More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2997 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  100 
 
 		 777 aa  1498    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  59.1 
 
 		 727 aa  654    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  47.97 
 
 		 753 aa  594  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  48.85 
 
 		 737 aa  591  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  48.6 
 
 		 682 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  47.64 
 
 		 733 aa  553  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  49.35 
 
 		 775 aa  548  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  46 
 
 		 780 aa  546  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  47.23 
 
 		 697 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  45.44 
 
 		 702 aa  509  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  45.17 
 
 		 764 aa  472  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  43.07 
 
 		 699 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  45.29 
 
 		 714 aa  469  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  42.23 
 
 		 706 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  48.76 
 
 		 762 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  45.28 
 
 		 714 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  42.47 
 
 		 778 aa  430  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  41.37 
 
 		 745 aa  428  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  42.42 
 
 		 701 aa  415  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  36.84 
 
 		 730 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  40.74 
 
 		 713 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  50.22 
 
 		 699 aa  361  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  39.14 
 
 		 707 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  37.17 
 
 		 674 aa  300  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  37.17 
 
 		 674 aa  300  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  36.89 
 
 		 674 aa  298  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  49.61 
 
 		 339 aa  295  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  51.96 
 
 		 358 aa  295  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  41.87 
 
 		 702 aa  290  5.0000000000000004e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  45.23 
 
 		 700 aa  282  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  61.8 
 
 		 750 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  27.72 
 
 		 713 aa  267  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  38.54 
 
 		 708 aa  267  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  36.9 
 
 		 679 aa  248  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  31.38 
 
 		 743 aa  247  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  38.65 
 
 		 713 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  31.49 
 
 		 743 aa  243  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  29.61 
 
 		 743 aa  243  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  31.8 
 
 		 743 aa  243  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  32.54 
 
 		 743 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  32.54 
 
 		 743 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  31.49 
 
 		 743 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  29.09 
 
 		 743 aa  236  9e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  37.44 
 
 		 709 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  28.2 
 
 		 743 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  31.8 
 
 		 743 aa  230  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  35.56 
 
 		 712 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  52.23 
 
 		 699 aa  213  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  29.53 
 
 		 778 aa  204  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  50.43 
 
 		 576 aa  204  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  27.99 
 
 		 882 aa  187  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.46 
 
 		 812 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  52.34 
 
 		 673 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  53.48 
 
 		 686 aa  174  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  26.09 
 
 		 740 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  46.47 
 
 		 678 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  27.2 
 
 		 747 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  39.47 
 
 		 974 aa  157  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  59.07 
 
 		 704 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  45.26 
 
 		 712 aa  153  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  25.85 
 
 		 723 aa  150  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  25.65 
 
 		 737 aa  148  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  38.14 
 
 		 1146 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  36.06 
 
 		 711 aa  144  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  44.19 
 
 		 1077 aa  144  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  24.46 
 
 		 997 aa  142  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  37.56 
 
 		 974 aa  142  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  40 
 
 		 981 aa  139  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  25.86 
 
 		 758 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  39.66 
 
 		 1001 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  39.67 
 
 		 998 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  39.67 
 
 		 998 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  39.67 
 
 		 998 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.5 
 
 		 796 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  36.33 
 
 		 1040 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  45.76 
 
 		 1089 aa  129  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  45.21 
 
 		 1000 aa  129  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  44.97 
 
 		 1062 aa  128  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  44.97 
 
 		 1062 aa  128  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  37.85 
 
 		 945 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  37.85 
 
 		 945 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  33.48 
 
 		 962 aa  124  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0027  MMPL domain protein  31.96 
 
 		 352 aa  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.232375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  38.53 
 
 		 1054 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  33.64 
 
 		 1109 aa  122  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  41.01 
 
 		 1002 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  32.26 
 
 		 948 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  29.25 
 
 		 741 aa  121  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  35.27 
 
 		 717 aa  121  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  35.65 
 
 		 1011 aa  120  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  33.85 
 
 		 959 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  35.18 
 
 		 397 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  32.72 
 
 		 1109 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  35.02 
 
 		 726 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  32.82 
 
 		 941 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  34.85 
 
 		 944 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  46.53 
 
 		 1013 aa  119  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  42.95 
 
 		 1003 aa  119  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  45.95 
 
 		 1013 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  33.2 
 
 		 860 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>