More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3174 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  48.38 
 
 		 998 aa  900    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  100 
 
 		 1062 aa  2140    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  40.2 
 
 		 1022 aa  709    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  49.1 
 
 		 1089 aa  989    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  49.7 
 
 		 1146 aa  999    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  39.9 
 
 		 1013 aa  646    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  48.38 
 
 		 998 aa  900    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  100 
 
 		 1062 aa  2140    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  40.2 
 
 		 1022 aa  709    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  48.54 
 
 		 1000 aa  927    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  39.46 
 
 		 1028 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  40.1 
 
 		 1003 aa  704    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  48.38 
 
 		 998 aa  901    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  92.02 
 
 		 1077 aa  1924    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  39.6 
 
 		 1040 aa  656    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  51.07 
 
 		 1002 aa  993    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  47.8 
 
 		 1001 aa  888    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  33.7 
 
 		 1013 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  31.57 
 
 		 1011 aa  477  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  29.54 
 
 		 967 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  29.98 
 
 		 968 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  30.14 
 
 		 968 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  28.47 
 
 		 962 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  29.59 
 
 		 968 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  29.45 
 
 		 959 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  29.59 
 
 		 968 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  29.59 
 
 		 968 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  30.46 
 
 		 964 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  30.59 
 
 		 955 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  30.59 
 
 		 955 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  29.52 
 
 		 941 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  30.59 
 
 		 955 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  29.26 
 
 		 948 aa  385  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  28.56 
 
 		 945 aa  386  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  28.56 
 
 		 945 aa  386  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  29.69 
 
 		 963 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  28.51 
 
 		 1001 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  28.67 
 
 		 944 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  29.07 
 
 		 945 aa  378  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  28.09 
 
 		 968 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  40.19 
 
 		 681 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  28.53 
 
 		 958 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  29.68 
 
 		 957 aa  363  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  27.81 
 
 		 968 aa  318  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  42.3 
 
 		 470 aa  307  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  23.13 
 
 		 1109 aa  295  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  22.94 
 
 		 1109 aa  293  9e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  24.81 
 
 		 1040 aa  272  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  25.38 
 
 		 1054 aa  264  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  25.6 
 
 		 1068 aa  250  9e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  23.1 
 
 		 1049 aa  243  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  24.11 
 
 		 1038 aa  207  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  25.89 
 
 		 1038 aa  193  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  25.63 
 
 		 888 aa  190  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  25.78 
 
 		 1038 aa  190  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  25.44 
 
 		 1041 aa  189  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1041 aa  188  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  24.7 
 
 		 1038 aa  184  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  25.44 
 
 		 1038 aa  184  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  37.62 
 
 		 397 aa  184  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  33.13 
 
 		 974 aa  167  8e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  33.74 
 
 		 981 aa  162  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  34.96 
 
 		 974 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  47.65 
 
 		 576 aa  146  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  34.15 
 
 		 740 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  20.45 
 
 		 1026 aa  142  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  50.67 
 
 		 753 aa  141  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  43.53 
 
 		 764 aa  140  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  27.22 
 
 		 723 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  31.43 
 
 		 713 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  40.34 
 
 		 709 aa  135  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  34.02 
 
 		 743 aa  135  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  35.19 
 
 		 743 aa  135  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  35.19 
 
 		 743 aa  135  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  35.19 
 
 		 743 aa  135  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  35.19 
 
 		 743 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  39.81 
 
 		 780 aa  134  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  33.33 
 
 		 882 aa  134  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  34.02 
 
 		 743 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  32.68 
 
 		 743 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  44.97 
 
 		 730 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  45.24 
 
 		 702 aa  132  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  35.59 
 
 		 750 aa  132  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  31.56 
 
 		 726 aa  131  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  50.64 
 
 		 737 aa  131  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  36.68 
 
 		 673 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  36.86 
 
 		 712 aa  130  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  34.33 
 
 		 743 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  45.39 
 
 		 699 aa  128  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  44.72 
 
 		 339 aa  128  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  34.02 
 
 		 743 aa  128  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  35.19 
 
 		 743 aa  128  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  45.33 
 
 		 733 aa  127  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  45.7 
 
 		 702 aa  127  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  46.36 
 
 		 699 aa  127  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  32.4 
 
 		 747 aa  127  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  42.73 
 
 		 700 aa  126  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  39.09 
 
 		 712 aa  126  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  48.67 
 
 		 674 aa  125  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  48.67 
 
 		 674 aa  125  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>