 358 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  31.29 
 
 		 743 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  30.93 
 
 		 743 aa  249  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  30.93 
 
 		 743 aa  249  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  31.06 
 
 		 743 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  31.06 
 
 		 743 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  32.95 
 
 		 712 aa  248  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  30.93 
 
 		 743 aa  247  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  30.82 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  30.79 
 
 		 743 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  30.01 
 
 		 743 aa  242  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  31.43 
 
 		 743 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  34.67 
 
 		 778 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  29.45 
 
 		 723 aa  200  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  29.6 
 
 		 740 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  29.99 
 
 		 747 aa  191  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  30.14 
 
 		 719 aa  187  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  28.48 
 
 		 882 aa  180  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  30.65 
 
 		 726 aa  170  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  32.02 
 
 		 717 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  41 
 
 		 1077 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  37.66 
 
 		 1146 aa  145  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  36.56 
 
 		 974 aa  144  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.18 
 
 		 718 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  31.98 
 
 		 704 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  25.97 
 
 		 740 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  42.73 
 
 		 1062 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.21 
 
 		 758 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.42 
 
 		 724 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  42.73 
 
 		 1062 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.49 
 
 		 736 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  36.56 
 
 		 981 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  29.6 
 
 		 836 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  35.34 
 
 		 974 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  30.02 
 
 		 723 aa  137  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  27.72 
 
 		 781 aa  137  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  44.33 
 
 		 998 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  44.33 
 
 		 998 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  44.33 
 
 		 998 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  42.86 
 
 		 1003 aa  135  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  40.72 
 
 		 1001 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  31.96 
 
 		 731 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  30.52 
 
 		 766 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.01 
 
 		 726 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  42.45 
 
 		 1000 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  38.78 
 
 		 959 aa  132  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2167  RND superfamily drug efflux protein  28.23 
 
 		 825 aa  130  7.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00341827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  51.28 
 
 		 1013 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  43.09 
 
 		 1002 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  35.86 
 
 		 955 aa  129  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  35.86 
 
 		 955 aa  129  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  35.86 
 
 		 955 aa  129  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  27.68 
 
 		 934 aa  128  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  27.55 
 
 		 710 aa  127  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  34.03 
 
 		 962 aa  126  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  31.29 
 
 		 741 aa  126  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>