More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_6000 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  48.29 
 
 		 967 aa  947    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  46.69 
 
 		 959 aa  907    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  45.61 
 
 		 955 aa  853    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  46.7 
 
 		 968 aa  910    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  100 
 
 		 945 aa  1927    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 945 aa  1927    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  46.32 
 
 		 962 aa  884    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  47.75 
 
 		 968 aa  916    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  45.61 
 
 		 955 aa  853    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  48.03 
 
 		 948 aa  915    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  46.7 
 
 		 968 aa  910    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  45.87 
 
 		 968 aa  846    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  45.33 
 
 		 963 aa  853    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  46.9 
 
 		 964 aa  915    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  45.79 
 
 		 968 aa  869    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  48.7 
 
 		 941 aa  910    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  47.32 
 
 		 968 aa  921    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  45.8 
 
 		 944 aa  868    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  44.29 
 
 		 1001 aa  843    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  45.21 
 
 		 957 aa  826    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  45.61 
 
 		 955 aa  853    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  46.7 
 
 		 968 aa  910    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  45.55 
 
 		 958 aa  869    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  32.39 
 
 		 945 aa  475  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  31.34 
 
 		 1022 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  31.34 
 
 		 1022 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  32.14 
 
 		 1028 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  29.8 
 
 		 1003 aa  395  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  30.77 
 
 		 1040 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  28.72 
 
 		 1077 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  29.82 
 
 		 1013 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  27.92 
 
 		 1146 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  28.72 
 
 		 1002 aa  375  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  29.29 
 
 		 998 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  29.29 
 
 		 998 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  28.83 
 
 		 1000 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  29.29 
 
 		 998 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  29.16 
 
 		 1013 aa  360  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  28.51 
 
 		 1062 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  28.51 
 
 		 1062 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  50.86 
 
 		 397 aa  348  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  29.9 
 
 		 1001 aa  347  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  26.04 
 
 		 1089 aa  321  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  30.26 
 
 		 1011 aa  242  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  24.16 
 
 		 974 aa  237  8e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  33.2 
 
 		 681 aa  231  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  23.6 
 
 		 974 aa  228  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12956  transmembrane transport protein mmpL7  24.46 
 
 		 920 aa  187  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  30 
 
 		 470 aa  181  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  27.02 
 
 		 981 aa  146  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  25.16 
 
 		 1109 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  24.95 
 
 		 1109 aa  142  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.2 
 
 		 697 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  31.23 
 
 		 1038 aa  127  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1041 aa  127  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  31.23 
 
 		 1038 aa  127  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  41.4 
 
 		 745 aa  126  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  37.63 
 
 		 764 aa  125  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  31.23 
 
 		 888 aa  125  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  40 
 
 		 576 aa  124  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  36.14 
 
 		 750 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  30.43 
 
 		 1041 aa  122  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  36.48 
 
 		 702 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  34.84 
 
 		 780 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  31.62 
 
 		 1038 aa  122  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  31.23 
 
 		 1038 aa  120  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  31.23 
 
 		 1038 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  36.36 
 
 		 712 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  29.72 
 
 		 1068 aa  118  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  35.71 
 
 		 737 aa  117  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  22.34 
 
 		 1040 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  38.14 
 
 		 701 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  36.89 
 
 		 775 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  38.54 
 
 		 762 aa  115  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1002 aa  114  9e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  27.71 
 
 		 713 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  36.44 
 
 		 727 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  36.97 
 
 		 778 aa  113  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  37.75 
 
 		 673 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  36.65 
 
 		 699 aa  112  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  37.04 
 
 		 753 aa  112  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  33.04 
 
 		 709 aa  112  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  38.34 
 
 		 699 aa  111  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  25.84 
 
 		 1054 aa  112  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  38.66 
 
 		 713 aa  110  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  26.52 
 
 		 730 aa  110  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  38.22 
 
 		 682 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  26.64 
 
 		 1049 aa  108  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  33.97 
 
 		 714 aa  108  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  29.41 
 
 		 882 aa  107  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  35.75 
 
 		 702 aa  107  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  34.19 
 
 		 339 aa  106  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  32.09 
 
 		 740 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  30.89 
 
 		 747 aa  104  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  34 
 
 		 699 aa  104  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  35.48 
 
 		 733 aa  104  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  33.33 
 
 		 674 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  43.7 
 
 		 713 aa  103  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 674 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 674 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>